python 相关系数

我介绍一下python常见的两种相关系统的算法：1）pearsonr（皮尔松相关系数）；2）mine（互信息）

1）皮尔松相关系数主要描述变量之间线性相关性，下面是python的实现库

from scipy.stats import pearsonr

需要注意的是pearsonr()的输入数据可以是两个维度（200,1）

2）互信息可以描述任意变量之间的相关性（线性或者非先线性）,下面是python的实现库

from minepy import MINE

需要注意的是pearsonr()的输入数据只能是一维度，比如（200，）

def print_stats(mine):

print "MIC", mine.mic()

print "MAS", mine.mas()

print "MEV", mine.mev()

print "MCN (eps=0)", mine.mcn(0)

print "MCN (eps=1-MIC)", mine.mcn_general()

print "GMIC", mine.gmic()

print "TIC", mine.tic()

x = np.linspace(0, 1, 1000)

y = np.sin(10 * np.pi * x) + x

mine = MINE(alpha=0.6, c=15, est="mic_approx")

mine.compute_score(x, y)