在ms软件中切100面

      这是我在的第一篇文章，这个APP以后就用来作为我记录模拟计算的一个地方。。。

      第一次发文章打算写一篇关于如何在materials studio软件中构建晶体结构，以及按照相应的晶面指数切出晶面，固定晶体结构中的一部分原子，并且利用武汉大学赵老师制作的脚本文件很快的给出晶体结构在vasp环境下需要的POSCAR文件。

本文以W元素为例，在这里切出W晶体的(100）晶面，并创建2✖2的超晶胞，之后还要固定该超晶胞的底层原子，然后给出POSCAR文件。

1.首先我们需要一个W的晶体结构，在这里你可以选择在materials studio软件中自己动手制作，或者选择在网上下载一个W的晶体结构，在这里我选择了后者。推荐一个专业的网站：http://aflowlib.org，可以用来寻找你所需要的晶体结构。

在搜索栏输入你所需要的晶体结构的类型

我们在下面的图中，选择W1。

从该网站提供的信息中可以直接看到晶体结构的3D模型

W的3D模型

我们需要的是W的晶体结构的POSCAR文件，在网页的RELAXED STRUCTURE部分。

红字所示部分即为W的POSCAR文件

      下载该文件，下载以后先必须利用VESTA软件将该文件的格式从.vasp转换为.cif，目的在于可以在materials studio软件中使用。利用VESTA中的Export Data按钮，将文件转换成.cif格式。之后将转换好的.cif格式文件直接拖入MS（materials studio）软件中。

W的晶体结构

2.接下来我们的任务是切出（100）晶面。

首先在build>crystals>rebuild crystals下，建立晶胞，为了消除对称性的影响，选择P1。

W的crystals

其次，切出（100）晶面，在build>surfaces>cleave surface下，cleave plane选择（100），Thickness的Fractional选择2.0。

W的（100)面

再次，建立超晶胞。在build>symmetry>super cell选择2✖2的超晶胞。

W的超晶胞

    最后，我们还需要设置真空层，目的在与消除周期性的影响。在build>crystals>build vacuum slab。

加了真空层的W

3.固定底层原子，利用脚本文件导出需要的POSCAR文件。

a.在MS软件中将脚本文件拖入。注意，在脚本文件中，要将第13行中的$filename后面""中的文件名改为你所建立的文件名，比如“ex (1 0 0 )”。

脚本文件

修改filename后的脚本文件

b.固定底层原子，在modify>constraints下fix住所选择的原子。（可根据你的需要选择固定X\Y\Z方向）

c.运行该脚本文件，生成POSCAR.txt文件。

生成的POSCAR文件

4.可直接将生成的文件用文本编译器保存为POSCAR。