零基础练习一个RNA-seq分析】CH0：准备一个云服务器

写在最前面

大概也是受到了【时代灰尘】的重压，原来的实验计划全盘打乱，本来计划利用疫情期间要写完的综述看起来也要虎头蛇尾了。在经历了一个惨淡的保研申请季后，决定重新把精力放到自己的课题上来，一方面听从老板的建议，充实一下自己保研答辩的PPT，另一方面也是冲淡一下夏令营带来的挫败感。作为一个计算机小白，从搭建一个云服务器开始，学习Linux，跟着@Y大宽 姐姐和@徐洲更hoptop哥哥的慢慢摸索。到今天完成了几个简单的visualization，决定一边继续探索，一边写点东西权当一个总结，如果能帮到一些人那我就更高兴了。

致谢/参考资料

1.@徐洲更hoptop哥哥的b站教程大概是我的启蒙老师了，这里介绍了一些生信软件最基础的知识：https://www.bilibili.com/video/BV1JJ411p7fX

2.Jimmy大神讲课逻辑有点跳，不过在这个时代能够手把手教你做一件事情的人真的不多啦：https://www.bilibili.com/video/BV12s41137HY

3.@Y大宽姐姐的教程https://www.jianshu.com/p/e8cd62ba14fe以及@徐洲更hoptop的转录组入门系列大概是我主要复制代码的地方了，跪谢。

4.作为一个自闭男孩，虽然周围的哥们儿一水的生信带师，本着万事不求人和你永不独行的原则，遇事不决先百度（我用的being）是解决报错和一些细节问题的好工具。

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配置一个服务器

为啥要配置一个云服务器

学习生信数据处理，Linux系统是首先需要面对的必修课。但是对于我这个习惯了Windows的小白来说，面对黑白屏的Linux有一种天生的恐惧，再加上要是直接在电脑上配置虚拟机的话，一个不当操作导致电脑崩了我可没法解决。所以对于新手来说，还是在云端构建一个可以随意折腾的云服务器吧，遇到解决不了的问题大不了一键重装就好了。又想着刚好手头有将近1w的大创经费，也不用太担心钱的问题。

如何选择配置

生信技能树公众号最近分享了一篇很详细的文章来讲这件事，可以说是干货满满。下面来说说我自己的。https://mp.weixin.qq.com/s/iWV0CGRAUWQF-xcaFhwWww，这篇推文也是这部分内容的主要参考。

每家云服务器公司都有自己的免费试用套餐，我在阿里云选了个最低配的开始上路，事实上在做alignment之前1核2G的配置是完全够用的，之后调整配置也挺方便。关于磁盘的话，先整一个默认的系统盘吧，后面处理数据的时候再挂一个大点的临时数据盘。

我目前的配置

磁盘情况

配置一个云服务器

开始正文啦

0.首先当然是在阿里云的主页找到云服务器，免费试用一定很显眼啦，选一个适合自己的，开始按要求注册，配置，建议下一个阿里云的app方便管理。

1.接下来就可以在控制台看到你的服务器了，点一下圈出来的链接就进入管理界面了。

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2.那么如何访问服务器呢，我们需要下载一个XShell

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4.阿里云网站提供了特别详细的教程https://developer.aliyun.com/article/700482，跟着操作就可以用XShell连接到你的服务器了。

配置一个云盘

系统盘通常用来存放一些软件和参考基因啥的，要处理数据的话显然另外买一个数据盘划算，一个项目做完就可以丢掉。

PS：这部分可以等到你需要下数据之后再看，写在这里只是为了思路连贯

1.进入磁盘管理界面，开始创建一个磁

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2.可以直接把它挂载到我们的服务器上，选择按量付费，这样方便不用的时候提前卸载（需要提前充点钱）。当你回到云盘管理界面看到【使用中】的时候就可以啦

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3.下面在xShell上挂载这个云盘，首先用下面的代码完成分区和挂载

fdisk /dev/vdb #之后依次输入以下命令进行磁盘的分区和挂载

n

p

1

enter #即回车键

enter #即回车键

w

mkdir /data/ #创建挂载目录

mkfs -t ext3 /dev/vdb1 #对该盘进行格式化

mount /dev/vdb1 /data/ #将该盘挂载到/data/目录下,如果哪天发现这盘没了，也只需要用这行命令重新挂载一下就成

这时候我们再用代码

df -lh

就能看到磁盘已经被挂载上了

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如果不用了，就用代码

umount /dev/vdb1 /data/

卸载之后，在阿里云的云盘管理界面进行卸载，但卸载不能使云盘停止收费，如果要停止收费，则需要释放云盘。

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PS：最后推荐安装一个叫【xFTP】的软件，这是一个可视化的文件传输软件，方便我们在自己的电脑和云服务器之间进行文件传输的沟通。

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到这里我们就完成了云服务器的构建，并且挂了一个数据盘，那么我们就可以开始探索Linux啦