喜讯!Cancer Res(IF:11.2)发表胃癌PICH的转录调控机制

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2023年8月30日,兰州大学第二医院焦作义教授团队在肿瘤学Top期刊Cancer Research(IF:11.2)发表“PICH activates Cyclin A1 transcription to drive S-phase progression and chemoresistance in gastric cancer”的研究论文。该研究鉴定了SNF2蛋白PICH作为5-FU化学敏感性的预测因子,并且评估了PICH的转录功能。PICH以ATP酶依赖的方式与Pol II和ATF4结合,形成一个转录复合物,促进Cyclin A1的表达,加速s期进展,并损害胃癌中5-FU的化学敏感性。爱基百客为其提供ChIP-seq的技术支持

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图:一个描述PICH介导的Cyclin A1转录潜在机制的模型

为了确定PICH的转录功能,作者在AGS细胞中对PICH进行了ChIP测序(ChIP-seq),鉴定出34021个启动子的高可信度峰(p<0.05)。PICH峰在TSS附近有480个高度富集,其中4.27%的峰富集在基因启动子区域。GO分析显示PICH结合的启动子主要富集在Pol II调控转录、有丝分裂姐妹染色单体粘合和细胞周期调控。这些结果表明,PICH可能在Pol II介导的细胞周期调节因子转录中发挥作用。基于HOMER分析和IGV可视化结果都表明了PICH在调控Cyclin A1转录中的潜在作用。

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图:ChIP-seq分析

DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-23-1331

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