公元697年
三月王孝杰、苏宏晖等领兵十七万与契丹战于东硖石谷，唐军大败，王孝杰战死。部队损耗殆尽。契丹人乘胜侵扰幽州，攻陷城池，劫掠官吏和百姓，武攸宜派部将攻击他们，不能取胜。
四月十八日，武后派武懿宗何迦密进攻契丹，五月初八又命娄师德沙吒忠义，领兵二十万进攻契丹。
六月监察御史李昭德被诬告谋反，来俊臣和武氏诸王以及太平公主有间隙，来俊臣被告谋反，初三李昭德、来俊臣一同在闹市被处死并暴尸，当时人无不痛惜李昭德，而为处死来俊臣拍手称快。顷刻之间，仇家争相剥皮吃肉，来俊臣尸骨展转践踏成泥。武后下诏诛灭其族，抄没家产，官吏和百姓在路上相见时都互相庆贺说，自今眠者背始帖席矣！
来俊臣还掌权的时候，每次铨选，吏部受他嘱托越级授官的有数百人。来俊臣垮台后，侍郎都向朝廷自首。太后责备他们，他们说：“我们辜负陛下，该当死罪！但我们扰乱国家法度，只加罪于自身；我们如果违抗来俊臣的意旨，立即灭族。”太后于是赦免他们。
武懿宗领军至赵州，害怕南逃。退守相州，丢弃军用物资和武器很多。契丹于是在赵州城进行大屠杀。
契丹为了防止突厥偷袭背后，派人出使突厥稳定局势，结果被识破，突厥攻陷契丹新城，全部俘虏该城的契丹人。
契丹军中惶恐，纷纷背叛，主帅孙万荣被家奴斩首，剩余部众都向突厥投降（当初反叛是因为唐对契丹礼遇太差，并轻视寡薄）。契丹被平定。
七月武承嗣、武三思一起罢除相职。
武懿宗追究当时顺从的百姓请求全部处死，被大臣们驳斥。
十月朝廷任命幽州都督狄仁杰为鸾台侍郎，司刑卿杜景俭为凤阁侍郎，一并任同平章事。
公元698年
武承嗣、武三思谋求充当太子。狄仁杰多次劝谏，其他大臣也劝谏不可。一日武后梦见，大鹦鹉两翼折断问狄仁杰何意，狄仁杰说，武即是您的姓，双翼是您的两个儿子，陛下若是起用两个儿子，则双翼便振作起来了。武后从此放弃了立侄子为太子的心思。
六月，武后让武延秀（武承嗣儿子）去娶突厥人阿史那默啜的女儿为王妃，张柬之劝谏，武后不从，把他外调，送去的彩礼很厚重，武延秀被突厥扣押，突厥以复立李氏皇族为名侵犯大唐。
八月十一日武承嗣病死。
朝廷派几十万部队进攻突厥。
皇嗣坚持请求让位于庐陵王，太后同意。九月十五日，立李哲为皇太子。
十七日，任命太子为元帅讨伐突厥。命狄仁杰为副元帅，宋元爽为长史，崔献为司马，吉顼为监军使。副元帅先行，太后亲自为其送行。
二十六日，突厥抢完走了，杜仁杰领兵十万追击，追不上。被侵扰的百姓惶乱，狄仁杰上书陈述厉害，武后同意安慰的政策，黄河以北于是安定下来。
公元699年
二月初七，武后得病。之后病情好转。
二月十八日武后命令太子、相王、太平公主和武攸暨等拟定互不伤害的誓词，在明堂向天地立誓，并将誓词铭刻在铁契上，收藏于史馆中。
公元700年
四月二十九日太后前往三阳宫避暑，有胡僧邀请太后参观埋葬佛舍利，太后答应。出发时狄仁杰跪在武后马前劝谏，武后中途返回说，这是为了成全我们的正直之臣的正气。
太后指派洪州和尚胡超配制长生不老药，三年而成，耗费资财数以亿计。太后服用后，病稍好转。
契丹将领李楷固，骆务整勇猛无比，失败之后投降唐军，狄仁杰为二人说情赦免，亲属家人劝其不要这样做，狄仁杰说，如果有利于国家，难道还要为自己打算，武后采纳赦免，他又请求授给他们官职，太后任命李楷固为左玉钤卫将军，骆务整为右武威卫将军，派他们领兵进击契丹余党，契丹全部平定。
下面是二则故事分享，摘自《资治通鉴·唐纪二十二》
故事一
右司郎中冯翊人乔知之有美妾名叫碧玉，乔知之因为有了她而不结婚。武承嗣借她来教诸姬妾，便留下她不让回去。乔知之写作《绿珠怨》送给她，她于是投井自杀。武承嗣从她裙带中搜得《绿珠怨》，大怒，示意酷吏罗织罪名上告，将乔知之灭族。
故事二
娄师德在河陇，前后四十多年，谦恭勤奋，毫不懈怠，百姓和夷族都安定。他秉性朴实稳重，宽洪大量，狄仁杰入朝任宰相，实际上是他推荐的；而狄仁杰不知道，心里很轻视娄师德，一再排挤他到外地。太后发觉后，曾问狄仁杰：“娄师德有道德才能吗？”回答说：“作为将领能谨慎守卫边疆，是否有道德才能我不知道。”太后又说：“娄师德善于识别人才吗？”回答说：“我曾经与他同事，没有听说他善于识别人才。”太后说：“朕所以知道你，便是由于娄师德的推荐，他也可以称得上是善于识别人才了。”狄仁杰退出后，感叹说：“娄公有盛德，我受到他的包涵宽容已经很久了，我看不到他盛德的边际。”当时罗织罪名的风气很盛，娄师德长期担任将领和宰相，却能以功成名就告终，人们因此敬重他。
此纪讲述了唐朝酷吏制度随着来俊臣尸骨无存也落下帷幕，此时外患突厥也好契丹也罢，武则天都用狄仁杰去解决，也说明了她对这个臣子的信任，另外也说明了武后知人善任，并没有把忠良正直品行高尚的臣子，统统抹去成为政治的牺牲品，另外武则天虽然此时年近八十，但是仍然精力旺盛，把持朝政大权，心如明镜，另一方面豢养男宠，酒宴饮乐也不落下，可见身体好才能享受你所能享受的，再次强调了身体健康的重要作用。
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