常用环境整理-集群环境搭建之MPI

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前言

在Centos7下搭建mpi环境，走了很多弯路，现在整理出一套醉简便的方法，分享给大家，希望可以帮助到需要的人

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提示：以下是本篇文章正文内容

一、准备工作

1、安装虚拟机（VMware）

2、安装CentOS7

3、安装必要的软件

sudo yum install nano
sudo yum install net-tools
sudo yum install gcc
sudo yum install gcc-c++
sudo yum install gcc-gfortran

更新yum库

yum update

下载相关依赖包

yum install wget -y
yum install gcc gcc-c++ gcc-fortran kernel-devel -y

二、关闭防火墙

CentOS7版本后防火墙默认使用firewalld，因此在CentOS7中关闭防火墙使用以下命令：

1、接关闭防火墙

$ sudo systemctl stop firewalld.service

2、禁止firewall开机启动

$ sudo systemctl disable firewalld.service

3、关闭SELinux命令（永久关闭）

$ sudo nano /etc/selinux/config
注释下面两行：
#SELINUX=enforcing
SELINUX=disabled
#SELINUXTYPE=targeted
设置后需要重启才能生效。
$ sudo reboot -f

4、查看防火墙状态：

$ /usr/sbin/sestatus

三、搭建集群

/这里以两台机器组成一个集群为例

1、首先克隆一台上述配置好的CentOS系统

2、为每台机器配置静态IP地址：

• 设置IP 网关 DNS
  查看获取的IP地址：$ ip addr
  若没分配IP地址-（输入命令dhclient，让CentOS 7自动获取一个IP地址： $ dhclient）
• 所有相关的文件都位于目录/etc/sysconfig/network-scripts/下
• 打开配置文件：

$ sudo nano /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-ens33

保存并关闭文件。

• 重启网络服务：

$ sudo systemctl restart network.service

3、每台机器的主机名(hostname)改为唯一: Node1,Node2

修改机器名称：
第一台机器的机器名为Node1
第二台机器的机器名为Node2

在每台机器的终端窗口中，执行命令：

$ sudo nano /etc/sysconfig/network

分别修改文件中的HOSTNAME为Node1和Node2

4、设置每台机器的IP与主机名的对应关系

在/etc/hosts文件中存放的是域名与IP的对应关系;
$ sudo nano /etc/hosts
192.168.190.145 Node1
192.168.190.146 Node2
注：请将原文件最上面的第二行127.0.1.1 删除掉或者原内容全部删除(每台机器都要做)

四、免密登录

假设两台机器分别为Node1，Node2

1、进入ssh目录

在Node1机器上，进入~/.ssh目录，输入命令：ssh-keygen -t rsa，然后连续四下回车

在Node2上重复上述操作

2、修改权限

要想让这两台机器无密码登录，需要更改一下必要的文件的权限（所有节点都要更改）：其实只要保证authorized_keys的文件权限为600或者644

$ chmod 755 ~
$ chmod 755 ~/.ssh
$ chmod 600 ~/.ssh/authorized_keys
$ chmod 600 ~/.ssh/id_rsa
$ chmod 644 ~/.ssh/id_rsa.pub

3、配置ssh

在node01机器上输入命令

ssh-copy-id -i Node1

然后输入对应密码，再输入

ssh-copy-id -i Node2

在Node2机器上重复上述操作，输入命令：ssh-copy-id -i Node1，然后输入对应密码，再输入：ssh-copy-id -i Node2

4、测试

分别在Node1和Node2上执行如下命令

$ ssh Node2
$ ssh Node1

这时会发现不需要输入密码，直接就ssh连接上了这两台机器。

五、安装MPICH

1.下载安装包并解压

cd /
mkdir software
cd /software
wget http://www.mpich.org/static/downloads/3.4.1/mpich-3.4.1.tar.gz
tar -zxvf mpich-3.4.1.tar.gz

2.新建下载目录

cd /
mkdir mpich-install

3.进入目录并编译安装

cd /software/mpich-3.4.1
./configure --prefix=/mpich-install --with-device=ch4:ofi 2>&1 | tee c.txt

------------ps:下边两步要运行很久，可以泡杯咖啡休息等待哦-----------

make   

make install

4.编辑环境变量

vim ~/.bashrc

在最底层添加：

export MPICH=/mpich-install
export PATH=$MPICH/bin:$PATH

并：wq保存配置退出vim
令环境变量生效

source ~/.bashrc

5.检查安装情况

mpirun-version

返回mpich-3.4.1则安装成功