hpc安装cell2location Python中pip如何安装github上的一个包 pip install -i douban.com tsinghua.edu.cn

conda create -y -n cell2loc_env python=3.9
conda activate cell2loc_env


pip install cell2location -i  https://pypi.douban.com/simple/


pip install cell2location -i  https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple

Simple Index

文章目录
前言
安装
结尾
前言
先说几个问题：

并不是github上面的每一个项目都能叫做一个包，一般来说，包的标识：项目的目录下有setup.py文件。
为什么不直接pip install 包名？反而要提到github。这是因为有的包可能是个人开发的，过于小众，没有被收录到python的官方源中，所以pip install 包名根本找不到这个包。
安装
先以linux为例：

1.进入github项目，点击绿色按钮Code，找到链接。

然后：

git clone 链接
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说白了就是先下载到本地来，所以，你如果有其他什么方法下载也行，不一定要像我这样git clone。

注意，这里下载的时候可能会出错，因为github网速在国内不稳定，我这边访问github一般是过一会可以，过一会又不可以。

总之，你自己先下载到本地，然后看到上面有了一个目录。

torchsearchsorted
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可以直接cd进去。

2.安装
cd进去之后，我们看到有那个setup.py文件。

pip install . #注意这个.
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补充，也有人说，下面这个也可以。

pip install -e . #注意这个.
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区别可以见：https://blog.csdn.net/qq_33583069/article/details/123340335。
我的理解是，前者安装的话，这个目录就可以删除了，因为其安装到了别的地方，后者安装的话，这个目录不能删，并且你可以改动这个目录里面的代码，程序运行时也会随之改变。

结尾
windows怎么办？道理一样的。都是下载，然后windows也有命令行，进入那个目录，然后pip install。
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