Smart-seq3 || 用改进的单细胞测序绘制细胞类型的高分辨率图谱

单细胞RNA测序(scRNA-seq)已经彻底改变了生物和组织中细胞类型及其基因表达程序的特性。虽然细胞通量有了很大的提高，但这些方法通常存在低灵敏度和定量的问题，且仅限于短RNA片段。现在，卡罗林斯卡学院的研究人员发布了Smart-seq3，它极大地提高了scRNA-seq的质量。这项研究发表在《自然生物技术》上。

Single-cell RNA counting at allele and isoform resolution using Smart-seq3

Smart-seq是生成单细胞RNA测序数据的最流行的方法之一。由于其高灵敏度和覆盖RNA转录本的能力，已被广泛使用。卡罗林斯卡学院的科学家们现在已经发布了Smart-seq3，这是一种对目前流行的Smart-seq单细胞检测方法进行了高度改进的迭代，具有显著提高的灵敏度(这意味着他们对细胞裂解前存在的所有rna进行了更大比例的测序)。重要的是，Smart-seq3还以5'端分子计数的新方法为特色，同时保留了完整的转录本覆盖率，这使得计算重建已计数的RNA序列成为可能。拥有转录本的完整RNA序列可以揭示RNA是如何被处理的(例如，通过编码部分的选择性剪接)，以及RNA是由母亲还是父亲的基因复制(等位基因)产生的。

Smart-seq 建库区别： https://teichlab.github.io/scg_lib_structs/methods_html/SMART-seq_family.html

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https://phys.org/news/2020-05-high-resolution-cell-single-cell-sequencing.html
https://www.nature.com/articles/s41587-020-0497-0