matlab中ct值直方图,【CT值与灰度值的总结】

概述

首先， 我们要理解， CT值和灰度值这两者根本就不是同一个东西， 不要被一些网络上的文章所误解。

接下来， 就要看你具体是要处理哪种格式的文件了， 是DICOM 还是 NIFTI ； 文件格式不同 ， 用来做解析的Python 库也就不同，

譬如，要处理DICOM类型的数据， 一般会用 simpleitk, pydicom 库 ；

而 NIFTI类型的数据更多使用 Nibabel 库， 或者是 simpleitk 也是可以的。

https://blog.csdn.net/normol/article/details/88313888

其实无论对于dcm还是nii格式的图片，只要是ct图，就都可以选择将储存的原始数据转化为Hu值，因为Hu值即代表了物体真正的密度。

对于nii格式的图片，经过测试，nibabel, simpleitk常用的api接口，都会自动的进行上述转化过程，即取出来的值已经是Hu了。

(除非专门用nib.load('xx').dataobj.get_unscaled()或者itk.ReadImage('xx').GetPixel(x,y,z)才能取得原始数据)

对于dcm格式的图片，经过测试，simpleitk, pydicom常用的api接口都不会将原始数据自动转化为Hu！！(itk snap软件读入dcm或nii都不会对数据进行scale操作)

下面就以我使用的 NIFTI 格式的文件以及 Nibabel 库为例：

01 CT值(HU值)矩阵的获取

使用 nibabel 自带的 load函数读取