技术方法-谱系追踪_Cell Stem Cell

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序号：2020-132

编者按：

PolyloxExpress条形码为研究造血干细胞的命运决定机制提供了新的方向和研究手段，并有望被广泛用于其他领域的细胞命运和谱系研究。

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通过PolyloxExpress条形码解析造血干细胞克隆的命运和单细胞转录组学

【文献类别】技术方法-谱系追踪

【发表期刊】Cell Stem Cell

【影响因子】 20.9

【发表时间】2020-08-05

【PMID】32783885

【文章摘要】谱系追踪揭示了造血干细胞（HSC）的命运，而单细胞RNA测序只能识别HSC转录组的快照。为了在同一细胞中获得关于命运和转录组信息，研究人员开发了PolyloxExpress等位基因，可实现依靠Cre重组酶进行的RNA原位编码。将细胞命运与单个HSC转录组联系起来可提供鉴定HSC命运的转录组特征所需的信息，而这在单独的单个HSC转录组中并不明显。研究人员发现分化不活跃，多谱系和谱系限制的HSC克隆各处于造血过程的转录图谱的不同区域。他们还发现分化不活跃的HSC克隆更接近于转录轨迹的起始点，但并没有以静态基因标签为特征。命运特定的基因标签暗示了HSC克隆细胞命运的一致性，并且向短寿命谱系组细胞输出的HSC表明，HSC命运随着时间的推移是稳定的。这些在生理条件下对细胞命运和转录组的综合分析将为鉴定HSC细胞命运决定背后的分子机制铺平道路。

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