质谱文件mzxml转换后m/z不匹配问题

想特别说一下在compass data analysis 中导出mzxml中可能遇到的问题。我们转换好mzxml数据，根据前一篇的方法读到matlab中。但是数据转换的过程可能会出错，这体现在matlab中观察到m/z的数值非常的奇怪。

我们用另一个文件转换软件msconvert来测试，同样存在问题。接着我们用另一个类型的原文件swiff进行数据转换并没有问题。

我们跟bruker公司联系得知，很多其他的用户也出现这个过这个问题，但他们很快的解决了这个bug。 所以我们现在拿到的是没有问题的数据。 但不保证所有的版本已经更新并解决这个问题。

如果用msconvert进行数据转换时，如果不成功。请按照下图进行设置。