Tools4You教程1:关于Tools4Young + t检验

Tools4You是什么

Tools4You是一个基于R shiny的网页工具,能够完成常见的统计分析及数据可视化。

Tools4You的开发初衷

作为R语言的重度使用者,自从习惯用R以后,我就很少用那些破解版的付费软件,如SPSSOriginLab等。我们课题组相对比较大,总是有同学在找各种软件的破解包来进行统计分析或者是绘图。使用盗版(破解)软件有些不足之处,比如说破解的版本经常无法使用,或者说在投稿的时候因为破解版软件影响到文章等。相比之下,R作为一个完全开源免费的软件,在生命科学领域正在大放异彩,囊括了从统计分析到数据可视化的各种功能,不乏CNS级别的文章都使用R进行统计和绘图。但是要从头学习一个语言是比较困难的,虽然R的学习曲线相对来说不是很陡峭,但是对于我们农学口的研究生来说,要拿出大把的时间学习R也是比较困难的。很感谢我的导师,从我本科毕业开始就让我往生信方向走,从那时候开始学习R,现在也快两年半了,算不上精通R,我认为我只是熟悉R。在研三这个特殊的时期,我突然决定以R shiny为基础开发一个网页版工具,供实验室的同学使用,如果能够帮助到其他学校/研究所的同学,那我将倍感荣幸。

Tools4You目前预计功能模块有30个左右,总代码量达到1.5~2.0W行。由于目前完全是我一个人在开发,临近毕业需要写毕业论文+做实验,所以进度较慢,预计一周能够更新1-2个功能模块;一个人开发,免不了代码不规范、代码冗余,暂时的目标是搭建好一个基本的可使用的框架,更多细节留在后面慢慢调试。

目前Tools4You托管在阿里云服务器上,由于服务器内存只有2G,访问的时候加载时间大概是10秒左右,还请耐心等待。

如果遇到报错或者是有任何的建议意见,欢迎联系我们:

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访问Tools4You

浏览器访问网址http://shinyapp.top:3838/Tools4You/,手机端暂不兼容。

访问连接成功后便是如下界面:

Tools4You界面

主要分为3个大的功能模块:

  • 常用小工具:分组求均值,数据正态性检验,方差齐性检验等;

  • 统计&分析:常见的统计分析方法;

  • 数据可视化:生命科学研究中常见的图形。

点开每个大的功能模块下会有具体的功能模块。

t检验

t检验界面

使用流程:

  1. 上传数据:目前只支持.csv格式文件的上传,检验先下载示例数据,按照示例数据的格式整理数据,然后上传分析

  2. 选择统计检验的置信度,通常是0.99或者0.55,默认的是0.99;

  3. 下方的单尾/双尾方差相等通常都是默认值;

  4. 配对数据:如果数据是配对的,选择,否则就是默认

  5. 误差棒数据:选择柱状图误差棒是用标准误还是标准差,默认是标准差

  6. 下载参数设置:下载统计分析结果的文件格式,默认的是'Excel'文件,图片下载格式默认的是PDF,下面是图片的长度和宽度设置;

  7. 绘图参数设置:坐标轴及图片名称等,需要注意的是,如果没有输入在那个分组上标注显著性,则默认在两个柱子上都标注显著性

  8. 将所有参数设置完成后,点击点击提交即可;

  9. 如果需要调整某个参数,则在调整完参数后再次点击点击提交

  10. 完成后下载对应的表格结果和图片即可。

下载界面

注:展示的图片长宽和下载的图片长款是没有关系的,如果需要更进一步的细节修改,可以使用AI等软件进行调整,也可以在后续我们更新相关模块后进行细调整。

t检验结果解读

t检验结果解读

这是t检验的结果,从左到右分别表示:分组名称、重复数量、和、均值、标准差、标准误、P 值和显著性。

t检验结果图

这个是导出的绘图结果,基本能用。


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