Tools4You
是什么
Tools4You
是一个基于R shiny
的网页工具,能够完成常见的统计分析及数据可视化。
Tools4You
的开发初衷
作为R
语言的重度使用者,自从习惯用R
以后,我就很少用那些破解版的付费软件,如SPSS
、OriginLab
等。我们课题组相对比较大,总是有同学在找各种软件的破解包来进行统计分析或者是绘图。使用盗版(破解)软件有些不足之处,比如说破解的版本经常无法使用,或者说在投稿的时候因为破解版软件影响到文章等。相比之下,R
作为一个完全开源免费的软件,在生命科学领域正在大放异彩,囊括了从统计分析到数据可视化的各种功能,不乏CNS
级别的文章都使用R
进行统计和绘图。但是要从头学习一个语言是比较困难的,虽然R
的学习曲线相对来说不是很陡峭,但是对于我们农学口的研究生来说,要拿出大把的时间学习R
也是比较困难的。很感谢我的导师,从我本科毕业开始就让我往生信方向走,从那时候开始学习R
,现在也快两年半了,算不上精通R
,我认为我只是熟悉R
。在研三这个特殊的时期,我突然决定以R shiny
为基础开发一个网页版工具,供实验室的同学使用,如果能够帮助到其他学校/研究所的同学,那我将倍感荣幸。
Tools4You
目前预计功能模块有30个左右,总代码量达到1.5~2.0W行。由于目前完全是我一个人在开发,临近毕业需要写毕业论文+做实验,所以进度较慢,预计一周能够更新1-2个功能模块;一个人开发,免不了代码不规范、代码冗余,暂时的目标是搭建好一个基本的可使用的框架,更多细节留在后面慢慢调试。
目前
Tools4You
托管在阿里云服务器上,由于服务器内存只有2G,访问的时候加载时间大概是10秒左右,还请耐心等待。如果遇到报错或者是有任何的建议意见,欢迎联系我们:
访问Tools4You
浏览器访问网址http://shinyapp.top:3838/Tools4You/,手机端暂不兼容。
访问连接成功后便是如下界面:
主要分为3个大的功能模块:
常用小工具
:分组求均值,数据正态性检验,方差齐性检验等;统计&分析
:常见的统计分析方法;数据可视化
:生命科学研究中常见的图形。
点开每个大的功能模块下会有具体的功能模块。
t
检验
使用流程:
上传数据
:目前只支持.csv
格式文件的上传,检验先下载示例数据,按照示例数据的格式整理数据,然后上传分析;选择统计检验的置信度
,通常是0.99或者0.55,默认的是0.99;下方的
单尾/双尾
和方差相等
通常都是默认值;配对数据
:如果数据是配对的,选择是
,否则就是默认否
;误差棒数据
:选择柱状图误差棒是用标准误
还是标准差
,默认是标准差
;下载参数设置
:下载统计分析结果的文件格式,默认的是'Excel'文件,图片下载格式默认的是PDF
,下面是图片的长度和宽度设置;绘图参数设置
:坐标轴及图片名称等,需要注意的是,如果没有输入在那个分组上标注显著性,则默认在两个柱子上都标注显著性;将所有参数设置完成后,点击
点击提交
即可;如果需要调整某个参数,则在调整完参数后再次点击
点击提交
;完成后下载对应的表格结果和图片即可。
注:展示的图片长宽和下载的图片长款是没有关系的,如果需要更进一步的细节修改,可以使用AI
等软件进行调整,也可以在后续我们更新相关模块后进行细调整。
t
检验结果解读
这是t检验
的结果,从左到右分别表示:分组名称、重复数量、和、均值、标准差、标准误、P 值和显著性。
这个是导出的绘图结果,基本能用。