记录Centos安装R语言环境,使用Rmd生成html

安装R语言环境

依次执行以下:
yum install epel-release
yum install R

安装后验证:输入R,如图代表成功
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安装rmarkdown基础环境包

install.packages(“rmarkdown”)
install.packages(“ggplot2”)
install.packages(“openxlsx”)
install.packages(“DT”)

安装pandoc基础环境

1、 pandoc version 1.12.3 or higher is required and was not found.
解释:錯誤︰ pandoc 版本 1.12.3 或更高需要但找不到
解决:
安装pandoc
wget https://github.com/jgm/pandoc/releases/download/2.14.0.3/pandoc-2.14.0.3-linux-amd64.tar.gz
tar -xvf pandoc-2.14.0.3-linux-amd64.tar.gz
ln -s /home/soft/pandoc-2.14.0.3/bin/pandoc /usr/bin/pandoc #注意你的路径

生成html:

Rscript knit2html.R report.Rmd report.html
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遇到的错误:
1、 pandoc version 1.12.3 or higher is required and was not found.
解释:錯誤︰ pandoc 版本 1.12.3 或更高需要但找不到
解决:
安装高版本pandoc
#pandoc 2.5
pandoc -v
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2、ln: failed to create symbolic link ‘/usr/bin/node’: File exists
解决办法:到指定目录删除已存在的

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