空间数据可视化：2D or 3D？

尽管我们对3D的和交互的动图有某种偏好，但是长久以来主流期刊杂志依然以2D的静态图为主。这当然与现在的媒体技术有关，虽然多媒体技术已经允许我们这样做了，比如在文章最后附一个shiny链接。空间表达数据，像他的字面意思一样是有空间信息的，那么空间数据的可视化3D会是趋势吗？3D和2D的主要应用场景是什么呢？我们将会在这篇文章中探讨。

就空间数据分析来讲，发表文献依然会以2D 为主，而作为数据库则可能大部分走向3D可视化。这对JS可视化要求自然是有的，需要从底层来构建3D结构。

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https://www.sciencemag.org/custom-publishing/webinars/mining-transcriptome-using-spatial-transcriptomics-comprehensive-2d-or-3d
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6339868/
http://3d-cardiomics.erc.monash.edu/
https://www.picb.ac.cn/hanlab/itranscriptome
http://www.emouseatlas.org/emap/home.html
https://www.sanger.ac.uk/group/bayraktar-group/
http://zhuang.harvard.edu/merfish.html
https://github.com/tractatus/spatial_transcriptomics_heart

Three-dimensional intact-tissue sequencing of single-cell transcriptional states
3D-Cardiomics: A spatial transcriptional atlas of the mammalian heart
Uncovering an Organ’s Molecular Architecture at Single-Cell Resolution by Spatially Resolved Transcriptomics
eMouseAtlas, EMAGE, and the spatial dimension of the transcriptome