1月8日傍晚，袭击谷万太郎、谷三十郎、正木直太郎、高野十郎（阿部十郎饰）、大坂松屋町的小豆店石藏屋，斩杀土佐的大利鼎吉。
10日，谷万太郎、正木向近藤、土方发送了一份关于紫原屋事件的报告书。
11日新选组在大阪天神桥张贴檄文。
19日到访津藩士中村左马、新选组屯所听取大阪的形势。
25日在见回组兵库县，佐々木六角源氏太夫等14人连续第二天被逮捕。
26日余党逃亡大阪。
27日队士约30人，在大阪袭击源氏太夫的残余党，一人斩杀，23人被捕获。
同月，朝廷下达了禁门之变的感状。
2月9日，在寄给土方、佐藤彦五郎的信中，在去年年末编排的《行军录》中记述了永仓不在的解释。
22日山南逃走，冲田追赶大津。
23日在山南屯所切腹。
24日将举行山南的葬礼。
28日，西本愿寺门迹使田中主铃向朝廷提交了同意新选组转移屯所的口头书。
3月3日大谷良辅切腹。
6日逮捕了6名在三条通的盔甲屋做押借工作的人。
10日左右，新选组将屯所迁移到西本愿寺北集会所。
20日，福田内置之助、新选组提出的350两借用请求中，同意了200两贷款。
21日，冲田在佐藤家写了山南去世的信。
同一天，土方、斋藤、伊东为了招募队员，来到了江户。
26日，新选组出动只园一带发生火灾。
同月，朝廷下达了禁门之变的感状。
4月1日左右，对于久世家的家臣某新选组妨碍通行一事，松原忠司提出了质问。
7日改为庆应。
12日，土方拜访了日野的佐藤家。
14日，在尾关刷弥四郎的手下，大坂弓场町的算命者村井北山善三郎在茶金作上写下了新选组入队的介绍信。
日后，金作在屯所接受面试，但没有入队。
15日土方离开日野。
27日，与土方、斋藤、伊东、藤堂一起率领52名新入伍士从江户出发。
当月，西本愿寺家来西村芳三郎（西村兼文饰）将伪装成京都逃跑人潜入防卫长两国的探索书送给一桥家。
5月9日土方一行、草津宿着。
同月中新选组被任命为大阪警备，数人下坡。
26日在大阪捕获藤井蓝田，将其收容在万福寺。
闰5月5日在大阪的新选组京桥对可疑人物进行盘问。
11日在京都松崎逮捕了潜伏的长州人。
12日，幕府对新选组及其他警备阵进行岗位分配。
当天，新选组、单内式部、矢野玄道等5名成员将被逮捕。
13日发现了在膳所妨碍上洛中的家茂的计划。
14日，佐野七五三之助等4、5名队员到膳所出差，在搜查河濑太宰家的过程中，妻子幸为了保护不在家而自杀。
15日河濑太宰等3名捕获。
18日逮捕了河内狭山藩士山本时次郎。
21日家茂因为膳所事件住在大津。
22日，由于家茂的入京，三条蹴上迎来了二条城。与家茂同行的松本良顺，在木屋町南部精一家旅行。近藤、松本访问，松本也访问了屯所。此时担忧队员的卫生状况
23日南部精一，之后将去屯所进行一个月左右的检查。
24日在家茂的下坂保护藤之森。
同月逮捕了井上谦三，但由于伊东的美言而被释放。
同月中西登小路平三郎在醒井鱼架的旅馆逮捕了石津茂一郎。
根据6月1日米价钓上来的传闻，逮捕了米批发商的主人们，并带他们去万福寺。
6日，西四条家家臣2名被带到屯所，但被释放。
15日，大阪的新选组向五神社的目付方宿舍寄送集合的传票。
16日早上，在天满宫总代的大道吉仪、宿舍与三木三郎面谈。
21日施山多喜人石川三郎，因与町家妇女私通罪切腹。
7月1日左右列出了134名队员的《英名录》被制作出来。
4日，他与大阪某桥警备队士、某藩士三人发生口角，导致刀伤。
18日逃走的植田末次等3人，接到了在名古屋附近骗取早上名字进行筹款的通报，伊东等人在东海道，岛田等人在中山路上探索。
25日，佐野牧太因暴露金策而被斩罪。
同月中伊东、富山弥兵卫、茨木司、感情部正亲、筱原泰之进等大和出差，在出差地与浪士发生冲突，导致感情部腿受伤。
8月1日向平藩士佐藤久左卫门、石川弥右卫门、新选组提交了道歉信。
5日队士某在岛原住吉社前与一桥家臣某发生口角后斩杀。
8日，武田以下6、7名队员前往踢上奴茶屋逮捕了金策的萨摩藩士桥口四郎、隈本庄助，斩杀桥口，捕获隈本。
9月1日松原忠司因切腹伤恶化死亡。
9日晚，堀川松原通与巡查队士肥后藩士四人发生口角，带到了上屯所。
同月，新选组将壬生寺境内作为训练场委托借用。
同月左右第二次《行军录》被制作。
10月3日将军家茂为了返回江户而在下坂中，松平容保为了阻止返回，用枚方谏言使之返回东京。近藤也赶往枚方，保护家茂回到京都。
11月4日，近藤、伊东、武田、山崎山崎祯一；吉村贯一郎、芦屋登、新井忠雄、尾形俊太郎、服部武雄、长州问使等人来到广岛。这时，近藤给佐藤、小岛、粕谷家写下了觉悟的程度，同时向冲田传达了想让他继承剑流名的意思。
7日近藤等人从大阪出发。尾关弥四郎病死。
16日近藤等人抵达广岛。
20日，长州问使要求近藤等人进入长州，但遭到拒绝。
21日，在伊东的协助下，赤根武人等3名入狱者从广岛被派遣到长州。
23日，近藤拜访了长州藩士大津四郎右卫门、近藤等人，傍晚近藤拜访了广泽藤右卫门，与他们进行了面谈。
12月11日，近藤、武田拜访了停留在广岛的长州藩士松泽音三，拜托他回国时同行，但他却被谢绝。
12日，樱井勇之进死亡。
14日近藤、伊东、武田计划进入岩国，从广岛出发。
15日近藤、伊东、武田、岩国官员要求进入长州。
16日近藤等人放弃进入长州，离开了岩国。
17日近藤等人从广岛出发返京。
22日回到东京的近藤等人为了报告访问会津藩