利用excel内的doi和python批量下载外文文献

提示：文章写完后，目录可以自动生成，如何生成可参考右边的帮助文档

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前言

利用web of science 批量获取doi至表格，之后通过运行python代码，自动批量下载文献
我用的python3.7,在Anaconda里运行的

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提示：其中，python代码是根据WuGenQiang（《通过doi下载单个文献pdf》)的代码修改的（本人python没学多少，所以代码不规范，见谅）。

一、将选择的文献用excel导出

1.文献按Excel导出

在web of science内检索完自己想要的文献后，选择自己需要的文献，然后点击<将记录导出至Excel>，记录内容改为<全纪录>，点导出

2. 将DOI另存在一个excel中，存为xlsx格式

直接用导出的excel，会出错，可能是我调用excel的类型不对？只能读取xlsx？不太清楚，懒得试了，有兴趣的小伙伴可以自己试试

二、利用python批量下载Excel表中文献

将代码保存至F:\doi_download.py（也可设为其他），将excel挪到F盘，将下面代码的doi所在列改成A列，然后运行就行了。

2.代码

# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Created on Sun Jun  6 21:09:44 2021

@author: dell
"""


"""
这是原作者的信息
@File: version_1.1_doi_to_get_pdf.py
@Time: 2021/4/20 10:10 下午
@Author: [email protected]
@desc: 通过doi号下载文献pdf
"""

import requests
import re
import os
import urllib.request
import openpyxl

# headers 保持与服务器的会话连接
headers = {
    'User-Agent': 'Mozilla/5.0 (Windows NT 10.0; Win64; x64) AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko) Chrome/63.0.3239.108 Safari/537.36',
}

'''
根据doi，找到文献的pdf，然后下载到本地
'''


def getPaperPdf(url):
    pattern = '/.*?\.pdf'
    content = requests.get(url, headers=headers)
    download_url = re.findall(pattern, content.text)
    # print(download_url)
    download_url[1] = "https:" + download_url[1]
    print(download_url[1])
    path = r"papers"
    if os.path.exists(path):
        pass
    else:
        os.makedirs(path)

    # 使用 urllib.request 来包装请求
    req = urllib.request.Request(download_url[1], headers=headers)
    # 使用 urllib.request 模块中的 urlopen方法获取页面
    u = urllib.request.urlopen(req, timeout=5)

    file_name = download_url[1].split('/')[-2] + '%' + download_url[1].split('/')[-1]
    f = open(path + '/' + file_name, 'wb')

    block_sz = 8192
    while True:
        buffer = u.read(block_sz)
        if not buffer:
            break
        f.write(buffer)
    f.close()
    print("Sucessful to download" + " " + file_name)
'''
将表格放在代码保存和运行的路径内，将wb变量内的'n0606.xlsx'改为自己的excel文件名,
最后下载的论文在该路径下新建的papers文件夹内
'''
wb = openpyxl.load_workbook('n0606.xlsx')
#doi在sheet1中
sheet1 = wb.get_sheet_by_name('Sheet1')
#读取第A列

'''
修改代码内，excel中DOI所在列，我的在BC，所以col_range变量后面的字符改为了‘BC’
'''
col_range = sheet1['A']
# 读取其中的第几行：row_range = sheet1[2:6]
fails=[]


 #以下代码加入了我找的其他SCI-hub网址，不需要可以删除一些
for col in col_range: # 打印BC两列单元格中的值内容
    doi=col.value
    print (doi)
    if __name__ == '__main__':
        sci_Hub_Url = "https://sci-hub.ren/"
        paper_url = sci_Hub_Url + doi
        print(paper_url)
        nmm=0
        try:
            getPaperPdf(paper_url)  # 通过文献的url下载pdf
            continue
        except Exception:
            nmm=1
            print("Failed to get pdf 1"           
        if nmm==1:
            try :
                sci_Hub_Url_2 = "https://sci-hub.se/"
                paper_url_2 = sci_Hub_Url_2 + doi
                getPaperPdf(paper_url_2)
                
                continue
            except Exception:
                print("Failed to get pdf 2")
        if nmm==1:
            try :
                sci_Hub_Url_3 = "https://sci-hub.st/"
                paper_url_3 = sci_Hub_Url_3 + doi
                getPaperPdf(paper_url_3)
                continue
            except Exception:
                print("Failed to get pdf 3")
        if nmm==1:
            try :
                sci_Hub_Url_4 = "https://sci-hub.shop/"
                paper_url_4 = sci_Hub_Url_4 + doi
                getPaperPdf(paper_url_4)
                continue
            except Exception:
                print("Failed to get pdf 4")
        if nmm==1:
            try :
                sci_Hub_Url_5 = "https://sci-hub.shop/"
                paper_url_5 = sci_Hub_Url_5 + doi
                getPaperPdf(paper_url_5)
                continue
            except Exception:
                print("Failed to get pdf 5")          
        if nmm==1:
            try :
                sci_Hub_Url_7 = "https://sci-hub.do/"
                paper_url_7 = sci_Hub_Url_7 + doi
                getPaperPdf(paper_url_7)
                continue
            except Exception:
                print("Failed to get pdf 7")    
        if nmm==1:
            try :
                sci_Hub_Url_6 = "https://libgen.ggfwzs.net/"
                paper_url_6 = sci_Hub_Url_6 + doi
                getPaperPdf(paper_url_6)
                continue
            except Exception:
                print("Failed to get pdf 6")
                fails.append(doi)
                
#获取下载失败的doi
print (fails)

结果展示图在这里。

总结

根据上面写的就可以根据excel的DOI批量下载论文了，不过有一些会失败，那种可能就要手动了，我自己感觉还可以，大家可以试试。
另：python实在不行，所以根据别人代码改的（强调！！！），我加的那些让代码看起来很啰嗦，有更好的写法，欢迎大家告诉我，感恩