玉米转座子插入型突变体”五折优惠

“玉米转座子插入型突变体”五折优惠

一年一度的双十一来啦！中国农业科学院作物科学研究所重大平台中心隆重推出“玉米转座子插入型突变体”5折优惠活动！即日起至12月15日，凡订购“玉米转座子插入型突变体”，即享原价3000元/份，现价1500元/份的优惠，欲购从速！

联系方式：
中国农业科学院作物科学研究所 孙老师

18645149460

突变体介绍

突变体是植物功能基因组学研究的基础材料，转座子作为一类可移动的DNA元件，在植物突变体库的构建中被广泛应用。近期，来自中国农业科学院作物科学研究所、河南农业大学、中国农业科学院生物技术研究所的合作团队，利用W22株系中天然存在的活化Ac转座酶在K17株系背景中激活Ds转座子，并在后代中纯化了遗传稳定的Ds插入型突变体库。使用自主研发的TEA-seq技术，合作团队在全基因组范围高效测序鉴定了突变体单株内的Ds基因组插入位点信息。

该突变体库具有如下特点：

1. K17/昌7-2优势自交系遗传背景，具备优良农艺性状

2. 全基因组鉴定到70600个非重复的Ds插入位点

3. 在15852个基因区含有插入突变，覆盖了约36%的玉米基因

4. 转座子携带剪切识别序列和终止密码子，可造成基因失活

5. 不涉及转基因过程，后续科研和育种研究可按常规自交系管理

6. 结合BSA/BSR技术可高效正向定位关键调控基因

玉米Ds插入突变体库的鉴定为玉米功能基因组学研究提供了重要的材料资源，相关突变体和突变信息可在MEILAM数据库进行查询，详情见：http://www.maizetepolymorphism.com/AcDs/ 

应用案例一：重要调控基因的生物学功能论证

玉米重要驯化相关基因Teosinte Branched 1（TB1）调控侧枝发育。我们鉴定到了一个新的等位突变事件，突变体tb1上游411bp处发生Ds转座子插入，qRT-PCR验证该基因表达量下降。突变体产生侧枝发育增加和多穗表型。INCW3与细胞壁发育有关在籽粒中表达，我们鉴定到一个新的等位突变事件，突变体incw3的第二外显子发生了Ds插入，造成基因结构破坏。突变体产生种子皱缩表型。

应用案例二：重要农艺性状调控基因的高效正向定位

我们发现一个突变体具有籽粒皱缩表型，且果穗上饱满与皱缩种子的表型分离比例接近3：1。选择两类表型种子各20粒，发芽后取样建立BSR/BSA混池文库并进行测序，定位到3号染色体存在显著的关联峰。该区域中唯一的Ds插入事件发生在一个AGAMOUS-like 2转录因子的基因编码区域。该基因为印记修饰基因并在籽粒中高度特异表达。综上证据，可考虑认为AGL2是玉米籽粒发育过程中的一个新的调控基因，受DNA甲基化特异调控，其受表观遗传学修饰调控过程及下游转录调控网络需要进一步研究。

注：中国农业科学院作物科学研究所刘君、程溪柳、吕明杰、付俊杰、刘远航、刘小溪等负责实验设计、仪器设计、鉴定工具和在线数据库开发、生化实验流程开发、生物信息学分析，河南农业大学陈彦惠、库丽霞、柳华峰等负责玉米突变体库构建、株系纯化、K17基因组组装，中国农业科学院生物技术研究所王欢、Joram Kiriga Waititu、孙莹等负责仪器设计、生物信息学分析和验证实验。相关工作得到科技部十三五重点研发，国家自然科学基金，中国农业科学院创新工程等资助。

参考文献

1.论文：Mingjie Lyu，Huafeng Liu，Joram Kiriga Waititu，Ying Sun， Huan Wang， Junjie Fu， Yanhui Chen，Jun Liu， Lixia Ku，Xiliu Cheng, TEAseq-based identification of 35,696 Dissociation insertional mutations facilitates functional genomic studies in maize, Journal of Genetics and Genomics, 2021, S1673-8527 (21) 00227-7, https://doi.org/10.1016/j.jgg.2021.07.010

2.专利：一种高通量快速磁珠法提取植物基因组DNA的试剂盒及提取方法，202010940039.7

3.专利：一种底部侧吸式磁力架，ZL202021917582.7

4.专利：一种基于NGS测序的AcDs全基因组位点高效检测引物和方法，202011139059.0

5.专利：一种便携式96孔超顺纳米磁珠操作仪，ZL202021400342.X

6.专利：一种基于磁珠法的高通量便携式核酸提取仪， 202010684707.4

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