CNV数据可视化1

我们经常可以看到各种各样的CNV可视化图，有所有染色体的，有单条染色体的，有区域的，有的是根据log2ratio作图，有的根据拷贝数作图，今天给大家介绍几个我绘制的CNV可视化图形。第一个是纵向的所有染色体的可视化图，点图是根据log2ratio绘制，红线是根据segment后的片段数据绘制。

数据的输入格式如下：

chromosome    start    log2
1             12080    0.087873
1             12595    -0.919149
1             13163    -0.560349
1             14620    -0.0621168

点图的绘制数据如下，三列信息分别为染色体，坐标和log2值

chromosome    start       end         log2
1             12080       70695053    0
1             70696146    70696319    -6.4841
1             70696696    86342922    0
1             86343422    86452719    -1.02163

此外，也可以绘制横向的图形，如下：还可以绘制单条染色体或者多条染色体的，如下：