学习:StatQuest-RNA-seq

RNA-seq的建库过程

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上图是RNA建库的步骤

RNA测序过程

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采取边合成边测序的原则,不同碱基,带有不同荧光,测序仪测出不同荧光


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RNA-seq

原始文件是fastq文件:


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过滤掉一些低质量的reads


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把参考基因组分成若干小的fragment
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然后将每个reads match到这些fragment


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再来就是根据位置信息进行计数
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