2020.3.6 知识笔记

学而

胶质瘤和肝癌存在明显区别，因为胶质瘤是必须要进行化疗/放疗的，会对肿瘤造成很强的选择压力。而临床获得的肝癌标本一般是不经过手术治疗的。

错义突变：发生了引起编码不同蛋白的突变；同义突变：发生了不引起蛋白编码改变的突变，可以在一些进化分析中作为背景。

免疫编辑：一种新的假说，免疫系统能够清除癌细胞，但是同时也会给癌细胞带来选择压力，促进其进化并且逃逸。

博学

推荐了解贺雄雷工作：存在丰富的进化研究经验，能够从他的文章中了解到一些有意思的肿瘤选择指标。

两个月前的一篇HK发表的文章有进行de novo/ true recurrent分型，提供了一些参考方法，建议阅读。

12月GAO QIANG 发表了一篇文章，里面有一张图，展示了对免疫选择压力的评估，把选择分为正向选择、负向选择、中性。我很好奇具体的计算方法，以及怎么用医学语言解释原理。

审问

remotely related protein是什么类型的蛋白？

组合比对（序列、结构域）：什么是结构域比对，根据什么特征比对？

什么是克隆基因和亚克隆基因，它们为什么可以计算免疫编辑分数？