组蛋白修饰是个啥

最近在看《超越双螺旋——神奇的表观遗传密码》这本书，初次接触表观遗传领域，感觉像进入了新世界。今天看的内容与组蛋白修饰有关，看完觉得很有趣，也很好理解。

1. 关于组蛋白

“核小体”是染色体的基本结构单位。4种组蛋白，各2个组成一个8聚体，DNA链再缠绕上去，就形成核小体了。每个组蛋白肽链都有氮端和碳端两个“尾巴”，这些“尾巴”上的氨基酸可以被加上一些化学基团，即“修饰”。

图片来源于百度

从图中可以看到，这些化学基团和DNA链可能靠得比较近，因此可能会对基因的表达产生影响。

2. 有哪些修饰？

按照化学基团来分
乙酰化（赖氨酸上面）、单/双/三甲基化（赖氨酸上面）、磷酸化（丝氨酸上面）
按照对基因的调控来分
抑制型（常是双/三甲基化）、激活型

不同的修饰可能在不同的调控途径中发挥不一样的功能

3. “组蛋白密码”

一个假说，2000年提出。
不同组蛋白、不同氨基酸位点、不同修饰类型可能存在特定的排列组合起到特定的作用。（和密码子有点像）

4. 染色质免疫沉淀（ChIP）

是研究蛋白质—DNA相互作用的实验技术，在这里指的就是组蛋白和DNA。除了应用于表观遗传学研究中，还能应用于转录因子调控机制研究。

原理：先将染色质打断成很小的片段，选择能特异识别并结合某组蛋白某修饰的抗体去吸附染色质片段，最终将组蛋白连同附在上面的DNA一起沉淀下来。由此就可以研究组蛋白（修饰）和DNA（区域）的联系。

5. ChIP-seq

想要研究的组蛋白修饰在设计ChIP实验的时候就知道了，但是捕获下来的DNA片段是否就是我们想要研究的基因还有待分析。因此，对这些捕获下来的DNA片段进行高通量测序是很有必要的。

6. “组蛋白语言”

从组蛋白密码到组蛋白语言，是对组蛋白修饰认识的一个过程。生命科学就是这样，在不断的实验和探索中，对前人的理论作出补充（或是批判）。

我自己的理解是，随着该领域的深入研究，发现组蛋白修饰之间可能不是那么容易就能找出一些类似于“密码子表”那样的定式，因此才将对组蛋白的认识从“密码”转变为“语言”。