转录组分析之韦恩图

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介绍一款在线工具，用来绘制韦恩图

1. 什么是韦恩图？

维基百科的简单介绍，简单概括就是表现不同组事物之间的集合重叠部分的简单可视化呈现。本来是数学分支集合论中的用来表示集合的草图，在生物学中，很多时候我们都用来分析不同处理的转录组样本，中共同上调或下调的重叠基因集合。

约翰·维恩是19世纪英国的哲学家和数学家，他在1881年发明了文氏图。文氏图（英语：Venn diagram），或译Venn图、温氏图、维恩图、范氏图、韦恩图等，是在集合论数学分支中，在不太严格的意义下用以表示集合的一种草图。它们用于展示在不同的事物群组（集合）之间的数学或逻辑联系，尤其适合用来表示集合之间的“大致关系”，它也常常被用来帮助推导（或理解推导过程）关于集合运算（或类运算）的一些规律。

植物不同器官的重叠基因

2. 如何绘制Venn diagram

目前来看，对于不会R语言的朋友来说，在线工具是最方便的。这里，我推荐一个在线网站：http://jvenn.toulouse.inra.fr/app/example.html 。

• 首先看一下整个网页的内容：

  
  
  jvenn

• 其实只要简单复制和黏贴就可以绘制完成，感觉任何人都可以哈，包括我自己。

1. 将你需要绘制的基因ID组复制粘贴到list中，最多可以放6组，但是我觉得一般都不会放那么多。

   
   
   两组番茄的ID

2. 速度很快，你可以马上看到结果。感觉还不错，而且你点击右上角的三条杠，会出现下载的图片格式，根据需要进行下载。

   
   
   集合结果

3. 如果你需要知道，其中5个基因是哪些呢？当然可以直接显示，你在数字5上单击左键，将网页拖到最下面，你可以看五个基因ID。方便进行进一步的分析和研究。

   
   
   共有的ID

到此，在线的韦恩图绘制结束，是不是超级简单，当我看到这样的网站的时候，我也还是有些兴奋的，因为不怎么会用R语言，对大多数人来说应该是个福音。继续探索各种方便作图和分析的在线工具，不断地分享，帮助有需要的人同时也提高自己，何乐而不为呢？
我想说：真得很惭愧，已经太久太久没有记笔记，去分享各种自己经历的困难和成功。太久，我都快忘记怎么使用markdown语法了，今天终于抽空分享一点这两天遇到的一些东西，想分享给大家。

3. 想做的事

8月份接下来的时间里，我想开始分享一些我经常在用的一些网站，一些在线工具。这是今天在写这篇笔记的时候，突然想到的事情，为什么不把自己常用的这些在线工具分享出来呢？不定期分享吧，可能实在也没有特别多的时间来写，有空的时候就写一点。