医学小白也可以利用生信快速设计出一个课题

作为一个既没有任何经费也没有基础科研条件的医学小白,需要申请课题,该怎么办呢?俗话说得好:”办法总比困难多”。没有经费、没有经验的情况下,也能想到并设计好一个课题,进行申请基金。当然,作为小白,申请课题肯定要申请入门级别的,例如校级课题、市级课题,毕竟是没有办法来做预实验的。

作为医学小白,我们可以设计可行性比较强、套路化比较成熟的课题,ceRNA相关的课题正好符合这些特点,非常适合小白。下面分享一下如何设计ceRNA相关的课题:

首先,我们要知道ceRNA机制:circRNA或者lncRNA通过调控下游的miRNA的表达,进而调控mRNA的表达。也就是说做ceRNA需要三个分子:circRNA(lncRNA)、miRNA、mRNA,找到其中的一个分子就可以找到突破口了。

我们可以找到一个circRNA或者lncRNA作为突破口,进而找到下游miRNA、mRNA,也可以采用逆推法,先找到一个基因作为突破口,进行预测上游的miRNA,进而得到上游的lncRNA或者circRNA。现在都流行结合热点进行设计课题,所以我们更加喜欢采用逆推法。

我们可以确定一个热点基因作为突破口进行设计ceRNA课题。如何确定一个值得深入研究的热点基因呢?首先,可以多看文献,从文献中找到这样的基因,当然,很多时候往往是找不到的,或者没有足够的时间来看文献,这种方法根本行不通。还有没有别的方法呢?肯定是有的,例如我们可以利用挖掘TCGA数据库的方法:通过差异分析、Cox分析、表达与临床的相关性分析来筛选一个值得深入研究的热点基因。

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