LARRY(lineage and RNA recovery) lentiviral barcoding library

一、LARRY

LARRY结构

      DNA条形码结构是在一个普遍表达的EF1α启动子驱动的增强性绿色荧光蛋白基因的3’UTR区域插入一个随机的28bp片段组成,构建了DNA条形码库LARRY(lineageand RNA recovery)。随后利用改良后的慢病毒转染将可遗传的DNA条形码插入到基因组中,scSeq测序可检测到DNA条形码。


二、Lentivirus

Lentivirus慢病毒:Lenti-在拉丁文中有慢的意思;慢病毒感染患者早期很难观察,大多都会经历一个长达数年的潜伏期,之后会缓慢发病,因此这些病原微生物被称之为慢病毒。

慢病毒载体:慢病毒载体是以HIV-1(人类免疫缺陷I型病毒)为基础发展起来的基因治疗载体,该载体可以将外源基因有效地整合到宿主的染色体上,从而达到外源基因的持久性表达。

三、lentiviral barcoding library

利用改良后的LARRY慢病毒载体转导 transduce,将可遗传的DNA条形码插入到基因中。用scRNAseq测序,可检测到barcoding。

参考:

https://zhuanlan.zhihu.com/p/133861128

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