Tools:aspera上传数据到SRA数据库

1.先注册NCBI账户,然后访问https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/sra/
,创建新的提交

  1. image.png

    按照步骤,一步步填写内容,第5和6步骤比较费时间,需要下载模板excel按照要求填写。
    注意:第6步,文件名,测序是R1和R2这种,把R1和R2放在同一行,最后面一栏filename,filename2分别填写R1和R2的完整文件名。

  2. 上传数据到数据库。
    选择aspera的模式上传
ascp -i  -QT -l100m -k1 -d  [email protected]:uploads/demol_163.com_zs********

是你本机的aspera.openssh的路径,这个文件也是从第7个页面里下载。根据你的邮箱决定的。
是你需要上传的数据的文件夹路径,一定是文件夹,直接上传文件会到根目录,你无法访问。

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