近日二三感悟 - 生物信息?

这几天,还是有一些感悟的,趁着周末和中午,就发出来看看。两则感悟均是之前在知识星球里面分享的。

第一则 - 关于生物信息入门?

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第二则 - 关于生物信息就业?

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文本信息如下

分享于20180910
这两天可能对外说的话有点多啦。从某个角度来说,我又对外“大放厥词”或胡说八道啦。
我比较尊重或者佩服的一位前辈(感觉是搞技术的,但我的认知标准来说,更倾向于高级技术支持,即能很好的把握产品的同时也对技术很熟悉)小窗我聊了下“生信数据分析市场”。
总的来说,我们的观点是基本一致。其他人也包括这位前辈,他们干大事;而我就看看哪些脏活累活没人干的,我就看看课题正好需要的同时,写个小工具,分享开来。运气好的时候,就赚一点体面的小钱。
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不过交谈中有一句话,我下午在分析数据的时候,突然又想起来,大体是前辈表达了一个意思,即他觉得我是有生信天赋的,无法明白搞不定生物信息的人的痛苦。
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其实不是。首先是我现在都不是搞生信的,因为我确实是做生物学问题的,没有方法学的文章,也没有任何拿得出手的成果。虽然现在看起来TBtools似乎有部分朋友喜欢,但这主要原因在于,脏活累活公司不干,真正搞生信的看不上,而我能干的也只有这些,所以我干了,总还是有人喜欢。
看着TBtools开发过来的朋友,其实很清楚。一开始我只是写了一个丑陋的【序列提取工具】,慢慢地,日积月累,一个工具一个工具叠加上去(主要原因是,课题组其他成员或者我做了什么分析,需要什么工具,我就写什么工具),慢慢地就变成现在这个样子。所以,不出意外,知道的人是这么一个评价“时间堆出来的”。我现在的编程能力,其实跟以前并没有太多的差别。但是当时为了积累到现在的状态,主要的代价是一两个月基本不出门,吃饭靠打包,从早写到晚。目前为止我没遇到另一个这么干的。因为或者很多人并不需要,更或者能这样干的,基本是脑子有问题或者确实没办法,只能这样干。所以总的来说,前两天发TBtools使用手册时收到的评价,“时间堆出来的”
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完全正确。智商本来就是我的硬伤,天赋更是不可能,看看我现在在哪里,做着什么事情就知道我有多弱小。但是再弱小的人都应该明白一个道理,只要你每天坚持在某一个事情上,找一点点的突破,那么总有一天,你肯定能有拿得出手的东西。关于生信,我早就没有在上面继续学习了,因为我发现大部分人跟我一样,足够蠢,但是没有关系,只要到了某个阶段(大概是入门左右),就会被很多人当做所谓“大神”。主要原因不是自己流弊,而是还有更多人他们不知道学习一个东西,要自主吸收,重点是自学,以及更重要的,坚持。
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最难超越的是聪明才智,这是肯定的,别人就是可以在短时间内得到解决办法;最容易被超越的也是聪明才智,因为这也是肯定的,总有人比你聪明(而对于我们这类凡人更是如此)。
但是,实际上,上面都是在扯淡。因为,一旦在足够长的时间尺度上来看事情,那么一切就不一样。再好的方法,不可能每一个都可以在短时间内积累到一定的量,而只要有不错的累积速度,只要一定时间的坚持,那么就可以找到某一个点的超越。
唯有时间堆积出来的东西,才不那么容易被超越。
所有在学什么生信数据分析流程的,其实自己应该很清楚,你能学的,所有人都能学。所以从这个角度来说,只要想超越你,分分钟搞定。而最需要的是持续地积累。

分享于今天20180915
今天在《生信札记》公众号的推文《所有人!瞬间掌握-无限个列表的-‘韦恩图’(Venn)绘制!》下,有一个老友(很早就认识的在生信公司工作的朋友)打趣的写了个评论。大体意思是,“是否会让搞生信的一些人失业?”。这是一个不错的话题,让我想起了很多事情。当然,我需要先摆出一个答案
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不会
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正如我回复评论的信息一样。(然后这位朋友打赏了一大笔!!!,先谢过支持)。
关于什么样的状态,才是做生物信息? 我个人胡说八道的观点,感兴趣的可以查看公众号的历史推文。
TBtools本身就是一个生信数据下游利用的辅助小工具。能做的事情很少
目标在于节省一些时间,而不是做伟大的事情
做生物学问题的朋友其实都会知道,在生信相关分析中,发现一些idea,文章故事的亮点,绝大多数,是来自于数据的快速获取,测序和仔细观察。
没有充分的生物学背景,无法发现生物学故事;
没有优秀的编码和可视化能力,无法快速获取信息。
两者之间的鸿沟如此巨大。目前为止,我认识的人里面兼顾两者的极少(当然,主要是我不擅交际,主要做农学,认识的人较少)。
TBtools的出发点就是这一块。
或者应该这么说,这些没有创新性的脏活累活,别人确实都不想干,只有我干。
而我并从来没有为其他任何人而开发TBtools。我考虑个人的收获也很简单
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以完成课题组课题需求为重点,写一些小工具,赚一点体面的小钱。
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总的来说,从TBtools推出到目前,还是有一部分人或者少数一两个公司比较排斥。似乎真的会影响他们什么的。不过有一个公司我觉得很不错,即Omicshare.com论坛的所有版主,尤其是周老大,小圆和小瑶....。其实看着生信这三五年的变化,我觉得大多数人应该都明白,几乎整个市场都发生了极大变化。
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我自认为,所有存在可能流程化的上游的生信数据分析都应该向死而生。 正如bioinformatics*中国(QQ群:276151571)一样,我们的目标一直是群的人数越少越好,保持良好的踢人传统(由于博士课题压力,也由于TBtools使用群的需要,作为第四任群主,我之前已换届走人啦)。我们认为最理想的状态是,最后这个群解散。说明生信数据分析完全不会有任何人存在任何问题。理想归理想哈。
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所以,真正做生物信息的,从来不会担心TBtools的开发。相反,他们会支持,可见大湿兄(biobabble公众号大神,现在正在招硕士和博士生),Zinky(齐哥),还有Kim(当然我还是希望他锐气不要太满,刚极易折)以及一些一时写不上来的朋友.... 顺带,谢谢所有支持TBtools开发的朋友,就不一一列出啦,我们私底下聊!

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