RNA-seq数据库(ChatGPT)

截至我最后更新知识的时间(2022年1月),存在许多RNA测序(RNA-seq)数据库,这些数据库提供了大量的基因表达和转录组学数据。以下是一些常见的RNA-seq数据库的例子:

  1. NCBI Gene Expression Omnibus (GEO):

    • 网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
    • 提供了广泛的基因表达数据,包括RNA-seq、微阵列等多种平台的数据。
  2. European Bioinformatics Institute (EBI) ArrayExpress:

    • 网址:https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/
    • 包含各种功能基因组学实验数据,包括RNA-seq。
  3. The Cancer Genome Atlas (TCGA):

    • 网址:https://www.cancer.gov/tcga
    • 提供了多种癌症类型的高通量分子数据,包括RNA-seq。
  4. Sequence Read Archive (SRA):

    • 网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/
    • 存储了来自各种实验的高通量测序数据,包括RNA-seq。
  5. ENCODE (Encyclopedia of DNA Elements):

    • 网址:ENCODE
    • 提供了人类基因组的详细注释和多种细胞类型的RNA-seq数据。
  6. GTEx (Genotype-Tissue Expression):

    • 网址:https://www.gtexportal.org/home/
    • 包含多个组织和器官的基因表达数据,用于理解基因在不同组织中的表达模式。
  7. Functional Annotation of the Mammalian Genome (FANTOM):

    • 网址:http://fantom.gsc.riken.jp/
    • 提供了大量的转录组学数据,用于理解基因的功能和调控。
  8. Allen Brain Atlas:

    • 网址:Allen Institute - Unlocking the Mysteries of Us
    • 提供了大脑组织中基因表达的详细图谱,包括RNA-seq数据。

请注意,这只是一小部分可用的RNA-seq数据库。领域中仍然存在其他专门化的数据库,以及不断有新的数据库涌现。因此,你可能需要查看最新的文献和资源以获取更新的信息。

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