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Rose软件寻找超级增强子

（1）这个前提是已经用Macs2寻找到了peaks, 很多人可能不明白一些人写的怎么将bed文件转化为.gff文件，其实根本不用，我们直接将Name_peaks.narrowPeak改一个名字，改成Name_peaks.narrowPeak.bed即可，然后我们就可以运用程序了！

我的应用程序如下：python ROSE_main.py -i /home/bijf/GBM_NSC_Astrocytes/NSC_H3k27ac/fastq_data/NSC_peaks.narrowPeak.bed -r /home/bijf/GBM_NSC_Astrocytes/NSC_H3k27ac/fastq_data/NSC_sort.bam -o /home/bijf/GBM_NSC_Astrocytes/NSC_H3k27ac/NSC -g HG19 -c /home/bijf/GBM_NSC_Astrocytes/NSC_H3k27ac/fastq_data/NSC_Input_sort.bam

（2）可能会遇到不能生成png图片的报错，这时候就需要我们手动修改一些rose下面的那个ROSE_callSuper.R文本了，通过vim在MAKING HOCKEY STICK PLOT目录下直接写一个library(Cario)，并将下面的png改为CarioPNG(注意PNG是大写！！！)


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