科研小行星
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这个工具让你５分钟搞定GSEA分析！还不来看看？

在某一项研究中，我们通过转录组或者蛋白组学研究了干预组和对照组的表达谱，获得了数千个基因的变化信息，如何从这些表达谱中发掘有用的信息？初步的生物信息分析可能已经给我们提供了它们之间的差异倍数，P值等等。接下来我们可以使用在线工具对基因表达的分布进行分析。这里提供一个最近更新的简单又快捷，不需要安装的在线分析工具。

 

01

 

首先点击网站      

见文末

 

如Figure 1所示  第一行显示的是不同的分析类型，从左边起第一个是ORA (Over-representation analysis，过度表达分析 ) 检查符合选择标准的基因，并确定该列表中是否存在统计学上过度表达的基因集。第二个是我们最常用的GSEA （基因富集分析，Gene Set Enrichment  Analysis）（红色圈圈）。GSEA用来确定先验定义的一组基因是否在两种生物学状态（例如表型）之间显示出统计学上显着而且一致的差异。第三个是NTA（Network Topology-based Analysis，基于网络拓扑的分析）。第四个是2019年新增加的功能磷酸化位点分析。

 

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