基于 Apache Doris 在读写流程、副本一致性机制、 存储机制、高可用机制等方面的常见疑问点进行梳理,并以问答形式进行解答。在开始之前,我们先对本文相关的名词进行解释:
FE:Frontend,即 Doris 的前端节点。主要负责接收和返回客户端请求、元数据以及集群管理、查询计划生成等工作。
BE:Backend,即 Doris 的后端节点。主要负责数据存储与管理、查询计划执行等工作。
BDBJE:Oracle Berkeley DB Java Edition, 在 Doris 中,使用 BDBJE 完成元数据操作日志的持久化、FE 高可用等功能。
Tablet:Tablet 是一张表实际的物理存储单元,一张表按照分区和分桶后在 BE 构成分布式存储层中以 Tablet 为单位进行存储,每个 Tablet 包括元信息及若干个连续的 RowSet。
RowSet:RowSet 是 Tablet 中一次数据变更的数据集合,数据变更包括了数据导入、删除、更新等。RowSet 按版本信息进行记录。每次变更会生成一个版本。
Version:由 Start、End 两个属性构成,维护数据变更的记录信息。通常用来表示 RowSet 的版本范围,在一次新导入后生成一个 Start、End 相等的 RowSet,在 Compaction 后生成一个带范围的 RowSet 版本。
Segment:表示 RowSet 中的数据分段,多个 Segment 构成一个 RowSet。
Compaction:连续版本的 RowSet 合并的过程成称为 Compaction,合并过程中会对数据进行压缩操作。
Key 列、Value 列:在 Doris 中,数据以表(Table)的形式进行逻辑上的描述。一张表包括行(Row)和列(Column),Row 即用户的一行数据,Column 用于描述一行数据中不同的字段。Column 可以分为两大类:Key 和 Value。从业务角度看,Key 和 Value 可以分别对应维度列和指标列。Doris 的 Key 列是建表语句中指定的列,建表语句中的关键字 unique key 或 aggregate key 或 duplicate key 后面的列就是 Key 列,除了 Key 列剩下的就是 Value 列。
数据模型:Doris 的数据模型主要分为 3 类:Aggregate、Unique、Duplicate。
Base 表:在 Doris 中,我们将用户通过建表语句创建出来的表称为 Base 表(Base Table),Base 表中保存着按用户建表语句指定方式存储的基础数据。
ROLLUP 表:在 Base 表之上,用户可以创建任意多个 ROLLUP 表。这些 ROLLUP 的数据是基于 Base 表产生的,并且在物理上是独立存储的。ROLLUP 表的基本作用,在于在 Base 表的基础上,获得更粗粒度的聚合数据,类似于物化视图。
Doris 支持两层数据划分:
第一层是 Partition(分区),支持 Range 和 List 的划分方式(类似于 MySQL 的分区表的概念)。若干个 Partition 组成一个 Table,Partition 可以视为是逻辑上最小的管理单元。数据的导入与删除,仅能针对一个 Partition 进行。
第二层是 Bucket(Tablet 也称为分桶),支持 Hash 和 Random 的划分方式。每个 Tablet 包含若干数据行,各个 Tablet 之间的数据没有交集,并且在物理上是独立存储的。Tablet 是数据移动、复制等操作的最小物理存储单元。
也可以仅使用一层分区,建表时如果不写分区的语句即可,此时 Doris 会生成一个默认的分区,对用户是透明的。
示意如下:
多个 Tablet 在逻辑上归属于不同的分区(Partition),一个 Tablet 只属于一个 Partition,而一个 Partition 包含若干个 Tablet。因为 Tablet 在物理上是独立存储的,所以可以视为 Partition 在物理上也是独立。
从逻辑上来讲,分区和分桶最大的区别就是分桶随机分割数据库,分区是非随机分割数据库。
为了提高保存数据的可靠性和计算时的性能,Doris 对每个表复制多份进行存储。数据的每份复制就叫做一个副本。Doris 按 Tablet 为基本单元对数据进行副本存储,默认一个分片有 3 个副本。建表时可在 PROPERTIES
中设置副本的数量:
PROPERTIES
(
"replication_num" = "3"
);
下图示例,有两个表分别导入 Doris,表 1 导入后按 3 副本存储,表 2 导入后按 2 副本存储。数据分布如下:
为了分桶裁剪,并且避免数据倾斜,同时也为了分散读 IO,提升查询性能,可以将 Tablet 的不同副本分散在不同机器上,查询时可以充分发挥不同机器的 IO 性能。
Doris 的每次导入可视为一个事务,会生成一个 RowSet 。而 RowSet 又包括多个 Segment,即 Tablet-->Rowset-->Segment
。那 BE 是如何存储这些文件的呢?
Doris 通过 storage_root_path
进行存储路径配置,Segment 文件存放在 tablet_id
目录下按 SchemaHash 管理。Segment 文件可以有多个,一般按照大小进行分割,默认为 256MB。存储目录以及 Segment 文件命名规则为:
${storage_root_path}/data/${shard}/${tablet_id}/${schema_hash}/${rowset_id}_${segment_id}.dat
进入 storage_root_path
目录,可以看到如下存储结构:
${shard}
:即上图中的 0、1。是存储目录下 BE 自动创建的,是随机的。会随着数据的增多而增多。
${tablet_id}
:即上图中的 15123、27003 等,即上面提到的 Bucket 的 ID。
${schema_hash}
:即上图中的 727041558、1102328406 等。因为一个表的结构可能会被变更,所以对每个 Schema 的版本生成一个 SchemaHash
,来标识该版本下的数据。
${segment_id}.dat
:其中前面的为 rowset_id
,即上图中的 02000000000000e3ba4924368a21695d8cc3cf8525f80789;${segment_id}
为当前 RowSet 的 segment_id
,从 0 开始递增。
Segment 整体的文件格式分为数据区域,索引区域和 Footer 三个部分,如下图所示:
Data Region: 用于存储各个列的数据信息,这里的数据是按需分 Page 加载的,其中 Page 中包含了列的数据,每个 Page 为 64k。
Index Region:Doris 中将各个列的 Index 数据统一存储在 Index Region,这里的数据会按照列粒度进行加载,所以跟列的数据信息分开存储。
Footer 信息:包含文件的元数据信息、内容的 Checksum 等。
Update:Update 语句目前仅支持 UNIQUE KEY 模型,并且只支持更新 Value 列。
Delete:1)如果是使用聚合类的表模型(AGGREGATE、UNIQUE),Delete 操作只能指定 Key 列上的条件;2)该操作会同时删除和此 Base Index 相关的 Rollup Index 的数据。
Insert:所有数据模型均可 Insert。
AGGREGATE 模型:Insert 阶段将增量的数据按照 Append 的方式写到 RowSet,查询阶段采用 Merge on Read 的方式进行进行合并。也就是说数据在导入时先写入一个新的 RowSet,写入后并不会执行去重,只有在发起查询时才会做多路并发排序,在进行多路归并排序时,会将重复的 Key 排在一起,并进行聚合操作。其中高版本 Key 的会覆盖低版本的 Key,最终只返回给用户版本最高的那一条记录。
DUPLICATE 模型:该模型写入与上述类似,读取阶段不会有任何聚合操作。
UNIQUE 模型:在 1.2 版本之前,该模型本质上是聚合模型的一个特例,行为与 AGGREGATE 模型一致。由于聚合模型的实现方式是读时合并(Merge on Read),因此在一些聚合查询上性能不佳。Doris 在 1.2 版本后引入了 Unique 模型新的实现方式,写时合并(Merge on Write),通过在写入时将被覆盖和被更新的数据进行标记删除,在查询的时候,所有被标记删除的数据都会在文件级别被过滤掉,读取出来的数据就都是最新的数据,消除掉了读时合并中的数据聚合过程,并且能够在很多情况下支持多种谓词的下推。
简单来讲,Merge on Write 的处理流程是:
对于每一条 Key,查找它在 Base 数据中的位置(RowSetid + Segmentid + 行号)【内存中维护了 Segment 级别的主键区间树,加速查询】
如果 Key 存在,则将该行数据标记删除。标记删除的信息记录在 Delete Bitmap 中,其中每个 Segment 都有一个对应的 Delete Bitmap。
将更新的数据写入新的 RowSet 中,完成事务,让新数据可见,即能够被用户查询到。
查询时,读取 Delete Bitmap,将被标记删除的行过滤掉,只返回有效的数据【对于命中的所有 Segment,按照版本从高到低进行查询】
下面介绍一下写入流程和读取流程的实现。
写入流程:写入数据时会先创建每个 Segment 的主键索引,再更新 Delete Bitmap。
读取流程:Bitmap 的读取流程如下图所示,从图片中我们可知:
一个请求了版本 7 的 Query,只会看到版本 7 对应的数据
读取 RowSet5 的数据时,会将 V6 和 V7 对它的修改产生的 Bitmap 合并在一起,得到 Version7 对应的完整 DeleteBitmap,用来过滤数据
在上图的示例中,版本 8 的导入覆盖了 RowSet1 的 Segment2 一条数据,但请求版本 7 的 Query 仍然能读到该条数据
UNIQUE 模型 Update 过程本质上是 Select+Insert。
Update 利用查询引擎自身的 Where 过滤逻辑,从待更新表中筛选出需要被更新的行,基于此维护 Delete Bitmap 以及生成新插入的数据。
接着再执行 Insert 逻辑,具体流程跟上述的 UNIQUE 模型写入逻辑类似。
Doris 的 Delete 也是会生成一个 RowSet,DELETE 模式下没有对数据进行实际删除操作,而是对数据删除条件进行了记录。存储在 Meta 信息中。当执行 Base Compaction 时删除条件会一起被合入到 Base 版本中。
Doris 在 UNIQUE KEY 模型下也支持了 LOAD_DELETE ,实现了通过批量导入要删除的 key 对数据进行删除,能够支持大量数据删除能力。整体思路是在数据记录中加入删除状态标识,在 Compaction 流程中会对删除的 Key 进行压缩。Compaction 主要负责将多个 RowSet 版本进行合并。
目前 Doris 主要支持两类索引:
内建的智能索引,包括前缀索引和 ZoneMap 索引。
用户手动创建的二级索引,包括倒排索引、 Bloomfilter 索引、 Ngram Bloomfilter 索引 和 Bitmap 索引。
其中 ZoneMap 索引是在列存格式上,对每一列自动维护的索引信息,包括 Min/Max,Null 值个数等等。这种索引对用户透明。
现在 Doris 里所有索引都是 BE 级别 Local 的,例如:倒排索引、 Bloomfilter 索引、 Ngram Bloomfilter 索引 和 Bitmap 索引、前缀索引和 ZoneMap 索引等
Doris 没有 Global Index。广义理解上,分区间 + 分桶键 这些也能算是 Global 的,但是比较粗粒度。
Doris 中将各个列的 Index 数据统一存储在 Segment 文件的 Index Region,这里的数据会按照列粒度进行加载,所以跟列的数据信息分开存储。这里以 Short Key Index 前缀索引为例进行介绍。
Short Key Index 前缀索引,是在 Key(AGGREGATE KEY、UNIQ KEY 和 DUPLICATE KEY)排序的基础上,实现的一种根据给定前缀列,快速查询数据的索引方式。这里 Short Key Index 索引也采用了稀疏索引结构,在数据写入过程中,每隔一定行数,会生成一个索引项。这个行数为索引粒度默认为 1024 行,可配置。该过程如下图所示:
其中,KeyBytes 中存放了索引项数据,OffsetBytes 存放了索引项在 KeyBytes 中的偏移。
Short Key Index 采用了前 36 个字节,作为这行数据的前缀索引。当遇到 VARCHAR 类型时,前缀索引会直接截断。 Short Key Index 采用了前 36 个字节,作为这行数据的前缀索引。当遇到 VARCHAR 类型时,前缀索引会直接截断。
在查询一个 Segment 中的数据时,根据执行的查询条件,会对首先根据字段加索引的情况对数据进行过滤。然后在进行读取数据,整体的查询流程如下:
首先,会按照 Segment 的行数构建一个 row_bitmap
,表示记录哪些数据需要进行读取。没有使用任何索引的情况下,需要读取所有数据。
当查询条件中按前缀索引规则使用到了 Key 时,会先进行 ShortKey Index 的过滤,可以在 ShortKey Index 中匹配到的 Oordinal 行号范围,合入到 row_bitmap
中。
当查询条件中列字段存在 BitMap Index 索引时,会按照 BitMap 索引直接查出符合条件的 Ordinal 行号,与 row_bitmap 求交过滤。这里的过滤是精确的,之后去掉该查询条件,这个字段就不会再进行后面索引的过滤。
当查询条件中列字段存在 BloomFilter 索引并且条件为等值(eq,in,is)时,会按 BloomFilter 索引过滤,这里会走完所有索引,过滤每一个 Page 的 BloomFilter,找出查询条件能命中的所有 Page。将索引信息中的 Ordinal 行号范围与 row_bitmap
求交过滤。
当查询条件中列字段存在 ZoneMap 索引时,会按 ZoneMap 索引过滤,这里同样会走完所有索引,找出查询条件能与 ZoneMap 有交集的所有 Page。将索引信息中的 Ordinal 行号范围与 row_bitmap
求交过滤。
生成好 row_bitmap
之后,批量通过每个 Column 的 OrdinalIndex 找到到具体的 Data Page。
批量读取每一列的 Column Data Page 的数据。在读取时,对于有 Null 值的 Page,根据 Null 值位图判断当前行是否是 Null,如果为 Null 进行直接填充即可。
Doris 通过 Compaction 将增量聚合 RowSet 文件提升性能,RowSet 的版本信息中设计了有两个字段 Start、End 来表示 Rowset 合并后的版本范围。未合并的 Cumulative RowSet 的版本 Start 和 End 相等。Compaction 时相邻的 RowSet 会进行合并,生成一个新的 RowSet,版本信息的 Start、End 也会进行合并,变成一个更大范围的版本。另一方面,Compaction 流程大大减少 RowSet 文件数量,提升查询效率。
如上图所示,Compaction 任务分为两种,Base Compaction 和 Cumulative Compaction。cumulative_point
是分割两种策略关键。
可以这样理解:
cumulative_point
右边是从未合并过的增量 RowSet,其每个 RowSet 的 Start 与 End 版本相等;
cumulative_point
左边是合并过的 RowSet,Start 版本与 End 版本不等。
Base Compaction 和 Cumulative Compaction 任务流程基本一致,差异仅在选取要合并的 InputRowSet 逻辑有所不同。
在一个 Segment 中,数据始终按照 Key(AGGREGATE KEY、UNIQ KEY 和 DUPLICATE KEY)排序顺序进行存储,即 Key 的排序决定了数据存储的物理结构,确定了列数据的物理结构顺序。
所以 Doris Compaction 过程是基于 AGGREGATE KEY、UNIQ KEY 和 DUPLICATE KEY 来进行的。
为了实现跨集群数据复制功能,Doris 引入了 Binlog 机制。通过 Binlog 机制自动记录数据修改记录和操作,以实现数据的可追溯性,同时还可以基于 Binlog 回放机制来实现数据的重放和恢复。
在开启 Binlog 属性后,FE 和 BE 会将 DDL/DML 操作的修改记录持久化成 Meta Binlog 和 Data Binlog。
Meta Binlog:Doris 对 EditLog 的实现进行了增强,以确保日志的有序性。通过构建一个递增序列的 LogID,对每个操作进行准确记录,并按顺序持久化。这种有序的持久化机制有助于保证数据的一致性。
Data Binlog:在 FE 发起 Publish Transaction 的时候,BE 会执行对应的 Publish 操作,BE 会将这次 Transaction 涉及 RowSet 的元数据信息写入以 rowset_meta
为前缀的 KV 中,并持久化到 Meta 存储中,提交后会把导入的 Segment Files 链接到 Binlog 文件夹下。
Doris BE 的 3 副本没有主从的概念,采用 Quorum 算法保证多副本写入。
在写入过程中,FE 会判断每一个 Tablet 成功写入数据的副本数量是否超过了 Tablet 副本总数的一半,如果每一个 Tablet 成功写入数据的副本数量都超过 Tablet 副本总数的一半(多数成功),则 Commit Transaction 成功,并将事务状态设置为 COMMITTED;COMMITTED 状态表示数据已经成功写入,但是数据还不可见,需要继续执行 Publish Version 任务,此后,事务不可被回滚。
FE 会有一个单独的线程对 Commit 成功的 Transaction 执行 Publish Version,FE 执行 Publish Version 时会通过 Thrift RPC 向 Transaction 相关的所有 Executor BE 节点下发 Publish Version 请求,Publish Version 任务在各个 Executor BE 节点异步执行,将数据导入生成的 RowSet 变为可见的数据版本。
为什么会有 Publish 机制:类似于 MVCC,如果没有 Publish 机制,用户可能读到还没有提交的数据。
如果表为 3 副本,只写入成功 1 个副本会怎样:这个时候事务会 ABORTED
如果表为 3 副本,只写入成功 2 副本会怎样:这个时候事务会 COMMITTED,Doris FE 会定期执行 Tablet 监控巡检,如果发现 Tablet 副本异常,会生成 Clone 任务,Clone 一个新的副本。
为什么用户执行完 Insert Into,立即执行查询,结果可能为空呢:原因是事务还没有 Publish
元数据层面,Doris 采用 Paxos 协议以及 Memory + Checkpoint + Journal 的机制来确保元数据的高性能及高可靠。
元数据的数据流具体过程如下:
只有 Leader FE 可以对元数据进行写操作。写操作在修改 Leader 的内存后,会序列化为一条 Log,按照 key-value
的形式写入 BDBJE。其中 Key 为连续的整型,作为 log id
,Value 即为序列化后的操作日志。
日志写入 BDBJE 后,BDBJE 会根据策略(写多数 / 全写),将日志复制到其他 Non-Leader 的 FE 节点。Non-Leader FE 节点通过对日志回放,修改自身的元数据内存镜像,完成与 Leader 节点的元数据同步。
Leader 节点的日志条数达到阈值(默认 10w 条)并且满足 Checkpoint 线程执行周期(默认六十秒)。Checkpoint 会读取已有的 Image 文件,和其之后的日志,重新在内存中回放出一份新的元数据镜像副本。然后将该副本写入到磁盘,形成一个新的 Image。之所以是重新生成一份镜像副本,而不是将已有镜像写成 Image,主要是考虑写 Image 加读锁期间,会阻塞写操作。所以每次 Checkpoint 会占用双倍内存空间。
Image 文件生成后,Leader 节点会通知其他 Non-Leader 节点新的 Image 已生成。Non-Leader 主动通过 HTTP 拉取最新的 Image 文件,来更换本地的旧文件。
BDBJE 中的日志,在 Image 做完后,会定期删除旧的日志。
解释:
元数据的每次更新,都首先写入到磁盘的日志文件中,然后再写到内存中,最后定期 Checkpoint 到本地磁盘上。
相当于是一个纯内存的一个结构,也就是说所有的元数据都会缓存在内存之中,从而保证 FE 在宕机后能够快速恢复元数据,而且不丢失元数据。
Leader、Follower 和 Observer 它们三个构成一个可靠的服务,单机的节点故障的时候其实基本上三个就够了,因为 FE 节点毕竟它只存了一份元数据,它的压力不大,所以如果 FE 太多的时候它会去消耗机器资源,所以多数情况下三个就足够了,可以达到一个很高可用的元数据服务。
用户可以使用 MySQL 连接任意一个 FE 节点进行元数据的读写访问。如果连接的是 Non-Leader 节点,则该节点会将写操作转发给 Leader 节点。
转载自隐形 (邢颖) 网易资深数据库内核工程师