Taxonomy of fossil occurrences（化石记录的分类）
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- 描述
- 用法
- 参数
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- 如果要检索与此数据库中输入的整个发生记录集相对应的分类树，则可以使用以下参数
- 以下参数可用于按各种条件查询产出记录
- 以下参数可用于筛选所选内容
- 以下参数还可用于根据分类筛选结果列表
- 以下参数可用于生成数据存档
- 您可以使用以下参数选择要检索的额外信息，以及要获取记录的顺序
- 方法
- 响应结果
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- 1：basic
- 2：attr
- 3：common
- 4：full
- 5： parent
- 6： immparent
- 7： refattr
- 8： app
- 9： occapp
- 10： size
- 11： class
- 12： classext
- 13： subcounts
- 14： ecospace
- 15：etbasis
- 16：ttaph
- 17：seq
- 18：img
- 19：ref
- 20：ent
- 21：entname
- 22：crmod
- 23：summary
- 格式
- 术语表
描述
此操作返回一组选定化石产出记录的分类层次结构。您可以使用对 occs/list 操作有效的任何参数选择要分析的事件集。您可以使用具有相同参数的两种操作发出请求，这将为您提供实例列表和按分类单元列出的摘要表。如果包括subcounts，则每个分类单元记录将包括该分类单元中包含的选定一组出现的物种、属等的产出记录。
此操作的结果按层次结构顺序报告所选匹配项集中出现的每个分类单元。它包括每个列出的分类单元具体确定的产出记录，以及包括所有子分类单元在内的分类单元的产出记录总数。它还包括每个分类单元中出现在选定事件集中的物种、属、科和目的数量。还会为每个分类报告父分类标识符，以便您可以将结果记录组织到其适当的层次结构中。
用法
- /data1.2/occs/taxa.txt?base_name=Cetacea&interval=Miocene&show=attr
"orig_no","taxon_no","record_type","flags","taxon_rank","taxon_name","taxon_attr","difference","accepted_no","accepted_rank","accepted_name","parent_no","container_no","reference_no","is_extant","n_occs"
"36652","81220","txn","B","unranked clade","Cetacea","(Brisson 1762)","","36652","unranked clade","Cetacea","87634","","16880","extant","3199"
"134057","134057","txn","","unranked clade","Pelagiceti","Uhen 2008","","134057","unranked clade","Pelagiceti","36652","","28136","extant","3046"
"63145","63145","txn","","unranked clade","Neoceti","Fordyce and de Muizon 2001","","63145","unranked clade","Neoceti","134057","","10151","extant","3046"
- /data1.2/occs/taxa.txt?strat=green river fm&rank=genus-order&show=attr
"orig_no","taxon_no","record_type","flags","taxon_rank","taxon_name","taxon_attr","difference","accepted_no","accepted_rank","accepted_name","parent_no","container_no","reference_no","is_extant","n_occs"
"54919","54919","txn","","order","Ericales","Berchtold and Presl 1820","","54919","order","Ericales","55354","","76044","extant","2"
"55618","55618","txn","","family","Styracaceae","de Candolle and Sprengel 1821","","55618","family","Styracaceae","54919","","8820","extant","1"
"418963","418963","txn","","genus","Styrax","Linnaeus 1753","","418963","genus","Styrax","55618","","8628","extant","1"
参数
如果要检索与此数据库中输入的整个发生记录集相对应的分类树，则可以使用以下参数
请谨慎使用，因为结果集将包含超过 250，000 条记录，并且大小至少为 50 MB。
- all_records：选择在数据库中输入的所有匹配项，具体取决于您可能指定的任何其他参数。此参数不需要任何值。
您还可以通过指定下面列出的参数的某种组合来选择此列表的子集。
以下参数可用于按各种条件查询产出记录
*除了特别说明外，您可以任意组合使用它们。*如果不指定all_records，则必须从以下列表中至少指定一个选择参数。
- occ_id：以逗号分隔的化石产出记录标识列表。选择指定的产出记录，前提是它们满足此请求的其他参数。您也可以使用参数名称 id。您还可以将此参数与任何其他参数一起使用，以根据其他条件筛选已知的匹配项列表。
- coll_id：以逗号分隔的采集记录标识列表。选择与指定采集记录相关的所有化石产出记录，前提是采集记录满足此请求的其他参数。
- clust_id：返回仅与指定地理集群相关的记录。您可以指定一个或多个集群 ID，以逗号分隔。
- coll_match：返回与collection_name和collection_aka字段匹配的字符串。仅返回属于匹配的采集记录的产出记录。字符串可以包含通配符 % 和 _ 。事实上，除非你在字符串的开头和/或结尾加上%，否则你不会匹配到任何结果。
- coll_re：与coll_match相似，唯一不同在于此项接收正则表达式。你可以使用 | 二者或多者择一，可以使用包括 \ 在内的所有标准正则表达式。
- base_name：仅返回与特定分类名相关的记录，包括所有亚类群和异名。您可以用逗号分隔来指定多个名称。您可以使用 ^ 排除掉任意名称。例如，Osteichthyes^Tetrapoda 将会选择除Tetrapoda外的所有Osteichthyes记录。
- taxon_name：仅返回与特定分类名相关的记录，包括所有异名。您可以用逗号分隔来指定多个名称。名称可以包含通配符，但如果匹配到了不止一个名称，那么只会使用数据库中产出记录数量最多的那个。
- match_name：仅返回与特定分类名相关的记录。您可以用逗号分隔来指定多个名称。名称可以包含通配符 % 和 _ ，所有与匹配到的名称相关的产出记录都会返回。将会忽略掉异名。此项比起分类学匹配而言，更像是语法匹配。
- immediate：您可以与base_name，base_id或taxon_name一起设置此项。设置此项会忽略掉指定名称的异名。此参数不需要值，在请求中包含此参数即可。
- base_id：仅返回与特定分类名相关的记录，包括所有亚类群和异名。您可以用逗号分隔来指定多个ID。请注意，您最多可以指定taxon_name、taxon_id、base_name和 base_id之一。
- taxon_id：仅返回与特定分类名相关的记录，不包括亚类群和异名。您可以用逗号分隔来指定多个ID。
- exclude_id：排除掉与指定类群ID相关的分类名称或其下级名称。这是 **^**的另一种方式。
- idreso：选择与指定分类阶元匹配的产出记录，或将同属/同科的产出记录合并。可接受的值有：
species：仅选择鉴定为种的产出记录
genus：仅选择鉴定到属或种的产出记录
family：仅选择鉴定到科或属或种的产出记录
lump_genus：仅选择鉴定到属或种的产出记录，并将同一采集记录中同属的所有产出记录合并为单条记录
lump_gensub*：仅选择鉴定到属或种的产出记录，并将同一采集记录中同属/亚属的所有产出记录合并为单条记录
- idtype：本参数决定如何处理重新鉴定的产出记录。可接受的值包括：
latest：仅选择每项产出记录的最新鉴定，忽略掉其余鉴定。此值为默认值。
orig：仅选择每项产出记录的原始鉴定，忽略掉其余鉴定。
reid：选择被重新鉴定的产出记录的所有鉴定，包括原始鉴定。忽略数据库中没有重新鉴定记录的产出记录。这可能造成每项产出记录返回多条记录。注意，如果您指定了一个分类名称，那么不符合该名称的鉴定将被忽略。您可以通过按ID专门查询您感兴趣的产出记录来找到它们，加上idtype=all。
all：选择所有匹配其他搜索参数的鉴定。这可能会导致为给定产出记录返回多条记录。
- idqual：此参数根据其分类修饰符选择或排除产出记录。允许的值包括：
any： 选择所有匹配项，而不考虑修饰符。这是默认值。
certain：排除用以下任何修饰符标记的所有匹配项：aff. / cf. / ? / “” / informal / sensu lato.
genus_certain：类似certain，但只看属/亚属，忽略物种修饰符。
uncertain：选择用以下任何修饰符标记的所有匹配项：aff. / cf. / ? / “” / informal / sensu lato.
new：仅选择标有以下项之一的匹配项：n. gen. / n. subgen. / n. sp.
- idmod：此参数根据分类修饰符的任意组合选择或排除产出记录。如果您需要选择无法通过 idqual 获得的修饰符组合，则可以使用此参数和/或 idgen 和 idspc。您可以指定以下一个或多个代码，以逗号分隔。如果第一个前面是 ！那么他们被排除在外。否则，仅包括标有至少一个的产出记录：
ns：n. sp.
ng：n. gen. or n. subgen.
af：aff.
cf：cf.
sl：sensu lato
if：informal
eg：ex gr.
qm：question mark（?)
qu：quotes（“”)
- idgenmod：此参数根据属和/或亚属名称上的分类修饰符的任意组合选择或排除产出记录。请参阅上面的 idmod。
- idspcmod：此参数根据物种名称上的分类修饰符的任意组合选择或排除产出记录。请参阅上面的 idmod。
- abundance：此参数仅选择具有特定种类丰度值的产出记录。接受的值为：
count：仅选择丰度类型为’individuals’, ‘specimens’ ‘grid-count’, ‘elements’, or 'fragments’的产出记录
coverage：仅选择丰度类型为“%-…”的产出记录
any：仅选择具有某种类型丰度信息的产出记录
您也可以附加一个冒号，后跟一个十进制数。这将仅选择丰度至少为指定最小值的产出记录。
- lngmin
- lngmax：仅返回当前经度在给定边界内的记录。如果指定其中一个参数，则必须同时指定这两个参数。如果提供的边界超出 -180° 到 180° 的范围，它们将被收缩到适当的范围内。例如，如果您指定 lngmin=270 和 lngmax=360，则查询将lngmin=-90 和 lngmax=0 进行处理。在这种情况下，查询结果中的所有经度值都将调整为落在您指定的实际数值范围内。
- latmin：仅返回当前纬度至少为给定值的记录。
- latmax：仅返回当前纬度最多为给定值的记录。
- loc：仅返回当前位置（经度和纬度）属于指定范围的记录，必须以 WKT 格式给出，坐标为经度和纬度值。
- plate：仅返回位于指定地质板块上的记录。如果此参数的值以 ！ 开头，则排除指定板块上的所有记录。如果此参数的值继续以 G 开头，则这些值将被解释为 GPlates 模型中的板块编号。如果是S，则这些值将被解释为 Scotese 模型中的板块编号。否则，它们将根据参数 pgm 的值进行解释。该值的其余部分必须是板块编号。
- pgm：指定返回古坐标时要使用的古地理模型。您可以从以下列表中指定一个或多个，以逗号分隔。如果未为此参数指定值，则默认模型为 gplates。
gplates：Wright et. al., 2013; Towards community-driven paleogeographic reconstructions
scotese：Scotese, C.R., 2021. An Atlas of Paleogeographic Maps: The Seas Come In and the Seas Go Out, Annual Reviews of Earth and Planetary Sciences, v. 49, p. 669-718
seton：Seton et. al., 2012; Global continental and ocean basin reconstructions since 200 Ma
- pgs：指定是返回每个采集记录的年龄范围的开头、中间还是结尾的古坐标。可接受的值为：early, mid, late。您可以指定多个作为逗号分隔的列表。
- cc：仅返回位置在指定地理区域内的记录。此参数的值应为一个或多个双字符国家/地区代码和/或三个字符的洲代码作为逗号分隔的列表。如果参数值以 ！ 开头，则属于这些区域的记录将被排除而不是包括在内。任何以 ^ 开头的国家/地区代码都将从过滤器中减去。例如：
ATA,AU：选择来自南极洲和澳大利亚的产出记录
NOA,SOA,^AR,^BO：选择来自北美和南美的实例，但不包括阿根廷或玻利维亚
!EUR,^IS：排除来自欧洲的产出记录，但来自冰岛的除外
- state：仅从指示为属于指定州或省的采集记录中返回产出记录。此信息不会记录所有采集记录，并且未检查其准确性。鉴于国家/地区之间有时会重复州名称，因此建议也使用 cc 参数指定国家/地区。
- county：仅返回指定属于指定县或其他次州级行政区划的采集记录中的产出记录。此信息不会记录所有采集记录，并且未检查其准确性。鉴于县名经常在州和国家/地区之间重复，建议您同时使用 state 参数指定州，并使用 cc 参数指定国家/地区。
- continent：仅返回地理位置在一个或多个指定大陆内的记录。此参数的值应为以逗号分隔的洲代码列表。此参数已弃用;请改用cc。
- strat：仅返回属于指定地质地层或地层内的记录。您可以指定多个，用逗号分隔。名称可以包括标准的SQL通配符 % 和 _ ，并且可以跟着’fm’，‘gp’，'mbr’中的任何一个。如果未给出这些后缀，则将选择所有匹配的地层名称。如果参数值以 ！ 开头，则与此层或地层关联的记录将被排除而不是包括在内。请注意，此参数仅通过字符串匹配进行解析。地层命名法目前在数据库中没有标准化，因此可能会出现拼写错误。
- formation：仅返回属于指定地层构造内的记录。此参数已弃用，请改用 strat。
- stratgroup：仅返回属于指定地层组内的记录。此参数已弃用，请改用 strat。
- member：仅返回属于指定地层成员的记录。此参数已弃用，请改用 strat。
- lithology：仅返回记录为来自任何指定岩性和/或岩性类型的记录。如果参数值字符串以 ！然后，将改为排除匹配的记录。如果符号 ^ 出现在任何岩性名称的开头，则所有后续值将从过滤器中减去。例如：carbonate,^bafflestone。
- envtype：仅返回记录为属于任何指定环境和/或环境区域的记录。如果参数值字符串以 ！然后，将改为排除匹配的记录。如果符号 ^ 出现在任何环境代码的开头，则将从筛选器中减去所有后续值。例如：terr,^fluvial,lacustrine or !slope,^carbonate。您可以指定以下一个或多个值作为逗号分隔的列表：
terr：任何陆相环境
marine：任何海相环境
carbonate：碳酸盐环境
silicic：硅碎屑环境
unknown：未知或不确定的环境
lacust：湖区
fluvial：河流区
karst：喀斯特地带
terrother：其他陆地区域
marginal：边缘海洋区
reef：礁石区
stshallow：浅潮下带
stdeep：深潮下带
offshore：近海区
slope：斜坡/盆地区
marindet：海洋不确定区
- interval_id：仅返回其时间在给定的地质时间间隔内（由数字标识符指定）的记录。如果指定多个间隔，则使用的时间范围将从最早指定间隔的开始到最晚指定间隔的结束的连续时间段。
- interval：仅返回其时空位置在命名的地质时间间隔内（由名称指定）内的记录。您可以指定多个间隔，用逗号或短划线分隔。如果指定多个间隔，则使用的时间范围将从最早指定间隔的开始到最晚指定间隔的结束的连续时间段。
- min_ma：仅返回其时间位置至少为此的记录，单位为Ma。
- max_ma：仅返回其时间位置至多为此的记录，单位为Ma。
- timerule：根据指定的规则解析时空位置，如下所示。对于多样性输出，此规则应用于将每个匹配项放入一个或多个时态条柱中，或者在与任何条柱不匹配时忽略该项。可用的规则包括：
contain：仅选择其时空位置严格包含在指定时间范围内的记录。这是最严格的规则。对于多样性输出，此规则保证每个匹配项最多落入一个时态图格，但许多实例将被忽略，因为它们的时间位置太宽而无法落入任何条柱中。
major：仅选择至少 50% 的时态位置范围落在指定时间范围内的记录。对于多样性输出，此规则还保证每个匹配项最多落入一个时态条柱。许多匹配项将被忽略，因为它们的时间位置宽度是任何重叠条柱的两倍多，但忽略的次数少于contain规则。这是默认时间规则，除非您专门选择一个时间规则。
buffer：仅选择其时间位置与指定时间范围重叠且完全位于此范围周围的“缓冲区”内的记录。这个缓冲区默认为古生代和中生代的1200万年，新生代的默认值为500万年。您可以使用参数timebuffer和late_buffer覆盖缓冲区宽度。对于多样性输出，某些事件将计为落入多个箱中。某些事件仍将被忽略，但比上述规则要少。
overlap：仅选择其时态位置与指定时间范围重叠任意数量的记录。这是最宽松的规则。对于多样性输出，将计算所有产出记录。许多人将被计入多个条箱中。
- timebuffer：解析时间局部性时覆盖默认缓冲期。该值必须以数百万年为单位给出。仅当timerule设置为buffer时，此参数才相关。
- latebuffer：解析时间局部性时，覆盖时间范围结束时的默认缓冲期。这允许缓冲区在间隔的后期与在早期结束时不同。该值必须以数百万年为单位给出。仅当timerule设置为buffer时，此参数才相关。
以下参数可用于筛选所选内容
如果您希望使用其中之一，并且尚未指定上面列出的任何选择参数，请使用 all_records。
- occs_created_before：仅选择与在指定日期或日期/时间之前创建的事件关联的记录。
- occs_created_after：仅选择与在指定日期或日期/时间之后创建的事件关联的记录。
- occs_modified_before：仅选择与在指定日期或日期/时间之前修改的事件关联的记录。
- occs_modified_after：仅选择与在指定日期或日期/时间之后修改的事件关联的记录。
- occs_authorized_by：仅选择与指定人员授权的事件关联的记录，这些事件由名称或标识符指示。
- occs_entered_by：仅选择与指定人员输入的由名称或标识符指示的事件关联的记录
- occs_modified_by：仅选择与指定人员修改的事件关联的记录，这些事件由名称或标识符指示
- occs_touched_by：仅选择与指定人员授权、输入或修改的事件关联的记录，这些事件由名称或标识符指示
- occs_authent_by：仅选择与由指定人员授权或输入的事件关联的记录，这些事件由名称或标识符指示
- taxa_created_before：仅选择与在指定日期或日期/时间之前创建的类群关联的记录。
- taxa_created_after：仅选择与在指定日期或日期/时间之后创建的类群关联的记录。
- taxa_modified_before：仅选择与在指定日期或日期/时间之前修改的类群关联的记录。
- taxa_modified_after：仅选择与在指定日期或日期/时间之后修改的类群关联的记录。
- taxa_authorized_by：仅选择与指定人员授权的类群关联的记录，由名称或标识符指示。
- taxa_entered_by：仅选择与指定人员输入的由名称或标识符指示的类群关联的记录
- taxa_modified_by：仅选择与指定人员修改的类群关联的记录，由名称或标识符指示
- taxa_touched_by：仅选择与指定人员授权、输入或修改的类群关联的记录，由名称或标识符指示
- taxa_authent_by：仅选择与由指定人员授权或输入的类群关联的记录，由名称或标识符指示
以下参数还可用于根据分类筛选结果列表
- taxon_status：仅选择标识到分类群且具有指定状态的产出记录。默认值为all。可接受的值包括：
all：选择与其他指定条件匹配的所有分类名称。这是默认值。
valid：仅选择分类有效的名称
accepted：仅选择不是初级同义词的分类有效名称
junior：仅选择作为初级同义词的分类有效名称
invalid：仅选择分类无效的名称，例如 nomina dubia
- pres：此参数指示是选择标识为遗迹分类群、形式分类群还是常规分类群的产出记录。默认值为 all，这将选择满足其他指定条件的所有记录。可以将以下一个或多个值指定为列表：
regular：选择常规分类群
form：选择形式分类群
ichno：选择遗迹分类群
all：选择所有分类群
- rank：仅返回与指定等级的分类学名称相关的记录，例如属。
- depth：仅返回的分类单元不超过层次结构中基本分类单元或分类单元下指定级别的级别数。
- extant：仅选择已确定为现存或非现存分类群的产出记录。接受的值为：yes, no。
以下参数可用于生成数据存档
最简单的方法是使用下载生成器表单。
- archive_title：此参数的值指示使用指定的标题创建存档，除非已存在存档。
- archive_replace：此参数的 true 值指示如果存在具有指定标题的现有存档，则其内容应替换为当前请求的输出。如果没有此参数，如果指定的标题与现有记录匹配，则将返回错误代码E_EXISTING。如果现有记录具有 DOI，则将返回错误E_IMMUTABLE，并且无法覆盖。
- archive_authors：此参数的值（如果有）将放入已创建或更新的存档记录的“作者”字段中。
- archive_desc：此参数的值（如果有）将放入已创建或更新的存档记录的“描述”字段中。
您可以使用以下参数选择要检索的额外信息，以及要获取记录的顺序
- show： 此参数用于选择要与每个分类单元的基本记录一起返回的其他信息。其值应为以下一项或多项，以逗号分隔：
1. full：返回化石产出记录所有附加信息的简写。目前包括以下区块：attr, class, plant, abund, coords, coll loc, paleoloc, prot, stratext, lithext, geo, comps, methods, ctaph, ecospace, ttaph, refattr。如果化石产出记录里增加了新数据块，full也会将其包含在内。如果您要构建一个URL，加入show=full是一个不错的选择。
2. attr：化石产出记录学术接受名的属性信息（作者和年份）。
3. app：该分类单元首次和最后一次出现的年龄，来自该数据库中记录的所有事件
4. occapp：正在分析的一组出现中每个分类单元的第一次和最后一次出现的年龄（不是绝对的第一次和最后一次出现的年龄）。
5. common：此分类单元的公用名（如果在数据库中输入了一个）。
6. parent：如果该分类单元的分类已输入数据库，则父分类单元的名称或其高级同义词（如果有）。
7. immparent：如果您想知道直接的父分类单元，则可以使用它代替父分类。如果直系父级是初级同义词，则将同时显示它及其高级同义词。
8. acconly：仅返回接受的名称，并禁止显示difference、accepted_name、accepted_rank和accepted_no，因为它们仅与不接受的名称相关。
9. size：出现在该数据库中的亚分类群的数量，包括分类单元本身。
10. class：类群的分类学信息：门、纲、目、科、属。 还包括类型分类（如果在数据库中输入了一个）。此信息也包含在nav中，因此不要同时指定两者。
11. classext：与class类似，但也包括相关的分类标识符。
12. subcounts：该数据库已知的亚类群数量，按等级汇总。
13. ecospace：关于这种生物所占据的生态位信息。仅有少数类群的此区块含值。在此查看该参数返回值的列表。
14. ttaph：埋葬学信息。也可以使用别名taphonomy。在此查看该参数返回值的列表。
15. etbasis：注释输出块ecospace，指示每条信息在哪个分类级别输入。
16. seq：标记此分类单元在树中的位置的序列号。
17. img： 与此分类单元相关联的图像标识符(如果有)。这些图片来自phylopic.org。
18. ref：化石产出记录的原始文献，格式化文本。如果没有原始文献，那么显示相关采集记录的原始文献。
19. refattr：原始文献的信息，作者和年份。
20. ent：命名、录入和编辑化石产出记录的人员ID。
21. entname：录入和编辑化石产出记录的人名。
22. crmod：化石产出记录的created和modified时间戳。
- order：此参数当前不起作用。它最终将允许您设置返回分类群的顺序。
当然还可以使用任何特殊参数，请参阅PBDB Data Service：Special parameters（特殊参数）。
方法
这个数据服务接受以下HTTP方法：GET，HEAD。
响应结果
使用此操作对HTTP请求的响应将包含以下列表中的字段。区块basic是一直显示的。其他的可以使用参数show来选择。
1：basic
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| orig_no |
oid |
此分类名称的唯一标识符 |
| taxon_no |
vid |
此分类名称的选定变体的唯一标识符。默认情况下，这是当前接受为最正确的变体。 |
| record_type |
typ |
此对象的类型：txn 表示分类。 |
| flags |
flg |
对于大多数记录，此字段将为空。否则，它将包含以下一个或多个字母：B——此分类单元是在查询中显式指定的分类之一。如果结果是子树，则表示“基部”。E——此分类单元在查询中指定为排除项。V——此分类名称是当前不接受的变体。I——此分类是一个遗迹分类群。F——此分类是一个形式分类群。 |
| taxon_rank |
rnk |
类群的分类阶元，从亚种到界 |
| taxon_name |
nam |
此分类的科学名 |
| difference |
tdf |
如果此名称是初级同义词或由于某种原因无效，则此字段会给出原因。然后，字段accepted_no和accepted_name指定应改用的名称。 |
| tax_status |
n/a |
这个名字的分类学地位，在达尔文核心词汇中。仅当选择了词汇表时，才会显示此字段。 |
| nom_status |
n/a |
这个名字的命名地位，在达尔文核心词汇中。仅当选择了词汇表时，才会显示此字段。 |
| accepted_no |
acc |
如果此名称是初级同义词或无效名称，则此字段将提供要在其位置使用的接受名称的标识符。否则，其值将与orig_no相同。在紧凑词汇表中，在这种情况下将省略此字段。 |
| accepted_rank |
acr |
如果accepted_no与orig_no不同，则此字段给出接受名称的排名。否则，其值将与taxon_rank相同。在紧凑词汇中，在这种情况下将省略此字段。 |
| accepted_name |
acn |
如果accepted_no与orig_no不同，则此字段提供接受的名称。否则，其值将与taxon_name相同。在紧凑词汇表中，在这种情况下将省略此字段。 |
| parent_no |
par |
父分类单元或其高级同义词（如果有）的标识符。此字段和以下字段仅在数据库知道该分类单元的分类时才可用。 |
| container_no |
ctn |
包含此分类的结果集中的分类单元的标识符，该分类单元可能是父级，也可能不是父级。此字段将仅出现在未指定基本分类单元的 occs/taxa 操作的结果中。在这种情况下报告的分类群是“经典”等级，而不是完整的分类等级。 |
| reference_no |
rid |
从中输入此名称的引用的标识符。 |
| is_extant |
ext |
如果这个分类单元今天在地球上存在，则为真，如果不是，则为假，如果未记录则不存在 |
| n_occs |
noc |
此数据库中被确定为属于该分类单元或其任何子分类单元的化石出现次数。 |
2：attr
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| taxon_attr |
att |
该分类名称的属性（作者和年份） |
3：common
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| common_name |
nm2 |
该分类单元的通用（白话）名称（如果有） |
4：full
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| common_name |
nm2 |
该分类单元的通用（白话）名称（如果有） |
5： parent
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| parent_name |
prl |
父分类单元的名称，或其高级同义词（如果有）。 |
6： immparent
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| parent_name |
prl |
父分类单元的名称，或其高级同义词（如果有）。 |
| immpar_no |
ipn |
直接父分类单元的标识符，即使它是初级同义词。 |
| immpar_name |
ipl |
直系父分类单元的名称，即使它是初级同义词。 |
7： refattr
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| ref_author |
aut |
输入此名称的参考文献的作者。请注意，如果参考文献是次要来源，则名称本身的作者可能会有所不同。 |
| ref_pubyr |
pby |
输入此名称的参考文献的出版年份。请注意，如果参考文献是次要来源，则名称本身的出版年份可能会有所不同。 |
8： app
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| firstapp_max_ma |
fea |
该分类单元首次出现在数据库中的最早年龄界限 |
| firstapp_min_ma |
fla |
该分类单元首次出现在数据库中的最晚年龄界限 |
| lastapp_max_ma |
lea |
该分类单元最后一次出现在数据库中的早期年龄限制 |
| lastapp_min_ma |
lla |
此分类单元在数据库中最后一次出现的后期期限 |
| early_interval |
tei |
此分类单元首次出现的间隔的名称，或其范围的开始时间。 |
| late_interval |
tli |
此分类单元最后出现的间隔的名称（如果与early_interval不同）。 |
9： occapp
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| firstocc_max_ma |
foa |
该分类单元在所分析的一组事件中首次出现的早期年龄界限。 |
| firstocc_min_ma |
fpa |
该分类单元在所分析的一组事件中首次出现的晚期界限。 |
| lastocc_max_ma |
loa |
该分类单元在所分析的一组事件中最后一次出现的早期年龄界限。 |
| lastocc_min_ma |
lpa |
该分类单元在所分析的一组事件中最后一次出现的晚期年龄界限。 |
10： size
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| taxon_size |
siz |
该分类单元中包含的数据库中分类单元的总数，包括其自身 |
| extant_size |
exs |
数据库中该分类单元中包含的现存分类群的总数，包括其自身 |
11： class
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| phylum |
phl |
该分类单元所属的门的名称 |
| class |
cll |
此分类单元所属纲的名称 |
| order |
odl |
此分类单元的目的名称 |
| family |
fml |
该分类单元所属的科的名称 |
| genus |
gnl |
该分类单元所属的属的名称。如果一个属是初级同义词，则可以将其列为出现在不同的属中;一个物种可能被列为出现在不同的属中，而不是它的名字表明它的属是否同义，但没有输入该物种的同义词意见。 |
| type_taxon |
ttl |
此分类的类型分类单元的名称（如果已知）。 |
12： classext
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| phylum_no |
phn |
该分类单元分类的门的标识符。这仅包含在classext扩展中。 |
| class_no |
cln |
对此分类单元进行分类的纲的标识符。 |
| order_no |
odn |
对此分类单元进行分类的目的标识符。 |
| family_no |
fmn |
对此事件进行分类的科的标识符。 |
| genus_no |
gnn |
对此事件进行分类的属的标识符。 |
| subgenus_no |
sgn |
对此事件进行分类的亚属的标识符（如果有）。 |
| type_taxon_no |
ttn |
此分类单元的类型分类单元的标识符（如果已知）。 |
13： subcounts
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| n_orders |
odc |
此分类单元中的目数。对于从一组出现次数派生的分类群列表，这将是该集中出现的目数。否则，这将是数据库已知的此分类单元中的目总数。 |
| n_families |
fmc |
该分类单元中的科数，根据与上述n_orders相同的规则。 |
| n_genera |
gnc |
该分类单元内的属数，根据与上述n_orders相同的规则。 |
| n_species |
spc |
该分类单元内的物种数量，根据与上述n_orders相同的规则。 |
14： ecospace
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| taxon_environment |
jev |
发现这种生命形式的一般环境或环境。参阅生态学和埋葬学术语 |
| environment_basis |
jec |
指定从其中继承环境信息的分类。 |
| motility |
jmo |
生物是否有运动、附着和/或附生，以及它的运动方式(如果有的话)。参阅生态学和埋葬学术语 |
| life_habit |
jlh |
这种生物的一般生活方式和位置。参阅生态学和埋葬学术语 |
| vision |
jvs |
这种生物拥有的视觉程度。参阅生态学和埋葬学术语 |
| diet |
jdt |
这种生物的一般饮食或摄食方式。参阅生态学和埋葬学术语 |
| reproduction |
jre |
这种生物的繁殖方式。参阅生态学和埋葬学术语 |
| ontogeny |
jon |
简要描述这种生物的个体发生。参阅生态学和埋葬学术语 |
| ecospace_comments |
jcm |
如果有其他关于生态空间的评论的话。 |
15：etbasis
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| motility_basis |
jmc |
指定为其设置运动信息的分类群。埋藏学和生态空间信息继承自父类群，除非设置了特定的值。 |
| life_habit_basis |
jhc |
指定为其设置生活习惯信息的分类单元。参见上面的motitiy_basis。只有在ecospace区块也包含的情况下，这些字段才会被包含。 |
| vision_basis |
jvc |
指定为其设置视觉信息的分类单元。参见上面的motitiy_basis。只有在ecospace区块也包含的情况下，这些字段才会被包含。 |
| diet_basis |
jdc |
指定为其设置饮食信息的分类单元。参见上面的motitiy_basis。只有在ecospace区块也包含的情况下，这些字段才会被包含。 |
| reproduction_basis |
jrc |
指定为其设置繁殖信息的分类单元。参见上面的motitiy_basis。只有在ecospace区块也包含的情况下，这些字段才会被包含。 |
| ontogeny_basis |
joc |
指定为其设置个体发育信息的分类单元。参见上面的motitiy_basis。只有在ecospace区块也包含的情况下，这些字段才会被包含。 |
| taphonomy_basis |
jtc |
指定为其设置埋葬信息的分类。参见上面的motitiy_basis。只有在ecospace区块也包含的情况下，这些字段才会被包含。 |
16：ttaph
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| composition |
jco |
这种生物骨骼部分的组成。参阅生态学和埋葬学术语 |
| architecture |
jsa |
内部骨骼结构。参阅生态学和埋葬学术语 |
| thickness |
jth |
表明骨骼的相对厚度。参阅生态学和埋葬学术语 |
| reinforcement |
jsr |
显示骨骼加固。参阅生态学和埋葬学术语 |
17：seq
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| lft |
lsq |
此数字给出了分类单元在分类树的预序遍历中的位置。 |
| rgt |
rsq |
此数字大于或等于该分类单元的所有子分类单元的序列号的最大值，并且小于序列中任何后续分类单元的序列。您可以使用它以及 lft 来确定子分类单元关系。 |
18：img
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| image_no |
img |
如果这个值是非零，你可以使用它来构造图像url，使用taxa/thumb和taxa/icon。 |
19：ref
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| primary_reference |
ref |
与此记录关联的主要引用（作为格式化文本） |
20：ent
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| authorizer_no |
ati |
授权输入此记录的人员的标识符 |
| enterer_no |
eni |
实际输入此记录的人员的标识符。 |
| modifier_no |
mdi |
上次修改此记录的人员的标识符（如果已修改）。 |
21：entname
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| authorizer_no |
ati |
授权输入此记录的人员的标识符 |
| enterer_no |
eni |
实际输入此记录的人员的标识符。 |
| modifier_no |
mdi |
上次修改此记录的人员的标识符（如果已修改）。 |
| authorizer |
ath |
授权输入此记录的人员的姓名 |
| enterer |
ent |
实际输入此记录的人员的姓名 |
| modifier |
mdf |
上次修改此记录的人员的姓名（如果已修改）。 |
22：crmod
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| created |
dcr |
创建此记录的日期和时间。 |
| modified |
dmd |
上次修改此记录的日期和时间。 |
摘要块将由以下列表中的字段组成。
23：summary
| 字段名（pbdb） |
字段名（com） |
描述 |
| n_occs |
noc |
在计算此分类树的过程中扫描的出现次数。 |
| missing_taxon |
mtx |
由于此数据库中的分类层次结构不完整而跳过的出现次数。例如，某些属尚未归入其适当的科，因此，如果您正在计算科，则将跳过这些属中的出现次数。 |
格式
以下响应格式可用于此操作。必须通过向 URI 路径添加适当的后缀来为请求选择所需的格式。
| 格式 |
后缀 |
文档 |
| JSON |
.json |
JSON format |
| Comma-separated text |
.txt |
Text formats |
| Comma-separated text |
.csv |
Text formats |
| Tab-separated text |
.tsv |
Text formats |
术语表
| 术语表 |
名称 |
默认格式 |
描述 |
| PaleobioDB field names |
pbdb |
txt, csv, tsv |
PBDB词汇表来自数据库中的基础字段名和值，并增加了一些新字段。在大多数情况下，使用此词汇表的响应将直接与从PBDB Classic接口下载的响应相比较。此词汇表是Text格式响应的默认词汇。 |
| Compact field names |
com |
json |
Compact词汇表是一组3个字符的字段名，旨在将响应消息的大小最小化。这是JSON格式响应的默认值。一些字段值被类似地简化，而其他字段值则被完整地传递。 |
