R语言【taxa】——as_taxon()：转换为 taxon 对象
Package taxa version 0.4.2
Description
将其他对象转换为 taxon 向量。taxon 构造器可能将 基础向量转换为 taxon 向量。
Usage
as_taxon(x, ...)Arguments
参数【x】：要转换为 taxon 向量的对象。
参数【...】：其余参数。
Examples
x <- taxonomy(taxon(name = c('Carnivora', 'Felidae', 'Panthera', 'Panthera leo',
'Panthera tigris', 'Ursidae', 'Ursus', 'Ursus arctos'),
rank = c('order', 'family', 'genus', 'species',
'species', 'family', 'genus', 'species'),
id = taxon_id(c('33554', '9681', '9688', '9689',
'9694', '9632', '9639', '9644'),
db = 'ncbi'),
auth = c('Bowdich, 1821', 'Fischer de Waldheim, 1817', 'Oken, 1816', 'L., 1758',
'L., 1758', 'Fischer de Waldheim, 1817', 'L., 1758', 'L., 1758')),
supertaxa = c(NA, 1, 2, 3, 3, 1, 6, 7))
names(x) <- letters[1:8]
as_taxon(x)
a
33554|Carnivora Bowdich 1821|order
b
9681|Felidae Fischer de Waldheim 1817|family
c
9688|Panthera Oken 1816|genus
d
9689|Panthera leo L. 1758|species
e
9694|Panthera tigris L. 1758|species
f
9632|Ursidae Fischer de Waldheim 1817|family
g
9639|Ursus L. 1758|genus
h
9644|Ursus arctos L. 1758|species
Rank levels: order < family < genus < species > as_taxon(c('Carnivora', 'Felidae', 'Panthera', 'Panthera leo'))
[1] Carnivora Felidae Panthera Panthera leo
> as_taxon(factor(c('Carnivora', 'Felidae', 'Panthera', 'Panthera leo')))
[1] Carnivora Felidae Panthera Panthera leo