生信小鹏

报错处理——object ‘CsparseMatrix_validate‘ not found

在使用Seurat进行单细胞分析时，使用FindNeighbors函数功能时，出现下面的报错

Error in validityMethod(as(object, superClass)) :    object 'CsparseMatrix_validate' not found

这是Matrix这个包有问题，需要更新Rtools，并重新装载Matrix这个包，具体可执行下面的方法

install.packages('installr')
library(installr)
install.Rtools()
install.packages('Matrix')
library(Matrix)

然后退出R重新运行就可以正常使用Seurat中FindNeighbors函数功能

参考文章
object ‘CsparseMatrix_validate‘ not found
https://github.com/satijalab/seurat/issues/6746

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