MIMIC-IV- v2.0带着随访数据来啦

更多关于mimic数据库的知识，欢迎大家关注我的公众号：科研杂录

MIMIC-IV v2.0 已于 2022 年 6 月 12 日发布。此次新增的数据包括院外死亡日期、来自在线病历系统的信息（包括身高和体重），以及 ICU 持续输注的更多详细信息。

一、主要变化

①移除了core模块，目前admissions, patients 和 transfers 表格存在hosp模块里；

②移除了新生儿数据，后续将与新生儿重症监护室的数据一起在其他项目中单独发布。

二、ICU模块

1、icustays

由于patient表的变化，大约700个stayids（约1%）发生了改变。

2、chartevents, d_items

chartevents表中新增加了itemid=220001，以记录来自MetaVision 的1000多个问题 。大多数记录在案的问题与患者的护理计划有关，并在护士轮班期间（早上 7 点或晚上 7 点）记录在案。

3、ingredientevents

这是一个与 inputevents关联的新表。在 inputevents表中跟踪的每一次静脉给药都与一组成分相关。这些成分包括含水量、热量信息等。  inputevents表支持营养学相关研究，并通过对所有水成分求和以用于评估fluid input。目前，这些成分已从inputevents表中分离出来，添加至新表ingredientevents中。

4、inputevents

仅删除了包含空值的列：cancelreason

5、procedureevents

删除了以下仅包含空值的列：

totalamount, totalamountuom, cancelreason, comments_editedby, comments_canceledby, comments_date, secondaryordercategoryname.

三、Hops模块

1、admissions

修复了患者通过急诊入院时缺少 edregtime 和 edouttime 的问题。

2、patients

①dod现在填充了来自州死亡记录的院外死亡。对于入住 ICU 的患者，这一变化已将死亡日期记录从 8,223 条增加到 23,844 条（即，2.0版本中另外有15621名ICU患者的院外死亡记录）。也就是说，2.0版本的mimic iv中有随访数据了！

②2.0版本中患者纳入MIMIC中的机制有所不同。很大程度上优化了合并同一患者多个医疗记录号码的逻辑。由于此更改，大多数表的数据内容都发生了变化。大约有1%的stays受到了影响。

3、transfers

修复了hadm_id为NULL的 ED 患者（即只入ED没有入院的患者）的outtime问题。原先存在的问题导致transfers表中所有hadm_id为NULL的患者在院内停留时间是错误的。2.0版本中已经修正了outtime列的这个问题。

4、labevents, d_labitems

①更改了d_labitems表中的43项itemid，具体见下图。

②loinc_code列已被删除。将在官方git代码仓中协作开发，其初始值将来自医院系统。

③许多以前在comments字段中有值的实验室指标现在在value字段中也有值。

5、microbiologyevents

microbiologyevents表中增加了新的病原体、检验、标本和抗生素。

6、omr

 omr是一个新添加的表。 此数据的来源是在线医疗记录，其中包含有个人健康状况的多种信息。从 v2.0 开始， omr 表具有以下信息：血压、身高、体重、BMI和估计肾小球滤过率 (eGFR)。这些值可从住院和门诊访问中获得，并且在许多情况下，患者住院前的“基线”值是可用的。

7、prescriptions

formulary_drug_cd列已添加回来（以前在MIMIC-III中有）。此列与 emar_detail表中product_code列具有相同的值。

总结

MIMIC-IV--2.0主要更新了院外随访数据，新增了两个表，并且把原来的3个模块缩减为hosp和icu2个模块，另外，MIMIC-IV-1.0数据库安装代码已经不适用于MIMIC-IV--2.0的新数据集了，目前官方github中还没有更新2.0的安装代码，后续推文我们将教大家怎么安装！

参考链接：

https://physionet.org/content/mimiciv/2.0/

---

更多关于临床公共数据库挖掘相关知识可同时关注以下公众号