【论文文献管理与同步】Zotero + 坚果云 + Zotfile ：多设备论文管理与同步

前言

• 网上不同教程实在是太乱了
  很多教程要么太复杂，要么太简单，不是很理解有些步骤在干什么
  这里以最容易理解的方式作为配置教程

下载

• Zotero官网下载
  zotero为论文文献管理软件，当然存pdf,txt,md,jpeg,caj等都行。
  
  没什么需求的话直接下载左边的即可，不需要和浏览器链接。
  支持windows,mac,linux,ios
  不同设备是不同版本的
• 坚果云官网
  坚果云为同步网盘
  需要下载客户端，同样不同的设备下载对应版本
• zotfile插件官网
  zotfile为zotero可用的一个重要插件
  用于文献文件的自动化管理
  方便多设备在坚果云中直接阅读论文（否则为zotero默认的，随机英文乱码文件夹中找论文，痛苦）

注册账号

Zotero账号

• 打开 zotero，点击上侧 [编辑] → [首选项]
  
  在框1处，可以选择注册和登录账号。
  在框2处，打钩并选择 WebDAV
  在框3处，输入和我一样的网址，用户名和密码等会获取。
  注意，最下面的勾不选择。

坚果云账号

• 打开坚果云网页版 (链接同上)，点击右上角个人名字，账户信息
  
• 点击 安全选项
  右侧点击 添加应用，名称输入 Zotero 即可。然后它就会给你这个应用的密码
  
• 回到之前的 首选项，输入你的注册坚果云的用户名(邮箱)，输入刚才的密码（不是你的账户的密码），点击验证服务器，第一次输入会有询问，一般默认点点确定就会同步成功。

导入 Zotfile 插件

• 打开 Zotero，上方点击 [工具] → [添加组件]
  点击右上角齿轮，点击从文件中添加附件，选择 zotfile 插件即可。
  
• 成功后会在这里显示该插件。
  

同步配置

同步方式的说明

• 首先理解下我们要同步什么
• 第一个是条目(一个zotero中存储的文件就叫条目)信息
  这些红框圈出来的都算条目信息
  条目信息通过我们登录 zotero 账号即可自动同步
  （同步按钮在右上方的绿色箭头）
  
• 第二个就是附件，一般为pdf，md，caj等文件
  通过 zotero 自带的同步我们只支持几百兆的文件同步
  所以我们通过使用 坚果云 进行更多文件的同步
  坚果云的免费版，每个月可以上传下载的流量见下。基本妥妥是够的。
  
  

同步文件夹的说明

• 我们需要明确，一共有两个论文存储的文件夹。
  第一个是 zotero 管理论文文件存储，它存储每个条目的具体信息和其他一些脚本文件。
  我这里定义名字为 ZoteroStorage
  其中 storage 子文件主要存储条目信息。
  
• 打开 storage，发现为乱码文件夹。
  
• 每个文件夹下存储某一条目的信息和附件
  
• 第二个是我们单独存储文件附件的文件夹
  我这里定义为 ZoteroRepo
  我们目的就是可以实现这样的附件提取与同步，方便我们在坚果云中跨设备直接查看。（或者你打开zotero再点击条目查看一样）
  
• 默认的 ZoteroStorage 在C盘，一般都不希望这样。
  所以可以在你希望的盘中创建自己的 ZoteroStorage 和 ZoteroRepo 文件夹。

Zotero 同步配置

• 仍然打开 [编辑] → [首选项]
  选择 高级，选中下面 文件和文件夹
  
  在框1处输入 ZoteroRepo 的目录，存储pdf附件
  在框2处输入 ZoteroStorage 的目录，存储条目信息
  注意两个文件夹功能不同，不能搞反
  一般选择使用相对路径。

ZotFile 同步配置

• 打开 [工具] → [ZotFile Preferences]
  打开默认的标签页 General Settings
  
  在框1处，输入 ZoteroStorage 文件夹下的子文件夹 storage ！！！ (有好几个教程配的文字说明我以为是输入到 ZoteroStorage 即可，然而并不行，这样会附件同步失败)
  在框2处，输入 ZoteroRepo 文件夹即可。下面子文件夹的创建不是很推荐，这样即可。
• 打开标签页 Renaming Rules
  ZofFile 会把 ZoteroStorage/英文乱码/pdf 的文件自动获取并 剪贴 到 ZoteroRepo 中并按规则修改文件名
  我只希望改成论文的标题即可，所以改成 {%t}
  下面举例了 %a,%y,%j 的含义，你使用默认不修改也行。
  

坚果云配置同步

• 首先确保你打开了坚果云客户端

• 通过上述的配置，默认在坚果云中是会有 zotero 这个文件夹用以同步 ZoteroStorage/storage 中的文件的
  

• 找到你创建 ZoteroRepo 的文件夹，右键这个文件夹选择同步该文件夹即可
  

• 这是成功同步后的标记
  
  

应用测试

一般的导入测试

• 使用 arxiv ID进行导入条目
  比如这么一条，我复制其 arxiv ID
  
• 点击棒子，输入后enter
  
• 一般条目会比较快生成；对应的附件pdf会慢一些。有时候可能pdf下载会失败，删了条目再导入，或者自行下载pdf并拖入并按照后文的改进同步。
  
  可以发现，大部分信息都导入成功了。另外那个pdf有一个锁的标志，证明是链接没问题。
  可以看到 storage 多了一个文件夹，其中的pdf文件不在这里（因为被zotfile剪贴走了）
  
• 发现在 ZoteroRepo 中，pdf成功加入。
  
• 坚果云中对应的文件也同步上去了。

一般文件的普通同步

• 直接拖入一个 pdf 文件，即不包含其他的信息
  
  由于该pdf算一个条目，不算附件，所以只会在乱码文件夹下同步，不会在 ZoteroRepo 同步
  
  也就是说如果你在坚果云中，没法直接按名字找到这个pdf（用文件名搜索也行，太麻烦）

一般文件的改进同步

• 我希望自己拖进去的pdf也能通过 ZotFile 同步到 ZoteroRepo 中，怎么办呢？
  经过我的尝试，方案如下（不排除其他更简单的方法）
  首先创建一个空的文档，并给一个标题
  
  
• 然后拖进来你希望同步的文件
• 选中文档，右键后点击下方的 Manage Attachments → Rename and Move
  
• 文档的标题被改了，因为我们之前中 ZotFile 设置文档标题为 ‘titile’ 所以默认设置为了空文档的标题
  文档多了一个锁
  
• 同步成功。
  
  当然你也可以一个文档下面拖多个pdf，也是可以的。
  

之前没有同步的文件的同步

• 我在同步之前，可能 zotero 里面已经放了一些条目了
  很简单，同理，右键选择 Rename and Move 就可以了
  
  如果有failed的情况单独去看看，大部分都没问题。

第二设备同步的配置

• 如上是第一设备的配置。
  第二及其他设备，软件安装，首选项的配置和ZotFile的配置都相同。
• 但需要提一嘴，在坚果云中，先把 ZoteroRepo 需要同步到本地
  然后再在首选项和 ZotFile 中选择该文件即可。
  
  
• 而 ZoteroStorage 的文件夹创建、路径配置如出一辙。
• 配置之前，打开zotero会自动同步条目，但之前条目的附件是索引不到的。
  配置好之后，双击文件，可以选择自动索引，然后附件同步成功。
  

其他

• 默认打开pdf的方式为自带的 zotero 阅读器
  可以设置为自己喜欢的wps等软件
  

• 删除条目后并不会删除 ZoteroRepo 中的附件文件
  可以使用 delitemwithatt 插件，在 github 可以下载，我这里没有这个需求，就不演示了。

• 手机上装个坚果云，查看pdf效果还不错。毕竟是动态更新的了。
  可惜 zotero 不支持 android