ADAM工具箱下载安装

ADAM工具箱简介

ADAM是一个开源的Matlab工具箱。它允许您使用后向解码（BDM）和前向编码模型（FEM）对EEG和/或MEG数据执行多变量分析（MVPA）。

ADAM工具箱的一大优势是它采用通用输入格式，允许使用标准EEGLAB或Fieldtrip格式的任何数据集直接比较ERP/ ERF结果与MVPA结果。

工具箱以多种方式执行并可视化多个比较校正组解码和前向编码结果，例如跨时间的分类器性能、分类器性能的时间泛化（逐时间）矩阵，通道调谐函数（CTF）和（前向变换）分类器权重的地形图。所有分析都可以直接对原始数据执行，也可以先对数据进行时频分解，在这种情况下，ADAM会在不同的频带上分别执行分析。

注：IEM（逆向编码模型）和FEM（前向编码模型）是同义词。

引用

可引用的使用手册：http://doi.org/10.3389/fnins.2018.00368

若使用了BDM模型，则引用：

Fahrenfort, J. J., van Driel, J., van Gaal, S., & Olivers, C. N. L. (2018). From ERPs to MVPA Using the Amsterdam Decoding and Modeling Toolbox (ADAM). Frontiers in Neuroscience, 12. http://doi.org/10.3389/fnins.2018.00368

若使用了FEM模型，则引用：

Fahrenfort, J. J., Grubert, A., Olivers, C. N. L., & Eimer, M. (2017). Multivariate EEG analyses support high-resolution tracking of feature-based attentional selection. Scientific Reports, 7(1), 1886. http://doi.org/10.1038/s41598-017-01911-0

ADAM工具箱的安装与配置

官网地址：http://www.fahrenfort.com/ADAM.htm

GitHub项目地址：fahrenfort/ADAM at 1.07-beta (github.com)

环境需求

• Matlab（>=2012b，需要安装Statistics Toolbox和Image Processing Toolbox）
• EEGLAB（>=13）
• FieldTrip（>=2015）

下载与安装

1. 点击下载地址：Releases · fahrenfort/ADAM (github.com)

2. 选择最新版本（Windows系统下zip；Linux系统下tar.gz）

202302181745177.png

3. 解压下载好的ADAM-1.14-beta得到如下文件结构

202302181738632.png

4. 使用MATLAB打开ADAM-1.14-beta\install\startup.m，分别修改FieldTrip、EEGLAB、ADAM工具箱在自己电脑上的文件夹路径并运行该脚本（按F5键）即可使用。

   % startup.m
   %------------------------ toolboxes ------------------------%
   
   % path definitions
   ft_path = 'C:\TOOLBOXES\fieldtrip-20170704'; % Note Mac and Linux use forward slashes / instead of \
   eeglab_path = 'C:\TOOLBOXES\eeglab14_1_1b'; 
   adam_path = 'C:\TOOLBOXES\ADAM-master';
   

   如未曾安装过FieldTrip和EEGLAB，可参考install\install_instructions.txt中指引的ftp下载

   - A recent version of FieldTrip, we tested using:
       ftp://ftp.fieldtriptoolbox.org/pub/fieldtrip/fieldtrip-20170711.zip
   - A recent release of EEGlab, we tested using:
       ftp://sccn.ucsd.edu/pub/daily/eeglab14_1_1b.zip
   - The most recent version of the ADAM toolbox:
       http://www.fahrenfort.com/ADAM.htm
   

   或者可以在论文资源托管网站OSF | TOOLBOXES.zip下载打包好的三合一工具箱

5. 成功运行startup.m脚本后，可在命令行窗口看见三行提示语（还有各自工具箱启动时的输出语句），则说明安装完成，可进行工具箱内函数的使用。

   FIELDTRIP IS ALIVE
   EEGLAB IS ALIVE
   ADAM IS ALIVE