生信人应该这样来装软件(未完待续)

P1 优先选择二进制可执行软件来安装

不同组学任务模块
比对重要
全基因组测序/外显子测序 找差异和变异
转录组相关计数
软件安装规律：

1. 二进制，下载 解压，全路径调用

#C语言查看在还是不在
which make
which cmake
which java
which perl
which python
#查看版本
python --version
perl --version

查看版本，版本问题导致错误
如何判断所有软件是否是二进制，进入软件官网查看，例子fastqc
右键复制下载链接
每个软件都有一个文件夹
find ./-name ""*gz #找压缩包,自带测试数据，软件会相互依赖，会有打包软件

mkdir biosoft
cd biosoft/
ls
mkdir fastqc
wget https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.8.dmg

history |grep fastqc #历史记录中搜索fastqc
which fastqc
/usr/bin/fastqc #需要root权限
touch tmp #创建一个空的文件夹来查看是否在/usr/bin/ 下有root权限
touch; cannot touch 'tmp':Permission denied
sudo touch tmp #获得root权限创建新的空文件
sudo rm tmp #用root权限删除tmp文件