编写R包（1）

用help.start()查看R帮助的开始页，其中Writing R Extensions章节详细介绍。

1.1.1小节和1.1.3小节：R包的结构

1.6小节：命名空间

5节：底层语言的使用

 

下载Rtools工具和LaTex程序

查看R的安装路径：

（1）R.home("bin")

（2）R.home("library")

需要设置PATH

 

R包的结构：

pkg（包的名字）

|

|----DESCRIPTION（描述文件）

|----R（函数源文件）

      |----function1.R

      |----function2.R

      |----  ...

|----man（帮助文档）

      |----function1.Rd

      |----function2.Rd

      |----  ...

|----  ...

 

其他文件夹：

demo：demo()的显示内容

data：通过save()函数保存成*.rda

src：其他语言的源代码。被编译为动态链接库文件pkg.dll或pkg.so

inst：该文件夹下的所有文件在安装包的时候都将被复制到包的根目录下。可以放：NEWS文件：包更新消息；CHANGELOG文件；重要子文件夹doc，放一个Sweave文件（*.Rnw），编译安装包的时候这个文件夹会被Sweave编译生成LaTex文件继而生成PDF文档，这也是关于一个包的很重要的介绍文档，称为Vignette。

 

安装R包

命令：R CMD INSTALL pkg

检查：R CMD check pkg

是否有语法错误以及是否符合规范，通过检查后可以向CRAN提交。

 

可用工具：

Emacs

roxygen2（R包）：代码注释——>文档

文档版本管理：SVN，GIT（GitHub网站）或者VSS