mysql The server quit without updating PID file异常解决办法

项目中的用户角色不知道为什么无缘无故甘丢失了，所以就决定更改一下数据库密码，但好不幸更改后，重启时报出这个异常， 

Starting MySQL..The server quit without updating PID file (/var/lib/mysql/localhost.localdomain.pid

于是去查看mysql日志（在/var/lib/mysql目录下有个err文件的） 

InnoDB: using the same InnoDB data or log files.
InnoDB: Unable to lock ./ibdata1, error: 11

于是打算杀死进程再重启，lsof -i:3306，没有进程，后来上网google一翻参考了几篇文章都不能实现有些说修改my.cnf文件等等的，都没效，后来看到一篇文章说： 

ps -ef|grep mysqld ，居然发现服务器里有一个僵尸进程mysqld,启动kill -9  进程号，

然后重新启动mysql,一切恢复正常。

于是打上ps -ef|grep mysqld,真的发现有一个进程号，kill于就能正常启动了。为什么lsof不能查出这个进程号呢？