chr10

如何根据染色体坐标批量提取对应的DNA序列（bedtools）

比如现在：你需查找一段序列，比如说小鼠的chr10:105280000-105280550，我相信学生物的童鞋应该都知道应该怎么获得DNA序列，但是如果当我有上千条序列需要获得并把它们放在同一个fasta
生信start_site·2023-04-05 10:17

chia pet2 output格式（chr10的部分）

ChIA-PET2-ggenomeindex-bbedtoolsgenome-ffq1-rfq2-AlinkerA-BlinkerB-oOUTdir-nprefixname参数说明：-gbwa的基因组索引文件-b为bedtools提供的染色体大小文件（UCSC上下载）-f，-r输入的两个fastq（.gz）文件-A，-B两个linker序列，默认为GTTGGATAAG和GTTGGAATGT-o输出
qq_39306047·2020-08-18 08:26
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