[原]打造数据产品的快速原型:Shiny的Docker之旅

概述

本文将介绍如何通过Docker+Shiny-Server技术极速打造Web开发,并通过实战案例进行演示。

为什么使用Shiny

Shiny是R中的一种Web开发框架,使得R的使用者不必太了解css、js只需要了解一些html的知识就可以快速完成web开发,且shiny包集成了bootstrap、jquery、ajax等特性,极大解放了作为统计语言的R的生产力。使得非传统程序员的R使用者不必依赖于前端、后端工程师就可以自己依照业务完成一些简单的数据可视化工作,快速验证想法的可靠性。

为什么使用Docker

如果说2年以前,你们没有学习Git、GitHub你就落伍了。现在,流行的方向则是Docker!Docker是一种类似于虚拟机的技术,主要解决快速部署的问题,在Docker中安装的软件和主机中的软件可以完全隔离,并通过Daocloud或者hub.docker.com等云服务快速建立Docker仓库,快速复用Docker镜像。Docker已经不仅仅是DevOps人员手中的神器了,每一个开发者都应该学会如何使用Docker。

由于Docker的标准交付特性使得 shiny 应用在运维、部署、交付时都是标准化的,在大规模团队协作时体现出了很大的价值,开发和运维人员不必再为环境配置担心,提高了开发效率。而对于个人开发者,参加黑客马拉松或者快速原型开发,Docker也是不二之选,利用Docker线程级别的快速复用机制也使得一个上G的环境配置可以在很短的时间内快速完成。

Docker的弊端在于对于个人开发者而言,想要构建一个标准的Docker镜像并提交到Docker Hub或自建的Docker Registery上需要按规定写DockerFile, 有时候这反而会增加项目的复杂度。

准备

  • VPS或任意一台 类Unix服务器,本文选用了AWS的Ubuntu服务器作为示例。实际使用中Windows或者Mac电脑下载DockerToolBox软件安装docker后也可以使用。

部署

步骤一:安装Docker

首先,ssh进入linux主机。本文以AWS上的ubuntu14.04的新主机为例。
参考文献1

ssh -i harryzhu.pem [email protected]

其次,安装Docker相关的组件

sudo apt-get update
wget -qO- https://get.docker.com/ | sh

步骤二:安装Shiny-Server

安装完毕,从hub.docker.com拉去最新的shiny-server镜像

docker run -d -p 3838:3838 quantumobject/docker-shiny
  • 上面的中 docker run表示根据quantumobject/docker-shiny镜像启动一个新的容器。

  • -d表示以demon形式运行,挂在后台运行。

  • -p 3838:3838表示将主机的3838端口和docker集群中的3838做端口映射

  • 此外docker run在找不到镜像时会先从docker hub中自动下载,下载完后自动再启动容器。

访问http://52.88.172.224:3838/

从登陆到部署,5行代码搞定!

结束语

如果想要加入更多Shiny的Web应用可以从GitHub上找到大量的Shiny实例,然后根据你的需求稍微改造即可!

示例一:数据可视化

下面举一个例子,通过访问Rstudio的官方shiny实例可以看到实例的目录,在本地的R中执行

if (!require(shiny))
  install.packages("shiny")
shiny::runGitHub("rstudio/shiny-examples", subdir="063-superzip-example")


你也可以访问该网址http://shiny.rstudio.com/gallery/superzip-example.html看到在线的例子。

示例二:表单收集

你将可以看到这一实例,通过修改subdir参数可以查看其他实例。
比如

shiny::runGitHub("rstudio/shiny-examples", subdir="066-upload-file")

实例三:数据生成器

实例四:回归模拟器

更多实例

现在,回到ubuntu主机上,进入刚才生成的docker容器中

docker exec -it docker-shiny /bin/bash

根据参考文献2
进入网站显示的文档的根目录,下载rstudio的shiny-server实例

cd /srv/shiny-server
wget https://github.com/rstudio/shiny-examples/archive/master.zip
unzip master.zip

现在重新访问 http://52.88.172.224:3838/shiny-examples-master/ 你便可以任意选择一个实例进行复用了。

实战案例:

在Segmentfault 2015 北京站的黑客马拉松上,由几名之前搞生物、基因的R语言使用者组成的基饭团队(15组),基于shiny完成了一次漂亮的逆袭,最终获得了大赛的优胜奖一枚。

  • 大赛报道传送门

  • 项目源代码

  • Docker中文教程

参考资料

  • Shinyproxy:deploy Shiny apps in an enterprise context

  • Shiny https: Securing Shiny Open Source with SSL

  • Password protect Shiny Apps

  • Shiny Database App (CRUD)

  • Shiny

  • Web Application Development with R and Apache

  • Persistent data storage in Shiny apps

  • Share data across sessions with shinyapps.io

  • Building Interactive Web Apps with Shiny

  • showmeshiny

  • Introducing shinyjs: perform common JavaScript operations in Shiny apps using plain R code

  • 如何解决Shiny输出的中文问题

  • shiny server deployment

  • shiny conference 2016

作为分享主义者(sharism),本人所有互联网发布的图文均遵从CC版权,转载请保留作者信息并注明作者 Harry Zhu 的 FinanceR专栏:https://segmentfault.com/blog...,如果涉及源代码请注明GitHub地址:https://github.com/harryprince。微信号: harryzhustudio
商业使用请联系作者。

你可能感兴趣的:(r,shiny,docker)