[整理]R-学习笔记-入门

下载及相关准备

windows操作系统

R下载：https://www.r-project.org/

Rstudio下载:https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/

Linux操作系统 CENTOS

R是已经下好了的 Rstudio wget之后是rpm文件 没有root权限不会编译TAT

学习书籍推荐：https://xccds1977.blogspot.sg/2013/02/r.html

参考资料：http://staff.ustc.edu.cn/~zwp/teach/Stat-Comp/R4beg_cn_2.0.pdf

                准备去图书馆借《R in action》...

对象

当R运行时，所有变量、数据、函数及结果都以对象（objects）的形式存在计算机的内存活动中，并冠有相应的名字代号。

对象的内在属性：

    类型 mode（） 数值型、字符型、复数型、逻辑型

    长度 length（）对象中元素的数目

> x <- 1
> mode(x)
[1] "numeric"
> length(x)
[1] 1
> x <- "helloworld"; y <- TRUE; Z <- i 
Error: object 'i' not found
> x <- "helloworld"; y <- TRUE; Z <- 1i 
> mode(x);mode(y);mode(Z)
[1] "character"
[1] "logical"
[1] "complex"

对象的操作：

赋值/修改： <-

删除：rm（）

> rm(Z)
> ls()
[1] "x" "y"
> rm(list=ls())
> ls()
character(0)

Inf：+∞    -Inf：-∞    NaN：非数字

对象的分类：

    向量：外在属性dim和长度的区分、

    因子（数值型或字符型）、数组、矩阵（二维数组）、

    数据框：由一个或几个向量和/或因子构成，必须是登场的，但可以是不同的数据类型、

    时间序列：包含频率、时间等额外属性、

    列表：可以包含任何类型的对象。

文件读写

R可读取的数据：储存在文本文件（ASCII）中的数据

                        其他格式文件（Excel、SAS、SPAA）和访问SQL类型的数据库——高级应用

读取：

read.table（）

> mydata <- read.table("C:/data/test_data.txt")
#创建一个数据框mydata
Warning message:
In read.table("C:/data/test_data.txt") :
  incomplete final line found by readTableHeader on 'C:/data/test_data.txt'
> View(mydata)
#数据框中每个变量被命名，缺省值为V1，V2...
> mydata$V1;mydata["V1"];mydata[,1] #单独访问变量
[1] 1 2    #向量
  V1
1  1
2  2       #数据框
[1] 1 2    #向量

默认缺省值：

read.table(file, header = FALSE, sep = "", quote = "\"’", dec = ".",row.names, col.names, as.is = FALSE, na.strings = "NA",colClasses = NA, nrows = -1,skip = 0, check.names = TRUE, fill = !blank.lines.skip,strip.white = FALSE, blank.lines.skip = TRUE,comment.char = "#")

file	文件名（包含在“”内，或使用一个字符型变量）或者一个URL链接（http://...）（用URL对文件远程访问）
header	反映这个文件的第一行是否包含变量名
sep	字段分离符
quote	指定用于存储字符型数据的字符
dec	用来表示小数点的字符
row.names	保存着行名的向量,或文件中一个变量的序号或名字,缺省时行号取为1, 2, 3, . . .
col.names	指定列名的字符型向量(缺省值是：V1, V2, V3, . . . )
as.is	控制是否将字符型变量转化为因子型变量(如果值为FALSE)，或者仍将其保留为字符型（TRUE） as.is可以是逻辑型，数值型或者字符型向量，用来判断变量是否被保留为字符
na.strings	代表缺失数据的值（转化为NA）
colClasses	指定各列的数据类型的一个字符型向量
nrows	可以读取的最大行数（忽略负值）
skip	在读取数据前跳过的行数
check.names	如果为TRUE，则检查变量名是否在R中有效
fill	如果为TRUE且非所有的行中变量数目相同，则用空白填补
strip.white	在sep已指定的情况下，如果为TRUE，则删除字符型变量前后多余的空格
blank.lines.skip	如果为TRUE，忽略空白行
comment.char	一个字符用来在数据文件中写注释，以这个字符开头的行将被忽略（要禁用这个参数，可使用comment.char = ""）

scan（）

可用于创建不同的对象，向量，矩阵...

> mydata <- scan("data.dat", what = list("", 0, 0))    #读取了文件data.dat中三个变量，第一个是字符型变量，后两个是数值型变量

scan(file = "", what = double(0), nmax = -1, n = -1, sep = "",quote = if (sep=="\n") "" else "’\"", dec = ".",skip = 0, nlines = 0, na.strings = "NA",flush = FALSE, fill = FALSE, strip.white = FALSE, quiet = FALSE,blank.lines.skip = TRUE, multi.line = TRUE, comment.char = "")

what	指定数据的类型（缺省值为数值型）
nmax	要读取数据的最大数量，如果what是一个列表，nmax则是可以读取的行数 （在缺省情况下，scan读取到文件最末端为止的所有数据）
n	要读取数据的最大数量(在缺省情况下，没有限制)

read.fwf（）：来读取文件中一些固定宽度格式的数据

> mydata <- read.fwf("C:/data/test_data.txt",widths=c(1,5,3,2)

原始数据：                 处理后：

      

存储：

write.table（）

> d <- data.frame(obs=c(1,2,3),treat=c("A","B","C"),weight=c(2.3,NA,9))
> write.table(d,file="C:/data/test_data.txt")
> View(d)
> write.table(d,file="C:/data/test_data.txt",row.names=F,quote=F,sep="\t")

存储数据：                              列表显示：

qppend	如果为TRUE则在写入数据时不删除目标文件中可能已存在的数据，采取往后添加的方式
quote	一个逻辑型或者数值型向量：如果为TRUE，则字符型变量和因子写在双引号""中； 若quote是数值型向量则代表将欲写在""中的那些列的列标。 (两种情况下变量名都会被写在""中；若quote = FALSE则变量名不包含在双引号中)
row.names	一个逻辑值，决定行名是否写入文件；或指定要作为行名写入文件的字符型向量
col.names	一个逻辑值（决定列名是否写入文件）；或指定一个要作为列名写入文件中的字符型向量

save（）：保存为R专有的文件格式

> save(d,file="C:/data/test_data.Rdata")
> setwd("C:/data")    #定义路径
> load("test_data.Rdata")    #加载到内存中