环境:Adaconda3 python3.6
(Spyder相对pycharm来说,比较简洁,而且对于常用matlab的人,感觉更亲切。它可以方便的观察变量值,查看运行结果等。但是spyder没有代码折叠!代码提示方面也远不如pycharm!)
Ensemble方法:集合方法,将弱分类器变成一个强分类器。
可以是不同算法的集成、同一算法在不同设置下的集成、数据集不同部分分配给不同分类器之后的集成。
一、基本概念
1、bagging方法
Bagging即套袋法,其算法过程如下:
1)从原始样本集中抽取训练集。每轮从原始样本集中使用Bootstraping的方法抽取n个训练样本(在训练集中,有些样本可能被多次抽取到,而有些样本可能一次都没有被抽中)。共进行k轮抽取,得到k个训练集。(k个训练集之间是相互独立的)
2)每次使用一个训练集得到一个模型,k个训练集共得到k个模型。(注:这里并没有具体的分类算法或回归方法,我们可以根据具体问题采用不同的分类或回归方法,如决策树、感知器等)
3)对分类问题:将上步得到的k个模型采用投票的方式得到分类结果;对回归问题,计算上述模型的均值作为最后的结果。(所有模型的重要性相同)
2、boosting
不同分类器通过串行训练获得,每个新分类器根据已训练出的分类器的性能来进行训练。boosting每一轮的训练集不变,通过集中关注被已有分类器错分的那些数据(改变样本权重)来获得新的分类器。
boosting分类结果是基于所有分类器的加权求和结果的,而bagging中的分类器权重是相等的。
最流行的是AdaBoost(adaptive boosting):训练数据中的每个样本被赋予一个权重D。下一次的训练权重根据上一次的训练结果进行调整,其中上一次分队的样本的权重降低,而上一次分错的样本的权重会提高。为了从所有弱分类器中得到最终的分类结果,AdaBoost为每个分类器分配一个权重alpha。
3、两者比较:
https://www.cnblogs.com/liuwu265/p/4690486.html
二、AdaBoost代码 弱分类器:单层决策树
from numpy import *
def loadSimpData():
datMat = matrix([[ 1. , 2.1],
[ 2. , 1.1],
[ 1.3, 1. ],
[ 1. , 1. ],
[ 2. , 1. ]])
classLabels = [1.0, 1.0, -1.0, -1.0, 1.0]
return datMat,classLabels
datMat,classLabels = loadSimpData()
#根据设定的阈值,针对给定维,对数据进行分类
def stumpClassify(dataMat,dimen,threshVal,threshIneq):#just classify the data
retArr = ones((shape(dataMat)[0],1))
if threshIneq == 'lt':
retArr[dataMat[:,dimen]<=threshVal] = -1.0
else:
retArr[dataMat[:,dimen]>threshVal] = -1.0
return retArr
# 单节点决策树,根据adaboost权重D判断最佳的维度
# 确保标签是+1和-1
def buildStump(dataArr,classLabels,D):
dataMat = mat(dataArr)
labelMat = mat(classLabels).T
m,n = shape(dataMat)
numSteps = 10.0;bestStump={};bestClasEst=mat(zeros((m,1)))
minError = inf #init error sum, to +infinity
for i in range(n): #loop over all dimensions
rangeMin = dataMat[:,i].min();
rangeMax = dataMat[:,i].max();
stepSize = (rangeMax-rangeMin)/numSteps
for j in range(-1,int(numSteps)+1):#loop over all range in current dimension
for inequal in ['lt','gt']:
threshVal = rangeMin + float(j) * stepSize
predictedVals = stumpClassify(dataMat,i,threshVal,inequal)
errArr = mat(ones((m,1)))
errArr[predictedVals == labelMat] = 0
weightedError = D.T * errArr #calc total error multiplied by D
#print ('split: dim %d, thresh %.2f, thresh ineqal: %s, the weighted error is %.3f' % (i, threshVal, inequal, weightedError))
if weightedError < minError:
minError = weightedError
bestClasEst = predictedVals.copy()
bestStump['dim'] = i
bestStump['thresh'] = threshVal
bestStump['ineq'] = inequal
return bestStump,minError,bestClasEst
#D = mat(ones((5,1))/5)
#bestStump,minError,bestClasEst=buildStump(datMat,classLabels,D)
#基于单层决策树的AdaBoost训练过程
def adaboostTrainDS(dataMat,classLabels,numIt=40):
weakClassArr = []
m = shape(dataMat)[0]
D = mat(ones((m,1))/m) #init D to all equal
aggClassEst = mat(zeros((m,1)))
for i in range(numIt):
bestStump,error,classEst = buildStump(dataMat,classLabels,D) #build Stump
# print('D:',D.T)
#calc alpha, throw in max(error,eps) to account for error=0
alpha = float(0.5*log((1.0-error)/max(error,1e-16)))
bestStump['alpha'] = alpha
weakClassArr.append(bestStump)
# print ("classEst: ",classEst.T)
expon = multiply(-1*alpha*mat(classLabels).T,classEst) #exponent for D calc, getting messy
D = multiply(D,exp(expon))
D = D/D.sum()
#calc training error of all classifiers, if this is 0 quit for loop early (use break)
aggClassEst += alpha*classEst
# print ("aggClassEst: ",aggClassEst.T)
#记录每个数据点的类别估计累计值
aggErrors = multiply(sign(aggClassEst) != mat(classLabels).T,ones((m,1)))
errorRate = aggErrors.sum()/m
print ("total error: ",errorRate)
if errorRate == 0.0: break
return weakClassArr
#AdaBoost分类函数
def adaClassify(datToClass,classifierArr):
dataMatrix = mat(datToClass)
m = shape(dataMatrix)[0]
aggClassEst = mat(zeros((m,1)))
for i in range(len(classifierArr)):
classEst = stumpClassify(dataMatrix,classifierArr[i]['dim'],\
classifierArr[i]['thresh'],\
classifierArr[i]['ineq'])
aggClassEst += classifierArr[i]['alpha']*classEst
print (aggClassEst)
return sign(aggClassEst)
#自适应数据加载函数
def loadDataSet(fileName):
numFeat = len(open(fileName).readline().split('\t'))
dataMat=[];labelMat=[]
fr = open(fileName)
for line in fr.readlines():
lineArr = []
curLine = line.strip().split('\t')
for i in range(numFeat-1):
lineArr.append(float(curLine[i]))
dataMat.append(lineArr)
labelMat.append(float(curLine[-1]))
return dataMat,labelMat
dataArr,labelArr = loadDataSet('horseColicTraining2.txt')
classifierArray = adaboostTrainDS(dataArr,labelArr,10)
testArr,testLabelArr = loadDataSet('horseColicTest2.txt')
errArr = mat(ones((67,1)))
errNum = errArr[predictedVals != mat(testLabelArr).T].sum()
注:
1、主要是权重D和alpha的计算、类别估计累计值
weightedError = D.T * errArr
expon = multiply(-1*alpha*mat(classLabels).T,classEst)
aggErrors = multiply(sign(aggClassEst) != mat(classLabels).T,ones((m,1)))
2、运行问题 ufunc 'multiply' did not contain a loop with signature matching types
原因:labelMat.append(float(curLine[-1])) 中float漏写。
因为从文件中读取的每个数据都是字符串即 'XXX'形式,因此需要float()或int()。