biotar 学习笔记（2-2）--- 环境配置、数据的重复性

biotar 学习笔记（2-2）--- 环境配置、数据的重复性

系统安装完毕了，就存在进行软件的安装。

对于linux来说，主要包括三种软件安装方式：

1. 绿色软件，解压可用。
2. 源代码的文件，需要编译。
3. 使用系统软件商店或者叫镜像也行。

当然前两种方式对于大多数人来说，都是比较麻烦的，有没有像第三种方式一样能把大部分软件通过一句命令就能安装呢？答案是有的，那就conda。这个的总结洲更班长总结的已经很完善。

洲更conda笔记三部曲

1. 世上没有白走的路，每一步都算数

2. 生信软件的好帮手-bioconda

3. 什么，你嫌bioconda下载速度太慢？

配置可重复性。

这个是最近才有的体会，比如说你有好几个电脑都想有相同分析环境，这个不免会把有的软件可能会重新装一遍.

1. 那么这个时候，最好是不要去乱去重新一个新的文件夹。比如说在电脑1上使用biosoft文件夹来装软件，那么在电脑2上也请用biosoft文件夹，因为的记录一次的安装代码可以随意的重复使用。
2. 请善待路径中的~，你会喜欢上它的。
3. 如果是联网的电脑，一个软件安装脚本就可以帮你搞定一台新的电脑的配置。
4. 当然环境的移植，conda也可以，或者还有其他的方式，有待发掘。

数据的重复性

我的理解有以下几点：

1. 生信的学习必经之路，这个就跟我们做完题，会去对一对标准答案一样的。
2. 数据的重复，必须基于的是软件及其版本一致，基因版本，注释文件版本和数据库版本一致。
3. 测序的数据不应该一次用完就抛在一边，那样太可惜了，因为数据库在更新，以及联合分析多篇文章的数据都可能有新的科学发现。