安装 Prophet

本安装文档主要翻译整理自 Prophet Installation 官方安装文档。

在 R 上安装 Prophet

一、Windows 系统安装 Prophet 前的准备工作

如果是 Windows 系统，需要按照 rstan 提供的教程给 R 安装一个编译器。其中，最为关键的一步就是先安装 Rtools 。

1. 安装 R 和 RStudio

2. 安装 Rtools ，确保其安装目录已添加至系统环境变量中。

假如 Rtools 安装在 C 盘，则运行Sys.getenv('PATH')后，输出应包含如下所示的结果（注：原文教程中结果为”C:\Rtools\bin;C:\Rtools\gcc-4.6.3\bin;”）；运行system('g++ -v')和system('where make')后输出结果正常，如下所示。

否则，请确保 Rtools 安装目录已添加至系统环境变量中。

1 2 3 4 5 6 7 8 9

> Sys.getenv('PATH') C:\\Rtools\\bin;C:\\Rtools\\mingw_64\\bin; > system('g++ -v') Using built-in specs. COLLECT_GCC=C:\Rtools\mingw_64\bin\G__~1.EXE # 已省略部分输出结果 gcc version 4.9.3 (x86_64-posix-seh, Built by MinGW-W64 project) > system('where make') C:\Rtools\bin\make.exe

3. 配置

非必须操作，不会影响 RStan 正常工作，但强烈推荐。

• 创建一个 Makevars 文件，代码如下：

1 2 3 4 5 6 7 8

dotR <- file.path(Sys.getenv("HOME"), ".R") if (!file.exists(dotR)) dir.create(dotR) M <- file.path(dotR, "Makevars") if (!file.exists(M)) file.create(M) cat("\nCXXFLAGS=-O3 -mtune=native -march=native -Wno-unused-variable -Wno-unused-function", file = M, sep = "\n", append = TRUE)

• 如果你使用的是 Rtools33 （或更高版本），则需要运行下列代码：

1 2 3

cat('Sys.setenv(BINPREF = "C:/Rtools/mingw_$(WIN)/bin/")', file = file.path(Sys.getenv("HOME"), ".Rprofile"), sep = "\n", append = TRUE)

• 如果你使用的 g++ 版本号在 6 或以上，且希望关掉和 Stan 不相关的一些警告信息，可以运行下列代码：

1 2	cat("\nCXXFLAGS += -Wno-ignored-attributes -Wno-deprecated-declarations", file = M, sep = "\n", append = TRUE)

• 确认配置成功，可运行下列代码：

1 2 3 4

# 查看配置的信息 cat(readLines(M), sep = "\n") # 或是找到该配置文件的路径，自行打开查看 cat(M)

4. 安装 RStan

• 安装最新版本的 RStan 及其依赖包，代码如下：

1 2 3

# 注意: 如果 https 下载不成功，可改为 http # 确保 dependencies=TRUE ，安装依赖包 install.packages("rstan", repos = "https://cloud.r-project.org/", dependencies=TRUE)

• 如果上述过程均失败，可通过下列代码按源码安装：

1 2 3

# 注意: 可根据你想使用的内核数来更改数字“4” Sys.setenv(MAKEFLAGS = "-j4") install.packages("rstan", type = "source")

• 安装完成后，重启 R 。并在载入 RStan 前，确认没有旧版本 RStan 所创建（可能是自动创建）的产物已被载入 R 中。
• 通过运行如下代码，确认工具链已生效，代码应当返回值10:

1 2 3 4

fx <- inline::cxxfunction( signature(x = "integer", y = "numeric" ) , ' return ScalarReal( INTEGER(x)[0] * REAL(y)[0] ) ; ' ) fx( 2L, 5 ) # 应当返回值 10

注：以上命令都是在 R 中输入运行的。

二、安装 Prophet 包

在 R 中运行如下代码：

1 2	# R install.packages('prophet')

在 Python 上安装 Prophet

一、安装 Prophet 前的准备工作

Python 中的 Prophet 最主要的依赖库是 pystan。不管什么系统，都需按照 安装教程 先安装pystan。

1. 安装 Python

推荐使用 Anaconda 。Anaconda 是一个开源的 Python 发行版本，内置conda来实现pip库管理的功能。

2. 安装 Pthon 的依赖库

如果你使用的是 Anaconda , numpy 和 cython 库已经内置在其中。但是以防万一，你也可以使用conda去安装它们：

• 打开一个命令行程序

• 使用conda install numpy命令去安装 numpy ; 使用conda install cython命令去安装 cython

3. 安装 PyStan 库

Mac/Linux 用户按照下述步骤安装 PyStan 即可。

• 打开一个命令行程序

• 使用pip install pystan去安装 PyStan

  Windows 用户请按照“Windows 系统安装 PyStan”中的步骤进行安装。

** Windows 系统安装 PyStan

如果是 Windows 系统，在安装 PyStan 前需要按照 安装教程 给 PyStan 安装一个编译器。其中，最为关键的一步就是先安装 C++ 编译器 。

Windows 系统下使用 PyStan 有下列注意事项：

1. 需要使用 Python 3.5 或更高版本

2. 抽取样本时，必须使用n_jobs=1（Windows 系统下的 PyStan 不能使用并行多线程运算）

3. 安装 C++ 编译器

   进入 Visual C++ Build Tools 网页，点击“Download Visual C++ Build Tools 2015”。

   如果你遇到了安装的问题，可以去 Python维基下的 Windows Compilers 寻求解决办法。

   如果你使用的 Windows 7 系统，可能需要在安装 Visual C++ Build Tools 下先更新 Microsoft .NET Framework 。

4. 安装 PyStan

   打开命令行程序，输入下列命令：

   1	pip install pystan

   可通过在 python 中输入下列抽样的代码，验证安装成功：

   1 2 3 4 5

   >>> import pystan >>> model_code = 'parameters {real y;} model {y ~ normal(0,1);}' >>> model = pystan.StanModel(model_code=model_code) >>> y = model.sampling(n_jobs=1).extract()['y'] >>> y.mean() # 结果应当在 0 附近

二、安装 Prophet

使用命令行程序运行下列pip命令安装即可：

1 2	# bash $ pip install fbprophet

Ubuntu 系统安装注意事项

1. 在 Ubuntu 16.04 系统下，使用系统内置的 python 2.7 安装上 fbprophet 后，导入 import fbprophet 时提示需要安装 matplotlib 库和 python-tk。打开一个终端，输入下列命令即可：

   1 2 3

   ~ sudo pip install matplotlib ~ sudo apt-get install tk-dev ~ sudo apt-get install python-tk

2. Ubuntu 16.04 系统使用内置的 python 可以成功安装 fbprophet ，但使用 Anaconda 成功安装 PyStan 库后，检验代码无法成功运行， Prophet 库也无法正确安装：

   运行检验代码后的错误信息：

   1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

   Traceback (most recent call last): File "", line 1, in model = pystan.StanModel(model_code=model_code) File "/home/username/anaconda2/lib/python2.7/site-packages/pystan/model.py", line 315, in __init__ self.module = load_module(self.module_name, lib_dir) File "/home/username/anaconda2/lib/python2.7/site-packages/pystan/model.py", line 54, in load_module return imp.load_module(module_name, *module_info) ImportError: /tmp/tmpgc2vTO/stanfit4anon_model_5944bb5b3a93728ca2bf_765485408593311.so: undefined symbol: _ZTVNSt7__cxx1118basic_stringstreamIcSt11char_traitsIcESaIcEEE

   后尝试在 Anaconda 的 Spyder 中将 console 的 python 路径更改为 /usr/bin/python，运行检验代码仍然报错：

   1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11

   Traceback (most recent call last): File "", line 1, in File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pystan/model.py", line 315, in __init__ self.module = load_module(self.module_name, lib_dir) File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pystan/model.py", line 54, in load_module return imp.load_module(module_name, *module_info) ImportError: /home/username/anaconda2/lib/python2.7/site-packages/numexpr/../../../libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.20' not found (required by /tmp/tmptEazgR/stanfit4anon_model_5944b02c79788fa8ca2bf_7654287730157512986.so)

   在网上查询后，发现是由于 Anaconda 中未安装 libgcc 库。打开一个命令行，运行下列代码安装即可：

   1	conda install libgcc

   安装 libgcc 库后，就可以成功运行检验代码了。

   机缘巧合下，发现安装 libgcc 库后，使用Anaconda 自带的 python ，也可以成功安装 PyStan 和 fbprophet 了。遂将 Spyder 中 console 的 python 路径更改为原来默认的。

待解决问题

Windows 10 系统已安装上 C++ 编译器和 PyStan 库且检验代码成功运行后，无法安装 Prophet 库：

错误信息：

1	error: command 'C:\\Program Files (x86)\\Microsoft Visual Studio 14.0\\VC\\BIN\\x86_amd64\\cl.exe' failed with exit status 2