Boyer-Moore算法学习

 

Boyer-Moore算法学习

1、概述

在用于查找子字符串的算法当中，BM（Boyer-Moore）算法是目前相当有效又容易理解的一种，一般情况下，比KMP算法快3-5倍。

BM算法在移动模式串的时候是从左到右，而进行比较的时候是从右到左的。

常规的匹配算法移动模式串的时候是从左到右，而进行比较的时候也是是从左到右的，基本框架是：

 

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而BM算法在移动模式串的时候是从左到右，而进行比较的时候是从右到左的，基本框架是：

 

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显然BM算法并不是上面那个样子，BM算法的精华就在于++j

2、BM算法思想

BM算法实际上包含两个并行的算法，坏字符算法和好后缀算法。这两种算法的目的就是让模式串每次向右移动尽可能大的距离（j+=x，x尽可能的大）。

几个定义：

例主串和模式串如下：

主串  :  mahtavaatalomaisema omalomailuun

模式串: maisemaomaloma

好后缀：模式串中的aloma为“好后缀”。

坏字符：主串中的“t”为坏字符。

好后缀算法

如果程序匹配了一个好后缀, 并且在模式中还有另外一个相同的后缀, 那

把下一个后缀移动到当前后缀位置。好后缀算法有两种情况：

Case1：模式串中有子串和好后缀安全匹配，则将最靠右的那个子串移动到好后缀的位置。继续进行匹配。

Case2：如果不存在和好后缀完全匹配的子串，则在好后缀中找到具有如下特征的最长子串,使得P[m-s…m]=P[0…s]。说不清楚的看图。

坏字符算法

当出现一个坏字符时, BM算法向右移动模式串, 让模式串中最靠右的对应字符与坏字符相对，然后继续匹配。坏字符算法也有两种情况。

Case1：模式串中有对应的坏字符时，见图。 

Case2：模式串中不存在坏字符。见图。

移动规则

BM算法的移动规则是：

将概述中的++j，换成j+=MAX（shift（好后缀），shift（坏字符）），即

BM算法是每次向右移动模式串的距离是，按照好后缀算法和坏字符算法计算得到的最大值。

shift（好后缀）和shift（坏字符）通过模式串的预处理数组的简单计算得到。好后缀算法的预处理数组是bmGs[]，坏字符算法的预处理数组是BmBc[]。

3、代码分析

定义

BM算法子串比较失配时，按坏字符算法计算模式串需要向右移动的距离，要借助BmBc数组。

注意BmBc数组的下标是字符，而不是数字。

BmBc数组的定义，分两种情况。

1、 字符在模式串中有出现。如下图，BmBc[‘k’]表示字符k在模式串中最后一次出现的位置，距离模式串串尾的长度。

2、 字符在模式串中没有出现：，如模式串中没有字符p，则BmBc[‘p’] = strlen(模式串)。

BM算法子串比较失配时，按好后缀算法计算模式串需要向右移动的距离，要借助BmGs数组。

BmGs数组的下标是数字，表示字符在模式串中位置。

BmGs数组的定义，分三种情况。

1、 对应好后缀算法case1：如下图：i是好后缀之前的那个位置。

2、 对应好后缀算法case2：如下图所示：

3、 当都不匹配时，BmGs[i] = strlen（模式串）

在计算BmGc数组时，为提高效率，先计算辅助数组Suff。

Suff数组的定义：suff[i] = 以i为边界, 与模式串后缀匹配的最大长度，即P[i-s...i]=P[m-s…m]如下图：

举例如下：

分析

用Suff[]计算BmGs的方法。

1） BmGs[0…m-1] = m；（第三种情况）

2） 计算第二种情况下的BmGs[]值：

for（i=0；i

if（-1==i || Suff[i] == i+1）

for（；j < m-1-i；++j）

if（suff[j] == m）

BmGs[j] = m-1-i；

3） 计算第三种情况下BmGs[]值，可以覆盖前两种情况下的BmGs[]值：

for（i=0；i

BmGs[m-1-suff[i]] = m-1-i；

如下图所示：

Suff[]数组的计算方法。

常规的方法：如下，很裸很暴力。

Suff[m-1]=m；

for（i=m-2；i>=0；--i）{

q=i；

while（q>=0&&P[q]==P[m-1-i+q]）

--q；

Suff[i]=i-q；

}

有聪明人想出一种方法，对常规方法进行改进。基本的扫描都是从右向左。改进的地方就是利用了已经计算得到的suff[]值，计算现在正在计算的suff[]值。

如下图所示：

i是当前正准备计算的suff[]值得那个位置。

f是上一个成功进行匹配的起始位置（不是每个位置都能进行成功匹配的，  实际上能够进行成功匹配的位置并不多）。

q是上一次进行成功匹配的失配位置。

如果i在q和f之间，那么一定有P[i]=P[m-1-f+i]；并且如果suff[m-1-f+i]=i-q, suff[i]和suff[m-1-f+i]就没有直接关系了。

代码

void preBmBc(char *x, int m, int bmBc[]) {

   int i;

   for (i = 0; i < ASIZE; ++i)

      bmBc[i] = m;

   for (i = 0; i < m - 1; ++i)

      bmBc[x[i]] = m - i - 1;

}

void suffixes(char *x, int m, int *suff) {

   int f, g, i;

  f = 0；

   suff[m - 1] = m;

   g = m - 1;

   for (i = m - 2; i >= 0; --i) {

      if (i > g && suff[i + m - 1 - f] < i - g)

         suff[i] = suff[i + m - 1 - f];

      else {

         if (i < g)

            g = i;

         f = i;

         while (g >= 0 && x[g] == x[g + m - 1 - f])

            --g;

         suff[i] = f - g;

      }

   }

}

void preBmGs(char *x, int m, int bmGs[]) {

   int i, j, suff[XSIZE];

   suffixes(x, m, suff);

   for (i = 0; i < m; ++i)

      bmGs[i] = m;

   j = 0;

   for (i = m - 1; i >= 0; --i)

      if (suff[i] == i + 1)

         for (; j < m - 1 - i; ++j)

            if (bmGs[j] == m)

               bmGs[j] = m - 1 - i;

   for (i = 0; i <= m - 2; ++i)

      bmGs[m - 1 - suff[i]] = m - 1 - i;

}

void BM(char *x, int m, char *y, int n) {

   int i, j, bmGs[XSIZE], bmBc[ASIZE];

   /* Preprocessing */

   preBmGs(x, m, bmGs);

   preBmBc(x, m, bmBc);

   /* Searching */

   j = 0;

   while (j <= n - m) {

      for (i = m - 1; i >= 0 && x[i] == y[i + j]; --i);

      if (i < 0) {

         OUTPUT(j);

         j += bmGs[0];

      }

      else

         j += MAX(bmGs[i], bmBc[y[i + j]] - m + 1 + i);

   }

}

发表于 @ 2009年09月18日　21:59:00 | 评论( 2 ) | 举报| 收藏