python seaborn画图
以前觉得用markdown写图文混排的文字应该很麻烦,后来发现CSDN的markdown真是好用的。
在做分析时候,有时需要画几个图看看数据分布情况,但总记不住python的绘图函数。今天有空顺便整理下python的seaborn绘图函数库。
Seaborn其实是在matplotlib的基础上进行了更高级的API封装,从而使得作图更加容易,在大多数情况下使用seaborn就能做出很具有吸引力的图,而使用matplotlib能制作具有更多特色的图。应该把Seaborn视为matplotlib的补充,而不是替代物。
seaborns是针对统计绘图的,方便啊。
一般来说,seaborn能满足数据分析90%的绘图需求,够用了,如果需要复杂的自定义图形,还是要matplotlit。这里也只是对seaborn官网的绘图API简单翻译整理下,对很多参数使用方法都没有说到,如果需要精细绘图,还是需要参照其seaborn的文档的。
这里简要介绍常用的图形,常用的参数,其精美程度不足以当做报告绘图,算是做笔记吧。
1.几个概念
如果使用过R语言的ggplot2绘图包,对分组分面,统计绘图等概念应该很熟悉,这里也介绍下。
1.1.分组绘图
比如说需要在一张图上绘制两条曲线,分别是南方和北方的气温变化,分别用不同的颜色加以区分。在seaborn中用hue参数控制分组绘图。
1.2.分面绘图
其实就是在一张纸上划分不同的区域,比如2*2的子区域,在不同的子区域上绘制不同的图形,在matplotlib中就是 add_subplot(2,2,1),在seaborn中用col参数控制,col的全称是columns,不是color,如果辅助col_wrap参数会更好些。后来发现,col可以控制columns的子图,那么row可以控制rows的子图排列。
如果需要分面绘图,应该使用seaborn的FacetGrid对象,seaborn的一般的绘图函数是没有分面这个参数的。
1.3.统计函数
分组绘图的时候,会对分组变量先要用统计函数,然后绘图,比如先计算变量的均值,然后绘制该均值的直方图。统计绘图参数是 estimator,很多情况下默认是numpy.mean。在ggplot2中就大量使用了这种方法。如果不适用统计绘图,就需要先用pandas进行groupby分组汇总,然后用seaborn绘图,多此一举了。
2.图形分类
在seaborn中图形大概分这么几类,因子变量绘图,数值变量绘图,两变量关系绘图,时间序列图,热力图,分面绘图等。
因子变量绘图
- 箱线图boxplot
- 小提琴图violinplot
- 散点图striplot
- 带分布的散点图swarmplot
- 直方图barplot
- 计数的直方图countplot
- 两变量关系图factorplot
回归图
回归图只要探讨两连续数值变量的变化趋势情况,绘制x-y的散点图和回归曲线。
- 线性回归图lmplot
- 线性回归图regplot
分布图
包括单变量核密度曲线,直方图,双变量多变量的联合直方图,和密度图
热力图
1. 热力图heatmap
聚类图
1. 聚类图clustermap
时间序列图
1. 时间序列图tsplot
2. 我的时序图plot_ts_d , plot_ts_m
分面绘图
1.分面绘图FacetGrid
3.因子变量绘图
3.1.boxplot箱线图
import seaborn as sns
sns.set_style("whitegrid")
tips = sns.load_dataset("tips")
ax = sns.boxplot(x=tips["total_bill"])
ax = sns.boxplot(y=tips["total_bill"])
ax = sns.boxplot(x="day", y="total_bill", data=tips)
ax = sns.boxplot(x="day", y="total_bill", hue="smoker",
data=tips, palette="Set3")
ax = sns.boxplot(x="day", y="total_bill", hue="time",
data=tips, linewidth=2.5)
ax = sns.boxplot(x="time", y="tip", data=tips,
order=["Dinner", "Lunch"])
iris = sns.load_dataset("iris")
ax = sns.boxplot(data=iris, orient="h", palette="Set2")
箱线图+有分布趋势的散点图–>的组合图
ax = sns.boxplot(x="day", y="total_bill", data=tips)
ax = sns.swarmplot(x="day", y="total_bill", data=tips, color=".25")
3.2.violinplot小提琴图
小提琴图其实是箱线图与核密度图的结合,箱线图展示了分位数的位置,小提琴图则展示了任意位置的密度,通过小提琴图可以知道哪些位置的密度较高。在图中,白点是中位数,黑色盒型的范围是下四分位点到上四分位点,细黑线表示须。外部形状即为核密度估计(在概率论中用来估计未知的密度函数,属于非参数检验方法之一)。
import seaborn as sns
sns.set_style("whitegrid")
tips = sns.load_dataset("tips")
ax = sns.violinplot(x=tips["total_bill"])
ax = sns.violinplot(x="day", y="total_bill", data=tips)
ax = sns.violinplot(x="day", y="total_bill", hue="smoker",
data=tips, palette="muted")
ax = sns.violinplot(x="day", y="total_bill", hue="smoker",
data=tips, palette="muted", split=True)
ax = sns.violinplot(x="time", y="tip", data=tips,
order=["Dinner", "Lunch"])
其他的样式不常用,就不贴上来了。
3.3.stripplot散点图
需要注意的是,seaborn中有两个散点图,一个是普通的散点图,另一个是可以看出分布密度的散点图。下面把它们花在一起就明白了。
ax1 = sns.stripplot(x=tips["total_bill"])
ax2 = sns.swarmplot(x=tips["total_bill"])
ax = sns.stripplot(x="day", y="total_bill", data=tips)
ax = sns.stripplot(x="day", y="total_bill", data=tips, jitter=True)
ax = sns.stripplot(x="total_bill", y="day", data=tips,jitter=True)
ax = sns.stripplot(x="sex", y="total_bill", hue="day",
data=tips, jitter=True)
ax = sns.stripplot(x="day", y="total_bill", hue="smoker",
data=tips, jitter=True,palette="Set2", split=True)
ax = sns.violinplot(x="day", y="total_bill", data=tips,inner=None, color=".8")
ax = sns.stripplot(x="day", y="total_bill", data=tips,jitter=True)
3.4.swarmplot带分布的散点图
swarmplt的参数和用法和stripplot的用法是一样的,只是表现形式不一样而已。
import seaborn as sns
sns.set_style("whitegrid")
tips = sns.load_dataset("tips")
ax = sns.swarmplot(x=tips["total_bill"])
ax = sns.swarmplot(x="day", y="total_bill", data=tips)
ax = sns.boxplot(x="tip", y="day", data=tips, whis=np.inf)
ax = sns.swarmplot(x="tip", y="day", data=tips)
ax = sns.violinplot(x="day", y="total_bill", data=tips, inner=None)
ax = sns.swarmplot(x="day", y="total_bill", data=tips,
color="white", edgecolor="gray")
3.5.pointplot
Show point estimates and confidence intervals using scatter plot glyphs.
使用散点图符号显示点估计和置信区间。
这个我不知道在什么地方用到,不太明白。就先写这个了。
3.6.barplot直方图
我不喜欢显示直方图上面的置信度线,难看,所以下面的图形我都设置ci=0.(Size of confidence intervals to draw around estimated values)
直方图的统计函数,绘制的是变量的均值 estimator=np.mean
import seaborn as sns
sns.set_style("whitegrid")
tips = sns.load_dataset("tips")
ax = sns.barplot(x="day", y="total_bill", data=tips,ci=0)
ax = sns.barplot(x="day", y="total_bill", hue="sex", data=tips,ci=0)
from numpy import median
ax = sns.barplot(x="day", y="tip", data=tips,
estimator=median, ci=0)
ax = sns.barplot("size", y="total_bill", data=tips,
palette="Blues_d")
3.7.countplot计数统计图
这个很重要,对因子变量计数,然后绘制条形图
import seaborn as sns
sns.set(style="darkgrid")
titanic = sns.load_dataset("titanic")
ax = sns.countplot(x="class", data=titanic)
ax = sns.countplot(x="class", hue="who", data=titanic)
ax = sns.countplot(y="class", hue="who", data=titanic)
3.8.factorplot
这是一类重要的变量联合绘图。
绘制 因子变量-数值变量 的分布情况图。
import seaborn as sns
sns.set(style="ticks")
exercise = sns.load_dataset("exercise")
g = sns.factorplot(x="time", y="pulse", hue="kind",
data=exercise, kind="violin")
titanic = sns.load_dataset("titanic")
g = sns.factorplot(x="alive", col="deck", col_wrap=4,
data=titanic[titanic.deck.notnull()],
kind="count", size=2.5, aspect=.8)
4.回归图
回归图有两个,我暂时没有看出他们有什么区别,从函数说明来看看吧。
lmplot: Plot data and regression model fits across a FacetGrid.
regplot:Plot data and a linear regression model fit.
4.1.回归图lmplot
import seaborn as sns; sns.set(color_codes=True)
tips = sns.load_dataset("tips")
g = sns.lmplot(x="total_bill", y="tip", data=tips)
g = sns.lmplot(x="total_bill", y="tip", hue="smoker", data=tips)
g = sns.lmplot(x="total_bill", y="tip", hue="smoker",
data=tips,markers=["o", "x"])
g = sns.lmplot(x="total_bill", y="tip", col="smoker", data=tips)
g = sns.lmplot(x="size", y="total_bill", hue="day",
col="day",data=tips, aspect=.4, x_jitter=.1)
g = sns.lmplot(x="total_bill", y="tip", col="day", hue="day",
data=tips, col_wrap=2, size=3)
g = sns.lmplot(x="total_bill", y="tip", row="sex",
col="time", data=tips, size=3)
4.2.回归图regplot
Plot the relationship between two variables in a DataFrame:
import seaborn as sns; sns.set(color_codes=True)
tips = sns.load_dataset("tips")
ax = sns.regplot(x="total_bill", y="tip", data=tips)
import numpy as np; np.random.seed(8)
mean, cov = [4, 6], [(1.5, .7), (.7, 1)]
x, y = np.random.multivariate_normal(mean, cov, 80).T
ax = sns.regplot(x=x, y=y, color="g", marker="+")
ax = sns.regplot(x=x, y=y, ci=68)
ans = sns.load_dataset("anscombe")
ax = sns.regplot(x="x", y="y", data=ans.loc[ans.dataset == "II"],
scatter_kws={"s": 80},order=2, ci=None, truncate=True)
5.数值分布绘图
5.1.直方图histplot
直方图hist=True,核密度曲线rug=True
import seaborn as sns, numpy as np
sns.set(rc={"figure.figsize": (8, 4)}); np.random.seed(0)
x = np.random.randn(100)
ax = sns.distplot(x)
ax = sns.distplot(x, rug=True, hist=False)
ax = sns.distplot(x, vertical=True)
5.2.核密度图kdeplot
import numpy as np; np.random.seed(10)
import seaborn as sns; sns.set(color_codes=True)
mean, cov = [0, 2], [(1, .5), (.5, 1)]
x, y = np.random.multivariate_normal(mean, cov, size=50).T
ax = sns.kdeplot(x)
ax = sns.kdeplot(x, shade=True, color="r")
ax = sns.kdeplot(x, y, shade=True)
iris = sns.load_dataset("iris")
setosa = iris.loc[iris.species == "setosa"]
virginica = iris.loc[iris.species == "virginica"]
ax = sns.kdeplot(setosa.sepal_width, setosa.sepal_length,
cmap="Reds", shade=True, shade_lowest=False)
ax = sns.kdeplot(virginica.sepal_width, virginica.sepal_length,
cmap="Blues", shade=True, shade_lowest=False)
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5.3.双变量关系图jointplot
joint,顾名思义,就是联合呀。
Draw a plot of two variables with bivariate and univariate graphs.
kind参数可以使用不同的图形反应两变量的关系,比如点图,线图,核密度图。
import numpy as np, pandas as pd; np.random.seed(0)
import seaborn as sns; sns.set(style="white", color_codes=True)
tips = sns.load_dataset("tips")
g = sns.jointplot(x="total_bill", y="tip", data=tips)
g = sns.jointplot("total_bill", "tip", data=tips, kind="reg")
g = sns.jointplot("total_bill", "tip", data=tips, kind="hex")
iris = sns.load_dataset("iris")
g = sns.jointplot("sepal_width", "petal_length", data=iris,
kind="kde", space=0, color="g")
g = sns.jointplot("total_bill", "tip", data=tips,
size=5, ratio=3, color="g")
5.4.变量关系组图pairplot
就是绘制dataframe中各个变量两两之间的关系图。
在变量关系图中,最常见的就是 x-y的线图,x-y的散点图,x-y的回归图。其实这三者都可以通过lmplot绘制,只是控制不同的参数而已。x-y的线图,其实就是时间序列图,这里就不说了。
这里又说一遍散点图,是为了和前面的因子变量散点图相区分,前面的因子变量散点图,讲的是不同因子水平的值绘制的散点图,而这里是两个数值变量值散点图关系。为什么要用lmplot呢,说白了就是,先将这些散点画出来,然后在根据散点的分布情况拟合出一条直线。但是用lmplot总觉得不好,没有用scatter来得合适。
tips = sns.load_dataset("tips")
g = sns.lmplot(x="total_bill", y="tip", data=tips,
fit_reg=False,hue='smoker',scatter=True)
g = sns.lmplot(x="total_bill", y="tip", data=tips,
fit_reg=True,hue='smoker',scatter=False)
import seaborn as sns; sns.set(style="ticks", color_codes=True)
iris = sns.load_dataset("iris")
g = sns.pairplot(iris)
g = sns.pairplot(iris, hue="species")
g = sns.pairplot(iris, hue="species", markers=["o", "s", "D"])
g = sns.pairplot(iris, vars=["sepal_width", "sepal_length"])
g = sns.pairplot(iris, diag_kind="kde")
6.热力图
6.1.热力图heatmap
import numpy as np; np.random.seed(0)
import seaborn as sns; sns.set()
uniform_data = np.random.rand(10, 12)
ax = sns.heatmap(uniform_data)
ax = sns.heatmap(uniform_data, vmin=0, vmax=1)
Plot a dataframe with meaningful row and column labels:
flights = sns.load_dataset("flights")
flights = flights.pivot("month", "year", "passengers")
ax = sns.heatmap(flights)
ax = sns.heatmap(flights, annot=True, fmt="d")
data = np.random.randn(50, 20)
ax = sns.heatmap(data, xticklabels=2, yticklabels=False)
7.聚类图clustermap
暂时不知道怎么用,先这样吧。
8.时间序列图
tsplot函数说是绘制时间序列图,还不如说是绘制简单的线图更加合适吧,因为我在绘制带timestap时间索引的pandas.Series时,并没有自动升采样绘图,只是数据有有什么数据就画什么,这在时间序列上应该是不对的。
因为我遇到这样一种情况,一个产品只在上半年卖,从数据库中取出数据只有每年上半年的数据,下半年没有数据也应该填充为0才对啊,但是seaborn的tsplot没有这个功能。
下面先介绍tsplot绘制线图吧,传入一个list或者series,直接绘制线图。
8.1.tsplot时序图
import numpy as np; np.random.seed(22)
import seaborn as sns; sns.set(color_codes=True)
x = np.linspace(0, 15, 31)
data = np.sin(x) + np.random.rand(10, 31) + np.random.randn(10, 1)
ax = sns.tsplot(data=data)
gammas = sns.load_dataset("gammas")
ax = sns.tsplot(time="timepoint", value="BOLD signal",
unit="subject", condition="ROI", data=gammas)
ax = sns.tsplot(data=data, ci=[68, 95], color="m")
ax = sns.tsplot(data=data, estimator=np.median)
8.2.panda线图
pandas的dataframe本身也有绘图函数,对于常见的分析图形还是很方便的,而且可以在plot函数中指定title等
sale4.loc[sale4['sku']=='SKU412946',['month','salecount']]\
.plot(x='month',y='salecount',title='SKU412946')
8.3.采样的时序图
这里重点讲一下。如果时序中每天的数据都有还好说,如果没有,就需要采样了。
def plot_ts_day(x,y):
"""绘制每天的时间序列图。
需要注意的是,序列是不是连续的,也就是说某天的数据是没有的,因此需要采样至每天都有记录,原来数据没有的就填充0
x:时间轴,string或者time类型,是一个seires
y:值
"""
x=[pd.to_datetime(str(i)) for i in x]
y=[i for i in y]
s=pd.Series(y,index=x)
s = s.resample(rule='D',fill_method='ffill')
s[s.index]=0
s[x]=y
x2 = [i.strftime('%Y-%m-%d') for i in s.index]
s.index = x2
s.plot()
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def plot_ts_month(x,y):
"""绘制月的时间序列图,每月一个数据点,而不是每天一个"""
try:
x = [pd.to_datetime(str(i)) for i in x]
except:
x=[pd.to_datetime(str(i)+'01') for i in x]
y=[i for i in y]
s=pd.Series(y,index=x)
s = s.resample('M', label='right').sum().fillna(0)
s.index=[i.strftime('%Y%m') for i in s.index]
s.plot()
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8.4.pandas分组的线图
说实话,到现在还没搞懂怎么用sns.tsplot绘制分组线图,但是任务紧急,就用pandas的dataframe自带方法plot来绘图了,其实也挺简单的。
主要注意的是,尽量给dataframe或者series建立时间索引,不然x轴很难看的。
data.index = data['year'].map(str)+data['month2'].map(lambda x: str(x) if x>=10 else '0'+str(x))
data['salecount'].plot()
分组的线图,比如seaborn中的hue参数,方法是,先将dataframe长表格式转成宽表格式(透视表),每列是不同的年。
data.pivot(index='month2',columns='year',values='salecount').plot(title='销量')
data.pivot_table(index='month2',columns='year',values='salecount',aggfunc='sum') \
.plot(title='销量',style='o-')
图形格式选项
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data.pivot(index='month2',columns='year',values='salecount')\
.plot(title='销量',style='-o')
9.双坐标轴图
有没有遇到这样一种情况,需要将销量和趋势图和温度的变化图同时画在一幅图上,以便观察两者的趋势变化情况,但是因两者是数值差距很大,如果共用同一Y轴,温度曲线就基本看不到了。还是上图上代码吧。
import seaborn as sns
sale=pd.Series(np.random.random(10)*100).map(int)
tmperature=pd.Series(np.random.random(10)*10).map(int)
ax=plt.subplot(111)
sale.plot(ax=ax,color='b')
ax.set_xlabel('time')
ax.set_ylabel('sale')
ax2 = ax.twinx()
tmperature.plot(ax=ax2,color='r')
ax2.set_ylabel('tmperature')
plt.title('double series figure')
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9.一些技巧
9.1 批量保存图片
如果只有一张图片,这没什么好说的,但是如果要对每个维度绘图,然后保存图片呢。
fig = plt.figure()
ax=fig.add_subplot(111)
sub_data[years].plot(ax=ax, style='o-',title='%s 月销量趋势图'%lev3)
file = r'E:\服装预测\销量趋势-%s.jpg' %lev3
savefig(file)
time.sleep(0.5)
plt.close()
9.2 显示中文问题
import seaborn as sns
import matplotlib as mpl
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.pyplot import savefig
mpl.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei']
mpl.rcParams['axes.unicode_minus'] = False
10.分段统计绘图
遇到这样一种情况,如下的数据格式,现在platform不是重点,需要对diff_date字段分段汇总然后绘图。
这里借用panas.cut函数,因为是绘图看趋势,不需要精确得到每个分段的分割点。
cut函数有两种使用方法,如果bins=10
这样的数值,则将series切成等间隔的10段,如果bins=[0,5,20,55...]
这样的一个列表,则根据列表规则切分。
data['cut_point']=pd.cut(data['age'],
bins=[0,3,5.9,8.9,11.9,14.8,17.8,20.8,23.8,26.7,29.7],
labels=['0-3','3-5.9',......]
right=True,
precision=1)
sns.barplot(x='cut_point',y='cnt', data=data, estimator=np.sum, ci=0)
plt.xlabel('这是横坐标名称')
plt.ylabel('这是纵坐标名称')
plt.title('这是图标标题')
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11.分面子图绘图
11.1
接下来好好说说这个比较难的,在10中我们分区间绘图,但是我们没有考虑platform这个因子变量啊,如果我们要考虑这个因子变量,就需要分面了,比如不同的platform画一个子图。
data['bins']=pd.cut(data['age'], bins=10,precision=1)
data['cut_point']=data['bins'].apply(lambda x: eval(x.replace(']',')'))[1])
g=sns.FacetGrid(data=data,col='platform',col_wrap=3,size=5)
g=g=g.map(sns.barplot,'cut_point','cnt',ci=0, estimator=np.sum)
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11.2
自定义子图绘制
def my_barplot(x,y,**kwargs):
"""
自定义函数的时候,没有显示传入dataframe,但是会自动获取,很神奇吧。
x,y是dataframe的列名
"""
ax = plt.gca()
data['bins']=pd.cut(data['age'], bins=10,precision=1)
data['cutpoint']=data['bins'].apply(lambda x: eval(x.replace(']', ')'))[1])
sns.barplot(x='cutpoint', y='cnt',data=data, estimator=np.sum, ci=0, ax=ax)
g = sns.FacetGrid(data=data, col='platform',col_wrap=3,
size=5,sharex=False)
g = g.map(my_barplot,'age','cnt')
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12.颜色主题
主题
在换了win10后发现seaborn的画出来的图很难看,基本上就是matplotlib的样子。想来肯定是主题和颜色样式没有设置好。今天看了下文档,补充下主题的设置。
seaborn的默认主题就是最好看的,如下:
import seaborn as sns
sns.set()
还有其他几个主题,包括:
sns.set_style("whitegrid")
sns.set_style("darkgrid")
sns.set_style("dark")
sns.set_style("white")
sns.set_style("ticks")
下面来几张图,发现就默认主题和白色网格背景是比较好看。
颜色
颜色一般来说用默认的颜色就好了,而且也比较好看,如果非要设置颜色,可以通过sns.set_palette("husl")
设置。
常用的其他颜色模式还有:
sns.set_palette("muted")
sns.set_palette("RdBu")
sns.set_palette("Blues_d")
sns.set_palette("Set1")
sns.set_palette("RdBu")
效果如下图:
13.后话
这里只是简单说说seaborn常用的绘图函数而已,看seaborn官网上面有很多好看的图形样例,而这里的函数画出来的哪里有官网的好看啊。
而且这里也没有说到具体的布局控制,颜色主题等,要想绘制精美的图形,还需要学习具体的参数设定啊。
不过这里提到的这些简要图形,对于普通的分析快速绘图足够用了。
使用心得以后补充吧。