每日文献：2018-01-05

Power and sample size calculations for high-throughput sequencing-based experiments

功效检验是衡量在数据集中找到统计学显著性的可能性。目前芯片技术有关的研究已经建立了比较完善的功效分析方法，但高通量的功效计算方法比芯片技术的复杂多了，所以目前还没有比较好的标准。这篇文章主要是对目前已有的功效分析方法进行了一个综述。

Flow chart for selecting the proper power/sample size (PS) method for RNA-seq experiment.

Power/sample size computation tools

Bayesian estimation of differential transcript usage from RNA-seq data

二代测序能够识别基因中差异表达的转录本(transcript), 其中一个用途就是找到差异使用的转录本(differential transcript usage,DTU)，这篇文章就提出新的贝叶斯估计方法，BayesDRIMSeq和cjBitSeq.
工具所在地址：

• cjBitSeq：https://github.com/mqbssppe/cjBitSe
• BayesDRIMSeq:https://github.com/mqbssppe/BayesDRIMSeq

DyNetViewer: a Cytoscape app for dynamic network construction, analysis and visualization

细胞中的分子交互随着时间和环境变化而变化。构建和分析动态分子网络能够阐述不同生物学功能的动态细胞分子机制，也就有机会从系统层面上理解复杂疾病。作者就开发一个app,叫做DyNetViewer,是Java写的，所以跨平台哦

网站真不错

地址：http://www.cytoscape.org/download.php