黄巾之乱平息后，曹操发出了讨逆之文讨伐董卓，孙策的父亲孙坚也在其列。却因为诸侯们各想着自己怎么发展而最终失败，孙坚在讨伐董卓时得到传国玉玺，不料被袁绍知道，他让刘表截击孙坚，后与黄祖在襄阳决战而不幸阵亡，但玉玺没有丢失，但他手下无兵无马，只能暂时依附在袁术手下。
一日，孙策正在寿春的将军府叹息、哭泣之时，朱治前来安慰，孙策知道这是自己父亲的老部下，便说出了自己立功无数，确犹如袁术手下皮卡丘一样的话，又说自己是江东猛虎之子，愧对父亲。朱治便道，你可以向袁术借兵啊！这时吕范来到，说自己是袁术的谋士，袁术不是明主而特来投效孙将军。又说道可以拿传国玉玺做抵押可以向袁术借兵的良策，孙策哈哈大笑说这个买卖真值得。朱治暗道这小子真有气概，吕范也说一点就明，真是明主。孙策于是去找袁术，然而袁术正在研究《十万个为什么》纪灵和杨弘正在吹袁术的牛，纪灵还说自己的主子像爱因斯坦一样厉害。孙策暗说这年代有爱因斯坦吗？等他们吹完牛后孙策以传国玉玺做抵押成功借来了兵马，而袁术也大呼自己天才，杨、纪两人也随声附和。
孙策在寿春举兵，朱治、吕范先来报告，随即程普、黄盖来报告。黄盖说：我们的速度真快，那么老还能抢先来报告。程普答道：我们可以参加110米跨栏为国争光哦！孙策问道110米跨栏咋来的？又说道两位老将军幽默感又进步了。韩当也来报告，说自己的青春的勋章离不开热血。孙策笑道：好，让我看看你的表现。然后他们踏上了称霸江东的第一步！
正在他向庐江进发时，看见了地公将军张宝开始打劫，孙策便连忙去阻止，但是自己的部队确陷入了黄巾军的包围。孙策喝道：杀出一条重围。张宝吓了一跳，说：这支军队太可怕了，一定要斩草除根。过了一会，周瑜来到。他看到孙策陷入重围之后便又用了火王咒一张，成功打败了黄巾军，斩灭了张宝的军队，斩杀了张宝本人。周瑜和孙策两兄弟也得以团聚，他们相互问候，孙策告诉了他孙坚死亡的消息之后周瑜叹息，孙策和周瑜共同发出了誓言：有朝一日，我们必定提兵驻马在洛阳城头！孙策道：父亲总以为这些话是戏言，现在时代不同，正是我们这些小辈而起之时，是我们两立足新世界的目标，公瑾，时机已到，让我们成为时代的缔造者吧！周瑜道：正有此意，愿效犬马之劳。周瑜让孙策先回军营，自己带两个人来见他。孙策回到军营静待，当听到传令兵的消息时，孙策大喜过望，而黄盖、程普、朱治也吃了一惊，这个面前的人就是孙策的结义兄弟周瑜周公瑾，那后面便是有名的江东二张：张昭、张纮，他们两个说了当今全国的局势并提出了称霸江东大计，先战刘繇。孙策说：我正有此意。于是孙策军真正开始了三年的称霸江东之路。
孙策的军队开往牛渚，宣战刘繇军，第一步就是击溃张英、抢占牛渚。周瑜在开战时暗道：大哥，那两个人不肯轻易佩服人，想得到他们就看你的造化了。张英摆出了铁桶阵与孙策一战。过了一会，孙策察觉到这果然是铁桶阵，于是发怒死破铁桶阵。也令张昭张纮两人深深佩服。就当孙策所向披靡之时，牛渚的后方突然冒出周泰、蒋钦，他们火烧刘繇军后方，大破刘繇军。这时，太史慈来援救，可最终还是抵挡不住失败的局面，牛渚失陷，而张英却把责任推给了太史慈，正是因为太史慈没得刘繇命令擅自出兵再加张英的贿赂，但因为是同乡关系打其一百棍，此事平解。在军事会议上孙策开始表彰有功的人，程普黄盖开始演戏被孙策识破，周瑜来到说周泰蒋钦投降孙策，孙策军的势力又壮大了。他和黄盖一起去神亭岭打探消息。
在神亭岭上，太史慈发现了孙策，于是便去活捉他。两个人酣战了三百回合，太史慈因为板伤而退，刘繇的军队也随即而来。刘繇下令杀孙策者黄金千两，孙策发怒，正巧周瑜率军而至。经过苦战才击败了刘繇，并且双方伤亡非常惨重，只能采取和谈的策略。
经过神亭岭一战后，传令兵突然来报：“庐江附近出现了大批黄巾军余党。"周瑜劝孙策庐江是我们的后方，不能失陷，先去讨伐黄巾军吧”孙策说：“我们来一场黄巾的大洗礼。”当黄巾军看到孙策的军队以后立刻溃不成军，大败而逃，邓茂、孙仲、严政不知所向，和孙策单挑的那个黄巾大将也投降了孙策，周瑜也看出了这是试探性单挑，这个人是潘璋，他道出了孙策手里的枪是霸王枪，是当年西楚霸王所用之枪。程普黄盖也道孙策的枪从来没有见过，这把枪似乎带有很强的气。程普说自己纵横沙场几十年，黄盖就说几百年。孙策大喊：“该正经的就得正经”张昭、张纮佩服的五体投地，周泰哭着说这是个好主公。孙策也在想着霸王枪有着什么样的秘密。刘繇通过强行征兵的政策来进攻孙策军，太史慈反对，却没有一点用途。于是便开始守卫丹阳，命周瑜率一半的军队突袭曲阿。
在丹阳的守卫战中，张纮用口才把薛礼骂死。刘繇的部队听到了曲阿被突袭的信息也赶快回师去救，可是这一切已经晚了，胜利的天平已经趋向了孙策的军队。
周瑜用计骗走了守卫曲阿门口的士兵，自己率军猛进了曲阿的城池，陈武投降了孙策军。刘繇军大乱，太史慈又突然来援。过了一段时间，刘繇把自己的守兵杀了支援曲阿。陈横率军从水路救援，黄盖的部队也随即而到。曲阿被攻陷，孙策军的反击又开始了。陈武告诉孙策，曲阿是刘繇的一个本营，他的另一个本营是秣陵，他绝对在那里驻扎。周瑜劝孙策立马攻击秣陵，孙策同意，立刻点兵进攻秣陵。刘繇知道了信息以后，派出了超级无敌头号杀手勇猛无比双子星于糜、樊能来迎战孙策。孙策以锻炼归来的潘璋为先锋，由周瑜先去督战，自己一会便到。但是在战斗中情况不容乐观，太史慈来到，周瑜领军去抵御。潘璋的部队也险些被杀败。就在孙策军无望之时，孙策的突然出现逆转了整个战局，他命令陈武把潘璋救出来，自己去一挑二。陈武阻止无效无奈，只好去实行命令。孙策先一击擒住了于糜，樊能想突袭，反而被孙策大喝一声而死。于糜也没有发出声音，原来是被孙策掐死了。刘繇军的部队无不惊呼：“简直是霸王重生啊！”孙策军的部队也尊称孙策为“小霸王”。并且孙策本人突然获得极强的力量，孙策军士气大振，刘繇军大败，秣陵失陷。
孙策攻陷秣陵后，不给予刘繇喘息的机会，马上给予追击，追击的途中遇到太史慈断后，孙策马上下令撤兵，在泾县再决战。太史慈暗想：绝境真的可以改变一个人。孙策事不宜迟，立马筹备进攻泾县的事宜。但决战前得到了张英写给孙策军的一封信，信中写着缺粮。孙策料到太史慈肯定袭击自军粮库，亲自去诱敌捕捉太史慈。袭粮失败后，刘繇派出了伏兵。周瑜早已料到，反而士气大振。太史慈被孙策抓获，城外的部队损失殆尽，刘繇下令关上城门。过了一会，丁奉来到破坏城门，周瑜惊叹世上居然有如此神力之人。孙策下令进攻，刘繇军背水一战。经过艰苦卓绝的战斗，蒋钦杀了陈横，陈武杀了刘繇，笮融战死，刘繇军宣告灭亡。丁奉告诉孙策泾县城门的秘密、太史慈如孙策所愿投降，并和孙策约定招募自己的士兵一起来投靠，明日正午十二点之前必到。孙策答应，但是众将不信，到了明天正午，太史慈果真来到，从此以后诸将更加佩服孙策。但孙策并没有停息占领江东的脚步，继续开往吴郡，宣战严白虎。而此时此刻北方的局面却是曹操打败中原的诸侯，找到了落魄的汉献帝，迁都许昌，改名许都，自立为大汉丞相，新时代的巨轮已经起航。张英也跑到了严白虎手下当上了首席顾问，太史慈知道这是贿赂，誓要砍死张英。而严白虎的弟弟严舆却在想着和孙策平分江东。
在战斗的过程中，严舆大败孙策，张英纵火逃跑，被追来的太史慈所杀，孙策得到吴郡以后黄盖却是奇怪:如此大的城池居然拱手送给我方，这太奇怪了。“孙策说道：“不要管他，下一站将会非常艰苦。幼平，你别去了，你去宣城把我二弟接回来。”孙策军丝毫不留给他们喘息的机会，开始进军余杭。
在余杭保卫战中，严白虎让严舆当先锋抵御孙策军。严舆不敌，退守后方，严白虎开始抢劫财物并关上城门。孙策追击严舆之时。凌统、凌操两人出现，不管青红皂白两军都开始打。孙策不理，追到严舆后，严舆说：孙将军，我们平分江东如何？孙策说：“要先和我打一架，让你的实力得到我的认同。”严舆大惊，但是还是提刀纵马而上，一合便被孙策斩落马下。孙策说：“这样的实力还敢来和我平分江东，痴人说梦。”严白虎看见了自己弟弟被杀，尽起吴郡之兵开始了最后的挣扎。然而这已经无济于事，孙策军终究攻下了余杭。凌统凌操两人知道这是孙策的部队非常愧疚，随即投降。正当孙策开心之时，守卫宣城的全综噩报传来：周泰和孙权被山贼杀的困在宣城，情况已经非常危急，请少主速速救援。周瑜说出了宣城的情况，孙策无奈，只好回宣城救孙权，停止了追击严白虎的事宜。
在救援宣城的战斗中，经过一番苦战，终于把孙权和周泰救出来了，周泰本人所中十二枪。华佗来到治疗周泰，他惊叹周泰的意志，又说孙策是一个被天下注视的人，让孙策好好干。
过了一段时间，孙策决定进攻会稽城，而此时的严白虎和王朗已经凑合在一块了。在会稽之战中，周泰请求孙策自己宣战。孙策同意，董袭出现杀掉严白虎、太史慈杀掉周听，孙策活捉王朗，用王朗的狗命换来诏书讨伐仇敌刘表。董袭、虞翩投降孙策，孙策从今以后完全称霸江东。两年后，孙策和周瑜游玩山水，找到一户人家，周瑜娶小乔，孙策娶大乔。张昭得到一封信，却被孙策道破意思，张昭连连称赞孙策是明主。而此时的袁术军却是这样一种景象：袁术说自己天才时的悲惨经历，考纪灵和杨弘玉玺的作用。袁术预料他们答不出来，所以就举行了称帝大典，然后命杨弘联络CCTV、TVB、ATV、BBC等中外的大型媒体宣布自己称帝的事宜。袁术称帝的信息被曹操知道了，联合孙策、刘备、吕布讨伐袁术。
寿春之战的时候，曹操、吕布、关羽突然感受到一股很强的气息，原来是孙策军到达。袁术大骂孙策，却被孙策硬生生的骂了回去。结果袁术抵挡不住四支军队的攻击，大败寿春，袁术、纪灵、杨弘全体阵亡，而曹操的目的也完全达到。曹操也称霸中原，和黄河以北的袁绍形成了对峙的状态。
曹操讨伐吕布的时候，孙策执意要去援救，他告诉张昭：是因为我们之间在寿春的约定，也因此救出了吕布，成为了孙策称霸天下的一把好手。
救援完吕布之后，孙策马上开始了突袭许昌迎取汉帝的事宜，却被曹操所知。曹操的军师郭嘉看出了孙策的意图，命曹彰、曹休、曹纯三人为先锋，曹仁为中军、曹洪为后军紧急救援许昌。在孙策猛攻许昌之时，他不知道虎豹骑已经到达了他的面前，因而与虎豹骑战斗，但孙策本人受了重伤不见踪影，孙策军只好撤退，孙家只能在江东另寻他路了。