kegg路径可视化

之前一直在摸索kegg路径的可视化，由于kegg的路径是手绘而非自动生成，所以一直找不到思路。直到今天看到一位大神的回答才突然醒悟。大神的回答网址

大神原回答

再回顾pathview的运算过程，突然醒悟：原来pathview是 首先下载xml文件和png文件，然后利用xml抽提出代谢物和代谢路径的位置信息，然后在png图上进行绘画渲染。
基于这个原理，其实我们可以在matlab上进行更多的操作！！！*
基于该设想，我查看了kegg的路径信息：
如在hsa0110的路径中：

hsa01100路径图

其中反应所使用的图片为poly:

反应路径标志

其中给出了所属的反应信息、poly的四个定点的位置信息。

化合物图片信息

该信息给出了化合物的编号、位置和半径。

【主要思路：我们可以根据这些重要的信息，利用python、r或matlab重新绘制图片，或者原图上通过编程重新进行渲染绘制。】

---

2019-1-28 更新
通过对xml的解析的数据，完全可以根据line和poly的位置信息实现kegg的重新绘制。